More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4076 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_4076  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
295 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4460  LysR family transcriptional regulator  93.08 
 
 
291 aa  534  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.220159  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3996  LysR family transcriptional regulator  93.08 
 
 
291 aa  534  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5738  LysR family transcriptional regulator  89.62 
 
 
291 aa  521  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0329452  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4567  LysR family transcriptional regulator  89.62 
 
 
291 aa  521  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.17477  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3801  LysR family transcriptional regulator  89.62 
 
 
291 aa  521  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1278  LysR family transcriptional regulator  89.27 
 
 
291 aa  499  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.492603  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0570  LysR family transcriptional regulator  67.94 
 
 
303 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1188  LysR family transcriptional regulator  67.92 
 
 
298 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.275239  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4154  transcriptional regulator, LysR family  68.64 
 
 
299 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6818  transcriptional regulator, LysR family  44.13 
 
 
294 aa  186  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1889  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1486  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 
291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  34.95 
 
 
292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4595  LysR family transcriptional regulator  36.73 
 
 
297 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645659  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6619  transcriptional regulator, LysR family  35.14 
 
 
300 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 
296 aa  147  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2608  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
300 aa  145  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0824  LysR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
295 aa  145  6e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.607099 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
293 aa  145  9e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 
305 aa  142  5e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  31.83 
 
 
302 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1527  LysR family transcriptional regulator  35.36 
 
 
303 aa  139  4.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0350  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 
295 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.334528  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  35.27 
 
 
296 aa  138  8.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0535  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
296 aa  138  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.524385  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1479  LysR family transcriptional regulator  34.98 
 
 
289 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0607  LysR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
296 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.693427  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0640  LysR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
296 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0157  LysR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
296 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1969  transcriptional regulator, LysR family  31.54 
 
 
308 aa  135  8e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2332  transcriptional regulator, LysR family  31.54 
 
 
308 aa  135  8e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.194223  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  31.49 
 
 
299 aa  135  9e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  31.49 
 
 
301 aa  135  9e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  31.49 
 
 
301 aa  135  9e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  31.49 
 
 
301 aa  135  9e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  31.49 
 
 
301 aa  135  9e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  31.49 
 
 
301 aa  135  9e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4202  LysR family transcriptional regulator  34.34 
 
 
295 aa  135  9e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.932359  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  31.49 
 
 
299 aa  135  9e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  31.49 
 
 
301 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2466  LysR family transcriptional regulator  34.24 
 
 
304 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.708031  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03179  transcription regulator protein  32.88 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.379949  normal  0.13271 
 
 
-
 
NC_003296  RS04822  transcription regulator protein  32.67 
 
 
306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05669  transcription regulator protein  32.67 
 
 
306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  31.49 
 
 
301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0068  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 
298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3724  LysR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
300 aa  134  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.282606 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5436  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 
299 aa  132  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5892  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
297 aa  132  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2682  LysR family transcriptional regulator  32.8 
 
 
323 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03773  transcriptional regulator LysR family  38.04 
 
 
295 aa  132  6e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3091  transcriptional regulator, LysR family  35.88 
 
 
304 aa  132  6.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.339744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2461  LysR family transcriptional regulator  34.24 
 
 
328 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1850  LysR family transcriptional regulator  34.24 
 
 
328 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4628  transcriptional regulator, LysR family  34.83 
 
 
292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0890971  normal  0.246233 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46680  Transcriptional regulator, LysR-family  35.55 
 
 
297 aa  131  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4070  LysR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.409277  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2671  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
299 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0656105  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1408  LysR family transcriptional regulator  35.93 
 
 
323 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185298  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1392  LysR family transcriptional regulator  35.93 
 
 
306 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0389535  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1672  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 
295 aa  130  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57433  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1888  LysR family transcriptional regulator  38.11 
 
 
297 aa  130  3e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.282153  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1374  LysR family transcriptional regulator  35.93 
 
 
314 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0445  LysR family transcriptional regulator  34.13 
 
 
295 aa  129  4.0000000000000003e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.294779  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6120  transcriptional regulator, LysR family  36.11 
 
 
302 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.274534 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3534  LysR family transcriptional regulator  31.83 
 
 
302 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45170  Transcriptional regulator, LysR family  34.3 
 
 
308 aa  129  5.0000000000000004e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5792  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 
304 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.316053 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2326  LysR family transcriptional regulator  32.12 
 
 
306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3273  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 
293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.215219 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2243  transcriptional regulator, LysR family  33.1 
 
 
296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2378  LysR family transcriptional regulator  34.35 
 
 
305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2510  LysR family transcriptional regulator  34.35 
 
 
305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0664  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 
295 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0825274 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2097  transcriptional regulator, LysR family  32.64 
 
 
302 aa  127  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2244  LysR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
301 aa  126  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2778  transcriptional regulator, LysR family  33.68 
 
 
302 aa  127  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23055  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4167  LysR substrate-binding protein  33.22 
 
 
295 aa  126  5e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.767565  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4630  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
295 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.133598  hitchhiker  0.000277503 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3722  LysR family transcriptional regulator  30.59 
 
 
307 aa  126  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3509  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 
319 aa  126  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.633276 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2537  LysR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
299 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  32.12 
 
 
302 aa  125  7e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6844  LysR family transcriptional regulator  31.07 
 
 
309 aa  125  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3179  LysR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
299 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49340  LysR family transcriptional regulator protein  34.5 
 
 
312 aa  125  8.000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3424  LysR family transcriptional regulator  32.94 
 
 
296 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2138  transcriptional regulator, LysR family  36.75 
 
 
337 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1134  LysR family transcriptional regulator  32.42 
 
 
294 aa  125  8.000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2212  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 
296 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00538572  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2876  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
310 aa  124  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.692087 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3404  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 
293 aa  125  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.729223  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4453  transcriptional regulator, LysR family  33.9 
 
 
298 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.47384 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4587  transcriptional regulator, LysR family  33.9 
 
 
298 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.781824  normal  0.831534 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0834  LysR, substrate-binding  33.9 
 
 
330 aa  123  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  29.47 
 
 
296 aa  123  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1897  transcriptional regulator, LysR family  28.32 
 
 
304 aa  123  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.202001  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2690  DNA-binding transcriptional regulator HcaR  30.82 
 
 
297 aa  123  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>