More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3273 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3273  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 293 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.215219 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3623  LysR family transcriptional regulator  58.7 
 
 		 299 aa  292  4e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3561  LysR family transcriptional regulator  56.27 
 
 		 297 aa  265  7e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4070  LysR family transcriptional regulator  54.87 
 
 		 297 aa  265  7e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.409277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0055  LysR family transcriptional regulator  50.55 
 
 		 309 aa  243  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4555  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  46.44 
 
 		 299 aa  239  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633228  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2994  LysR family transcriptional regulator  46.79 
 
 		 295 aa  229  4e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0317639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5151  LysR family transcriptional regulator  48.35 
 
 		 302 aa  221  9e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.606064  normal  0.58822 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  42.76 
 
 		 298 aa  182  5.0000000000000004e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4132  LysR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.977393  normal  0.0579117 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1001  LysR family transcriptional regulator  42.69 
 
 		 303 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4596  LysR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 303 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00651674 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3927  LysR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 303 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2244  LysR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 301 aa  171  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0824  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 295 aa  169  5e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.607099 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4749  LysR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 303 aa  168  8e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0228204 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 296 aa  168  8e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3618  LysR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 303 aa  168  8e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  37.93 
 
 		 292 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 296 aa  166  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1479  LysR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 289 aa  166  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5766  putative transcriptional regulator  39.26 
 
 		 301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0767  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  37.19 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4628  transcriptional regulator, LysR family  38.01 
 
 		 292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0890971  normal  0.246233 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1256  transcriptional regulator, LysR family  36.55 
 
 		 302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  decreased coverage  0.00967719 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1930  LysR family transcriptional regulator  38.11 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66490  LysR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1250  transcriptional regulator, LysR family  43.12 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0513927 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2461  LysR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 328 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  32.41 
 
 		 301 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 301 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 301 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  32.41 
 
 		 301 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  32.41 
 
 		 301 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1850  LysR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 328 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  32.41 
 
 		 299 aa  162  6e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  32.41 
 
 		 299 aa  162  6e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1405  LysR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 302 aa  162  8.000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.893483  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  32.07 
 
 		 301 aa  161  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  32.07 
 
 		 301 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2212  LysR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 296 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00538572  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2161  LysR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 299 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0803244  normal  0.636405 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03773  transcriptional regulator LysR family  42.08 
 
 		 295 aa  160  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2466  LysR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 304 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.708031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5534  LysR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 306 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.162022  normal  0.470463 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5436  LysR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 299 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17790  LysR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 295 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6120  transcriptional regulator, LysR family  38.31 
 
 		 302 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.274534 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2120  LysR family transcriptional regulator  41 
 
 		 319 aa  159  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.526762  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 302 aa  159  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 305 aa  159  5e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 305 aa  158  9e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4657  LysR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 316 aa  158  9e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.933923 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0445  LysR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 295 aa  158  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.294779  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2053  LysR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.79519  normal  0.0937075 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2803  LysR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 316 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.765199 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2442  LysR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 299 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0833  LysR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 304 aa  157  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49340  LysR family transcriptional regulator protein  39.26 
 
 		 312 aa  156  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2778  transcriptional regulator, LysR family  37.8 
 
 		 302 aa  156  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23055  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0395  LysR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 299 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1803  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 301 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5121  LysR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 299 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5071  LysR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 299 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5056  LysR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 375 aa  155  6e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0640  LysR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 318 aa  155  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404969  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1842  LysR family transcriptional regulator  42.51 
 
 		 307 aa  155  7e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4944  LysR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 299 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4923  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 299 aa  155  7e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1548  putative transcriptional regulator  40.49 
 
 		 295 aa  155  7e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3750  LysR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 297 aa  155  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101985  normal  0.203083 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0544  transcriptional regulator, LysR family  40 
 
 		 295 aa  155  8e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0417  LysR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 298 aa  155  9e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784631  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5892  LysR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 297 aa  155  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3179  LysR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 299 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0834  LysR, substrate-binding  40.87 
 
 		 330 aa  154  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5792  LysR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 304 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.316053 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3249  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 297 aa  154  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.332208  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4637  LysR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 306 aa  154  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2671  LysR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0656105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1662  transcriptional regulator, LysR family  42.7 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1735  transcriptional regulator, LysR family  42.7 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185137  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2058  transcriptional regulator, LysR family  37.29 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.90545  hitchhiker  0.00248149 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2097  transcriptional regulator, LysR family  41.7 
 
 		 302 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2072  LysR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 300 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2554  transcriptional regulator, LysR family  41.67 
 
 		 309 aa  152  4e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0664958  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3722  LysR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 307 aa  153  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 323 aa  152  5e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2510  LysR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 305 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2378  LysR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 305 aa  152  7e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2198  LysR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 300 aa  152  8e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44500  Transcriptinal regulator, LysR family  36.14 
 
 		 301 aa  151  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.581761  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04822  transcription regulator protein  41.3 
 
 		 306 aa  150  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05669  transcription regulator protein  41.3 
 
 		 306 aa  150  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3799  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  37.97 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621197 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5470  LysR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000367157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2215  transcriptional regulator, LysR family  38.89 
 
 		 314 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3313  LysR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 300 aa  150  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3117  transcriptional regulator, LysR family  38.67 
 
 		 306 aa  150  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>