More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4596 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4596  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 303 aa  592  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00651674 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4132  LysR family transcriptional regulator  98.02 
 
 		 303 aa  580  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.977393  normal  0.0579117 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4749  LysR family transcriptional regulator  92.08 
 
 		 303 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0228204 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3618  LysR family transcriptional regulator  92.08 
 
 		 303 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3927  LysR family transcriptional regulator  91.42 
 
 		 303 aa  521  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1001  LysR family transcriptional regulator  92.08 
 
 		 303 aa  521  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5534  LysR family transcriptional regulator  90.85 
 
 		 306 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.162022  normal  0.470463 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1405  LysR family transcriptional regulator  62.59 
 
 		 302 aa  360  2e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.893483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0767  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  59.52 
 
 		 306 aa  345  7e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40910  LysR family transcriptional regulatory protein  61.59 
 
 		 301 aa  324  9e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3471  LysR family transcriptional regulator  61.51 
 
 		 305 aa  318  7e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0055  LysR family transcriptional regulator  43.8 
 
 		 309 aa  211  9e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2740  LysR family transcriptional regulator  44.2 
 
 		 297 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.379655 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2778  transcriptional regulator, LysR family  43.1 
 
 		 302 aa  208  7e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23055  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  41.44 
 
 		 292 aa  208  9e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 323 aa  206  3e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2994  LysR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 295 aa  202  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0317639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3623  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 299 aa  202  8e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3561  LysR family transcriptional regulator  49.59 
 
 		 297 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5151  LysR family transcriptional regulator  40.64 
 
 		 302 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.606064  normal  0.58822 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4070  LysR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.409277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0544  transcriptional regulator, LysR family  47.12 
 
 		 295 aa  196  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1527  LysR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 303 aa  196  4.0000000000000005e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 305 aa  196  5.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  37.68 
 
 		 299 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  37.68 
 
 		 299 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4555  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  41.97 
 
 		 299 aa  195  9e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633228  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0068  LysR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 298 aa  195  9e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  36.96 
 
 		 301 aa  193  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1256  transcriptional regulator, LysR family  40.27 
 
 		 302 aa  193  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  decreased coverage  0.00967719 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  36.96 
 
 		 301 aa  193  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 301 aa  193  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 301 aa  193  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  36.96 
 
 		 301 aa  193  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  36.96 
 
 		 301 aa  193  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  36.96 
 
 		 301 aa  192  5e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 305 aa  192  5e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 302 aa  191  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2671  LysR family transcriptional regulator  44.36 
 
 		 299 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0656105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17790  LysR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 295 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3179  LysR family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 299 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  42.61 
 
 		 298 aa  189  5e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1842  LysR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 307 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1548  putative transcriptional regulator  41.89 
 
 		 295 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2537  LysR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 299 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1479  LysR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 289 aa  183  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 293 aa  183  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0824  LysR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 295 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.607099 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3007  LysR family transcriptional regulator  39 
 
 		 308 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2161  LysR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 308 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5916  LysR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 308 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5470  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 300 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000367157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 296 aa  181  1e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2179  LysR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 300 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4970  transcriptional regulator, LysR family  44.9 
 
 		 298 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.126085  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2244  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66490  LysR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 301 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1110  LysR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 300 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1434  transcriptional regulator, LysR family  40.91 
 
 		 308 aa  180  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0833  transcriptional regulator, LysR family  38.23 
 
 		 294 aa  180  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5585  LysR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 298 aa  179  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2198  LysR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 300 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1543  transcriptional regulator, LysR family  39.69 
 
 		 298 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114968 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2803  LysR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 316 aa  178  9e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.765199 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1888  LysR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 297 aa  177  1e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.282153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2704  LysR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.995424  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1756  LysR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.497412  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1538  LysR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.337495  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3273  LysR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.215219 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2265  LysR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.503277  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2682  LysR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 323 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5766  putative transcriptional regulator  38.62 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3053  LysR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2782  LysR family regulatory protein  39.62 
 
 		 300 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.105762  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3750  LysR family transcriptional regulator  43.58 
 
 		 297 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101985  normal  0.203083 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2072  LysR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 300 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1384  LysR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 303 aa  176  5e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.510026  normal  0.961764 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1366  LysR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 303 aa  176  5e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2649  transcriptional regulator  39.25 
 
 		 300 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2243  transcriptional regulator, LysR family  39.46 
 
 		 296 aa  175  6e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2466  LysR family transcriptional regulator  41.02 
 
 		 304 aa  175  7e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.708031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2461  LysR family transcriptional regulator  41.02 
 
 		 328 aa  175  8e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1850  LysR family transcriptional regulator  41.02 
 
 		 328 aa  175  8e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2097  transcriptional regulator, LysR family  40.98 
 
 		 302 aa  175  9e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2536  LysR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 297 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00700314  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68920  LysR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4411  LysR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 291 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0509478  normal  0.98744 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0640  LysR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 318 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404969  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1388  LysR family transcriptional regulator  37.87 
 
 		 310 aa  172  5e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.813724 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5674  transcriptional regulator, LysR family  36.84 
 
 		 294 aa  172  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.949814  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1027  LysR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 299 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174873 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0664  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 295 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0825274 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2161  LysR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 299 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0803244  normal  0.636405 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2312  LysR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 302 aa  172  9e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.015479  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2411  transcription regulator protein  41.85 
 
 		 311 aa  171  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3799  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.84 
 
 		 300 aa  171  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621197 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3534  LysR family transcriptional regulator  37.64 
 
 		 302 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5792  LysR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 304 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.316053 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>