More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1486 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1486  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 291 aa  564  1e-160  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1889  LysR family transcriptional regulator  50.89 
 
 		 291 aa  270  2.9999999999999997e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4460  LysR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 291 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.220159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3996  LysR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 291 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4076  LysR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 295 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5738  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 291 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0329452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4567  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 291 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.17477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3801  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 291 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1278  LysR family transcriptional regulator  41.32 
 
 		 291 aa  192  7e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.492603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6818  transcriptional regulator, LysR family  44.35 
 
 		 294 aa  190  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0570  LysR family transcriptional regulator  41.32 
 
 		 303 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4154  transcriptional regulator, LysR family  42.01 
 
 		 299 aa  177  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1188  LysR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.275239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3722  LysR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 307 aa  152  8e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 305 aa  151  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0607  LysR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 296 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.693427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0640  LysR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 296 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0157  LysR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 296 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04822  transcription regulator protein  34.47 
 
 		 306 aa  144  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05669  transcription regulator protein  34.47 
 
 		 306 aa  144  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46680  Transcriptional regulator, LysR-family  36.5 
 
 		 297 aa  145  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  34.71 
 
 		 292 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5892  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 297 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0350  LysR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 295 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.334528  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2043  transcriptional regulator, LysR family  34.49 
 
 		 298 aa  138  7.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637177  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0578  LysR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 298 aa  138  7.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3724  LysR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 300 aa  137  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.282606 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2134  transcriptional regulator, LysR family  34.22 
 
 		 304 aa  137  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2466  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 304 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.708031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2344  transcriptional regulator, LysR family  34.15 
 
 		 298 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0833  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 304 aa  135  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0833  transcriptional regulator, LysR family  33.11 
 
 		 294 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 296 aa  134  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3623  LysR family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 299 aa  134  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3273  LysR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 293 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.215219 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1775  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.310759  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2803  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.765199 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1850  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2461  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2244  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5792  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 304 aa  133  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.316053 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1897  transcriptional regulator, LysR family  32.7 
 
 		 304 aa  133  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.202001  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1888  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 297 aa  132  6.999999999999999e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.282153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6486  LysR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 301 aa  132  9e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.898531  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  30.82 
 
 		 301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  30.82 
 
 		 301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  30.82 
 
 		 301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7097  transcriptional regulator, LysR family  31.93 
 
 		 296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.785925  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2282  LysR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 302 aa  131  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0266423 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  30.82 
 
 		 301 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5436  LysR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  30.56 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  30.56 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3117  transcriptional regulator, LysR family  32.53 
 
 		 306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0055  LysR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 309 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0036  transcriptional regulator, LysR family  31.58 
 
 		 306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  30.82 
 
 		 301 aa  130  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2536  LysR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 297 aa  130  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00700314  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1028  isoleucine biosynthesis transcriptional activator IlvR  33 
 
 		 331 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1589  LysR substrate binding domain protein  31.53 
 
 		 299 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.103905 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4555  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.77 
 
 		 299 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633228  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4425  LysR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 302 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.488055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1657  LysR substrate binding domain-containing protein  31.53 
 
 		 299 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1852  LysR substrate binding domain-containing protein  31.53 
 
 		 299 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1685  LysR substrate binding domain protein  31.53 
 
 		 299 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.533068  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1598  LysR substrate binding domain protein  31.53 
 
 		 299 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  29.97 
 
 		 298 aa  129  8.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2378  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 305 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4657  LysR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 316 aa  129  8.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.933923 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2510  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 305 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1181  isoleucine biosynthesis transcriptional activator  33 
 
 		 331 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01564  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.66 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2048  transcriptional regulator, LysR family  30.66 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1021  isoleucine biosynthesis transcriptional activator IlvR  32.68 
 
 		 337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.127351  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1669  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0828  isoleucine biosynthesis transcriptional activator  33.33 
 
 		 320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.767447  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01554  hypothetical protein  30.66 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0352  transcriptional regulator, LysR family  34.62 
 
 		 294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2035  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1802  LysR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1605  LysR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2305  transcriptional regulator, LysR family  29.82 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.112257 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3962  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0195836  normal  0.175267 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1424  transcriptional regulator, LysR family  35.32 
 
 		 303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.442699 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5151  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.606064  normal  0.58822 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0963  LysR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 294 aa  127  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2713  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  29.75 
 
 		 299 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45170  Transcriptional regulator, LysR family  36.05 
 
 		 308 aa  126  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4537  LysR family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 302 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309073  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4070  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.409277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08550  Transcriptional regulator, LysR family  34.51 
 
 		 307 aa  126  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.763554  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3831  LysR family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 302 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 305 aa  126  5e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0186  transcriptional regulator, LysR family  34.83 
 
 		 302 aa  125  6e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.925738  normal  0.858916 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2215  transcriptional regulator, LysR family  33.12 
 
 		 314 aa  125  6e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>