More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3071 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_3071  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 303 aa  616  1e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0185768  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3551  transcriptional regulator, LysR family  53.72 
 
 		 301 aa  313  1.9999999999999998e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3583  LysR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 292 aa  310  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.206502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2044  LysR family transcriptional regulator  46.64 
 
 		 292 aa  255  7e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0266448  normal  0.0977576 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4763  LysR family transcriptional regulator  47.9 
 
 		 289 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1196  LysR family transcriptional regulator  47.18 
 
 		 291 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188455  normal  0.473378 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3434  LysR family transcriptional regulator  46.64 
 
 		 292 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.543967  normal  0.141356 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3941  LysR family transcriptional regulator  46.02 
 
 		 292 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5412  transcriptional regulator, LysR family  45.77 
 
 		 297 aa  246  4e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.663662 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0394  transcriptional regulator  43.82 
 
 		 293 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.505096  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2129  LysR family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 293 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.121849  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1858  LysR family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 293 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.039705  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1746  LysR family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 293 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1152  LysR family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 293 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0865  LysR family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 293 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0304  LysR family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 293 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2178  LysR family transcriptional regulator  45.58 
 
 		 293 aa  235  8e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.506627  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5111  transcriptional regulator, LysR family  37.37 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5121  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 299 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0421  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.95 
 
 		 296 aa  169  7e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  36.1 
 
 		 292 aa  168  9e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4944  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 299 aa  168  9e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5071  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 299 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45170  Transcriptional regulator, LysR family  36.39 
 
 		 308 aa  166  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0417  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 298 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784631  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5766  putative transcriptional regulator  36.73 
 
 		 301 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0395  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 299 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1756  LysR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 300 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.497412  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2782  LysR family regulatory protein  36.56 
 
 		 300 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.105762  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2265  LysR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 300 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.503277  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1969  transcriptional regulator, LysR family  34.35 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3053  LysR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 300 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2332  transcriptional regulator, LysR family  34.35 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.194223  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2649  transcriptional regulator  36.56 
 
 		 300 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66490  LysR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 301 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1538  LysR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 300 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.337495  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1256  transcriptional regulator, LysR family  33.56 
 
 		 302 aa  160  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  decreased coverage  0.00967719 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  35.13 
 
 		 301 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  35.13 
 
 		 301 aa  160  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  35.13 
 
 		 301 aa  160  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  35.48 
 
 		 299 aa  159  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  35.13 
 
 		 301 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  35.13 
 
 		 301 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  35.48 
 
 		 299 aa  159  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  35.13 
 
 		 301 aa  159  5e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2282  LysR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 302 aa  159  5e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0266423 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  35.13 
 
 		 301 aa  159  5e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2704  LysR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 300 aa  159  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.995424  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 293 aa  159  8e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01564  predicted DNA-binding transcriptional regulator  35.49 
 
 		 297 aa  158  9e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2048  transcriptional regulator, LysR family  35.49 
 
 		 297 aa  158  9e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1669  LysR family transcriptional regulator  35.49 
 
 		 297 aa  158  9e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01554  hypothetical protein  35.49 
 
 		 297 aa  158  9e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2035  LysR family transcriptional regulator  35.49 
 
 		 297 aa  158  9e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  35.13 
 
 		 302 aa  157  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 296 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1842  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 307 aa  157  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3007  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 305 aa  157  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1802  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2305  transcriptional regulator, LysR family  35.15 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.112257 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 296 aa  156  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2244  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 301 aa  157  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1605  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 297 aa  156  4e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1781  transcriptional regulator, LysR family  35.15 
 
 		 297 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1685  LysR substrate binding domain protein  34.12 
 
 		 299 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.533068  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1852  LysR substrate binding domain-containing protein  34.12 
 
 		 299 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1657  LysR substrate binding domain-containing protein  34.12 
 
 		 299 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1589  LysR substrate binding domain protein  34.12 
 
 		 299 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.103905 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1598  LysR substrate binding domain protein  34.12 
 
 		 299 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2953  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 294 aa  155  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1672  LysR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 295 aa  155  9e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57433  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2043  transcriptional regulator, LysR family  37.75 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637177  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2442  LysR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1832  LysR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1918  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 297 aa  154  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2344  transcriptional regulator, LysR family  37.35 
 
 		 298 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04822  transcription regulator protein  33.56 
 
 		 306 aa  152  5e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05669  transcription regulator protein  33.56 
 
 		 306 aa  152  5e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4411  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 291 aa  152  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0509478  normal  0.98744 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6120  transcriptional regulator, LysR family  33.79 
 
 		 302 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.274534 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17790  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 295 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2134  transcriptional regulator, LysR family  35.52 
 
 		 304 aa  150  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2179  LysR family transcriptional regulator  35 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0544  transcriptional regulator, LysR family  34.58 
 
 		 295 aa  150  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2097  transcriptional regulator, LysR family  34.09 
 
 		 302 aa  149  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1434  transcriptional regulator, LysR family  32.99 
 
 		 308 aa  149  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3249  LysR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 297 aa  149  7e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.332208  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5299  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0530813 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1134  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1870  LysR family substrate binding transcriptional regulator  35.18 
 
 		 304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.102903  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1982  LysR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3379  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 290 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311743  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5916  LysR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2161  LysR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4988  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 290 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2058  transcriptional regulator, LysR family  32.87 
 
 		 299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.90545  hitchhiker  0.00248149 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3793  LysR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3948  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03773  transcriptional regulator LysR family  35.98 
 
 		 295 aa  147  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>