More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0570 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0570  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 303 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4154  transcriptional regulator, LysR family  91.97 
 
 		 299 aa  525  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5738  LysR family transcriptional regulator  68.86 
 
 		 291 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0329452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3801  LysR family transcriptional regulator  68.86 
 
 		 291 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3996  LysR family transcriptional regulator  68.86 
 
 		 291 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4460  LysR family transcriptional regulator  68.86 
 
 		 291 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.220159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4567  LysR family transcriptional regulator  68.86 
 
 		 291 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.17477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4076  LysR family transcriptional regulator  67.94 
 
 		 295 aa  385  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1188  LysR family transcriptional regulator  68.86 
 
 		 298 aa  384  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.275239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1278  LysR family transcriptional regulator  67.59 
 
 		 291 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.492603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6818  transcriptional regulator, LysR family  42.59 
 
 		 294 aa  197  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1889  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 291 aa  193  3e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1486  LysR family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 293 aa  162  9e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  34.95 
 
 		 292 aa  156  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 305 aa  156  4e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 296 aa  155  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  32.76 
 
 		 301 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 301 aa  155  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 301 aa  155  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  32.76 
 
 		 301 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  32.76 
 
 		 301 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  32.76 
 
 		 299 aa  154  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  32.76 
 
 		 299 aa  154  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 302 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  32.42 
 
 		 301 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  32.42 
 
 		 301 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 305 aa  152  8.999999999999999e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 296 aa  150  3e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1479  LysR family transcriptional regulator  34.49 
 
 		 289 aa  149  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2537  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 299 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2671  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 299 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0656105  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03179  transcription regulator protein  33.33 
 
 		 310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.379949  normal  0.13271 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1888  LysR family transcriptional regulator  39.75 
 
 		 297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.282153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2682  LysR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0350  LysR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 295 aa  147  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.334528  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3091  transcriptional regulator, LysR family  37.8 
 
 		 304 aa  147  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.339744  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5436  LysR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 299 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0824  LysR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 295 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.607099 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3724  LysR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 300 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.282606 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0607  LysR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.693427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2097  transcriptional regulator, LysR family  35.54 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2173  transcriptional regulator, LysR family  31.31 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4595  LysR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 297 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5892  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 297 aa  143  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0186  transcriptional regulator, LysR family  34.23 
 
 		 302 aa  143  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.925738  normal  0.858916 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0157  LysR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 296 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0640  LysR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 296 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3179  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 299 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46680  Transcriptional regulator, LysR-family  37.36 
 
 		 297 aa  142  6e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3273  LysR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.215219 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4070  LysR family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 297 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.409277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2244  LysR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 301 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0068  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 298 aa  139  6e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1672  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 295 aa  138  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2332  transcriptional regulator, LysR family  31.54 
 
 		 308 aa  136  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.194223  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1969  transcriptional regulator, LysR family  31.54 
 
 		 308 aa  136  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3799  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.54 
 
 		 300 aa  136  5e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621197 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6120  transcriptional regulator, LysR family  36.9 
 
 		 302 aa  136  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.274534 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45170  Transcriptional regulator, LysR family  34.42 
 
 		 308 aa  136  5e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0833  transcriptional regulator, LysR family  32.53 
 
 		 294 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2212  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 296 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00538572  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4594  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 325 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1134  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3117  transcriptional regulator, LysR family  31.51 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5843  LysR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271378 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2466  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 304 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.708031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0767  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.15 
 
 		 306 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3895  LysR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.958573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1850  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 328 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2461  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 328 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  32.99 
 
 		 298 aa  132  6e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0553  transcriptional regulator, LysR family  36.33 
 
 		 293 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  33.23 
 
 		 323 aa  132  6e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0184  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 323 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5299  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0530813 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1735  transcriptional regulator, LysR family  36.67 
 
 		 296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185137  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5792  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 304 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.316053 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4202  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 295 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.932359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0664  LysR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0825274 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3561  LysR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0417  LysR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784631  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6844  LysR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 309 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3623  LysR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 299 aa  131  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5111  transcriptional regulator, LysR family  34.15 
 
 		 297 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0989  transcriptional regulator, LysR family  31.11 
 
 		 321 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1662  transcriptional regulator, LysR family  36.3 
 
 		 296 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3379  LysR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 290 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311743  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17790  LysR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 295 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4988  LysR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 290 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1527  LysR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 303 aa  129  7.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3948  LysR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 291 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0421  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.03 
 
 		 296 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4411  LysR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 291 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0509478  normal  0.98744 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1548  putative transcriptional regulator  34.21 
 
 		 295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3633  LysR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4596  LysR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00651674 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5585  LysR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3676  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0866147  normal  0.208358 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  32.53 
 
 		 302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>