More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0756 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0756  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 302 aa  598  1e-170  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.109353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6051  transcriptional regulator, LysR family  51.03 
 
 		 327 aa  271  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6373  Transcriptional regulator-like protein  46.78 
 
 		 297 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2453  LysR family transcriptional regulator  47.67 
 
 		 305 aa  226  5.0000000000000005e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452417  normal  0.317953 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2571  transcriptional regulator, LysR family  45.82 
 
 		 303 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000871152  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3007  LysR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 306 aa  209  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3697  LysR family transcriptional regulator  40.47 
 
 		 299 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.95243  normal  0.109394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0846  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 301 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2880  transcriptional regulator, LysR family  38.05 
 
 		 297 aa  175  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.487858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0861  LysR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 300 aa  172  7.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2583  transcriptional regulator, LysR family  35.99 
 
 		 308 aa  169  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.235107  normal  0.220983 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1674  transcriptional regulator, LysR family  40.07 
 
 		 297 aa  168  9e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1770  transcriptional regulator, LysR family  37.54 
 
 		 270 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20350  transcriptional regulator  38.95 
 
 		 308 aa  147  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0757406  normal  0.387603 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7477  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 322 aa  132  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.286037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2719  transcriptional regulator, LysR family  36.73 
 
 		 308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0845859  normal  0.202883 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4229  transcriptional regulator, LysR family  35.29 
 
 		 305 aa  130  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2265  transcriptional regulator, LysR family  35.08 
 
 		 321 aa  129  9.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2980  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 299 aa  127  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.932772 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 305 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5031  transcriptional regulator, LysR family  32.44 
 
 		 289 aa  116  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1296  transcriptional regulator, LysR family  33.55 
 
 		 312 aa  115  6e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.502339  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  29.49 
 
 		 299 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  29.49 
 
 		 299 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1842  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  29.15 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  29.15 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  29.15 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  29.15 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  29.15 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 302 aa  112  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1356  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 329 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.79958  normal  0.0413241 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3307  transcriptional regulator, LysR family  34.58 
 
 		 300 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0535  LysR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 296 aa  106  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.524385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 296 aa  106  6e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5674  transcriptional regulator, LysR family  30.95 
 
 		 294 aa  105  9e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.949814  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  28.47 
 
 		 292 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1888  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.282153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3799  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  29.19 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621197 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2826  DNA-binding transcriptional activator XapR  33.84 
 
 		 297 aa  103  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1918  LysR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 297 aa  102  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5765  transcriptional regulator, LysR family  33.67 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.119933  normal  0.0701766 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0657  transcriptional regulator, LysR family  32.29 
 
 		 305 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2913  DNA-binding transcriptional activator XapR  33.33 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0834  LysR, substrate-binding  30.5 
 
 		 330 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3313  LysR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1196  LysR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 291 aa  99.4  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188455  normal  0.473378 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2442  LysR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 299 aa  98.6  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5436  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 299 aa  98.2  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0066  transcriptional regulator, LysR family  31.47 
 
 		 303 aa  98.6  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1366  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 303 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4167  LysR substrate-binding protein  34.67 
 
 		 295 aa  99  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.767565  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1384  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 303 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.510026  normal  0.961764 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2138  transcriptional regulator, LysR family  38.3 
 
 		 337 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3750  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 297 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101985  normal  0.203083 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2400  LysR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 296 aa  98.2  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000468465  hitchhiker  0.00000339516 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1374  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 314 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1400  LysR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 303 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1392  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 306 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0389535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18090  transcriptional regulator, LysR family  36.84 
 
 		 319 aa  96.7  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.502124  normal  0.864979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0746  transcriptional regulator, LysR family  33.05 
 
 		 298 aa  96.3  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.265691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3529  LysR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 299 aa  96.7  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.741174 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1408  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 323 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1618  LysR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 311 aa  96.3  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.340872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1598  LysR substrate binding domain protein  31.12 
 
 		 299 aa  95.9  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1852  LysR substrate binding domain-containing protein  31.12 
 
 		 299 aa  95.9  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1657  LysR substrate binding domain-containing protein  31.12 
 
 		 299 aa  95.9  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1685  LysR substrate binding domain protein  31.12 
 
 		 299 aa  95.9  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.533068  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1589  LysR substrate binding domain protein  31.12 
 
 		 299 aa  95.9  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.103905 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3010  LysR family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 309 aa  95.1  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.450342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7143  transcriptional regulator, LysR family  30.71 
 
 		 295 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.297032  normal  0.653171 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3900  transcriptional regulator, LysR family  31.79 
 
 		 291 aa  94.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3618  LysR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 303 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4749  LysR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 303 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0228204 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1781  transcriptional regulator, LysR family  32.06 
 
 		 297 aa  94.4  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0331  transcriptional regulator, LysR family  30.8 
 
 		 306 aa  93.6  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.172645  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2064  transcriptional regulator, LysR family  30.8 
 
 		 306 aa  93.6  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.053811  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3462  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 296 aa  93.6  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3718  LysR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 308 aa  93.6  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2932  DNA-binding transcriptional activator XapR  31.49 
 
 		 294 aa  93.2  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000456471  normal  0.0988351 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4923  LysR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 299 aa  93.2  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2097  transcriptional regulator, LysR family  31.35 
 
 		 302 aa  92.8  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0639  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 296 aa  92.8  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1930  LysR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 306 aa  92.8  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4879  transcriptional regulator, LysR family  34.47 
 
 		 298 aa  92.8  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5766  putative transcriptional regulator  36.87 
 
 		 301 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1672  LysR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 295 aa  92.4  8e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1605  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 297 aa  92.4  8e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5534  LysR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 306 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.162022  normal  0.470463 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2305  transcriptional regulator, LysR family  31.58 
 
 		 297 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.112257 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4639  LysR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 309 aa  92  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.356154  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2243  transcriptional regulator, LysR family  30.41 
 
 		 296 aa  92  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2897  transcriptional regulator, LysR family  30.3 
 
 		 298 aa  92  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00606116  hitchhiker  0.00007682 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2244  LysR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 301 aa  91.7  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66490  LysR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 301 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4518  LysR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 302 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1802  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 297 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6221  transcriptional regulator, LysR family  31.83 
 
 		 282 aa  90.9  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>