More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2932 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_2932  DNA-binding transcriptional activator XapR  100 
 
 
294 aa  597  1e-170  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000456471  normal  0.0988351 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2784  DNA-binding transcriptional activator XapR  79.25 
 
 
294 aa  487  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00240936  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2654  DNA-binding transcriptional activator XapR  79.25 
 
 
294 aa  487  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00016667  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2678  DNA-binding transcriptional activator XapR  79.59 
 
 
294 aa  488  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0441451  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2612  DNA-binding transcriptional activator XapR  79.25 
 
 
294 aa  488  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0177144  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2563  DNA-binding transcriptional activator XapR  78.91 
 
 
294 aa  485  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000012261  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1258  transcriptional regulator, LysR family  74.32 
 
 
294 aa  461  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000639687  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2558  DNA-binding transcriptional activator XapR  75.62 
 
 
294 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000632847  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4256  DNA-binding transcriptional activator XapR  43.32 
 
 
290 aa  228  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00318562 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2826  DNA-binding transcriptional activator XapR  37.15 
 
 
297 aa  205  7e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2913  DNA-binding transcriptional activator XapR  37.15 
 
 
297 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3612  LysR family transcriptional regulator  41.86 
 
 
296 aa  192  5e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.395284  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30850  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 
302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7143  transcriptional regulator, LysR family  41.09 
 
 
295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.297032  normal  0.653171 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  35.89 
 
 
296 aa  183  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0639  LysR family transcriptional regulator  40.67 
 
 
296 aa  182  6e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1930  LysR family transcriptional regulator  36.88 
 
 
306 aa  178  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1479  LysR family transcriptional regulator  39.92 
 
 
289 aa  177  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3424  LysR family transcriptional regulator  36.24 
 
 
296 aa  176  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  36.02 
 
 
293 aa  175  6e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3076  LysR family transcriptional regulator  34.98 
 
 
305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0833  transcriptional regulator, LysR family  37.59 
 
 
294 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1434  transcriptional regulator, LysR family  36.81 
 
 
308 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0068  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 
298 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001955  putative LysR-family regulatory protein  33.45 
 
 
301 aa  171  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4637  LysR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
306 aa  171  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1996  HTH-type transcriptional regulator XapR  35.15 
 
 
309 aa  171  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.376345  hitchhiker  0.00000153668 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3085  LysR family transcriptional regulator  34.28 
 
 
305 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3007  LysR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
308 aa  170  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17790  LysR family transcriptional regulator  41.7 
 
 
295 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2097  transcriptional regulator, LysR family  36.71 
 
 
302 aa  169  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1543  transcriptional regulator, LysR family  37.84 
 
 
298 aa  169  6e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.114968 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1384  LysR family transcriptional regulator  35.99 
 
 
303 aa  168  8e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.510026  normal  0.961764 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1366  LysR family transcriptional regulator  35.99 
 
 
303 aa  168  8e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3799  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.81 
 
 
300 aa  167  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00621197 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3793  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
304 aa  167  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4070  LysR family transcriptional regulator  37.36 
 
 
297 aa  168  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.409277  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1291  transcriptional regulator, LysR family  34.63 
 
 
305 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.64922 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1346  LysR family transcriptional regulator  37.28 
 
 
294 aa  167  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.638115  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  33.33 
 
 
301 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
301 aa  166  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
301 aa  166  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  33.33 
 
 
301 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  33.33 
 
 
301 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  33.33 
 
 
301 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  33.33 
 
 
301 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1842  LysR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
307 aa  165  6.9999999999999995e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330776  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 
299 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
302 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 
299 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45170  Transcriptional regulator, LysR family  37.02 
 
 
308 aa  164  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  36.01 
 
 
298 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3228  LysR family transcriptional regulator  33.92 
 
 
305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1548  putative transcriptional regulator  40.32 
 
 
295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1134  LysR family transcriptional regulator  34.72 
 
 
294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1735  transcriptional regulator, LysR family  39.02 
 
 
296 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185137  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2072  LysR family transcriptional regulator  38.31 
 
 
300 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5436  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
299 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2442  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 
299 aa  162  5.0000000000000005e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383889  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  33.69 
 
 
305 aa  162  6e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1662  transcriptional regulator, LysR family  39.02 
 
 
296 aa  162  6e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5892  LysR family transcriptional regulator  35.31 
 
 
297 aa  162  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3053  LysR family transcriptional regulator  39.77 
 
 
300 aa  162  7e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1756  LysR family transcriptional regulator  39.77 
 
 
300 aa  162  7e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.497412  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2704  LysR family transcriptional regulator  39.77 
 
 
300 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.995424  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2782  LysR family regulatory protein  39.77 
 
 
300 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.105762  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1538  LysR family transcriptional regulator  39.77 
 
 
300 aa  162  7e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.337495  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2265  LysR family transcriptional regulator  39.77 
 
 
300 aa  162  7e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.503277  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5470  LysR family transcriptional regulator  38.31 
 
 
300 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000367157  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3313  LysR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
300 aa  162  9e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44500  Transcriptinal regulator, LysR family  32.75 
 
 
301 aa  162  9e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.581761  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2179  LysR family transcriptional regulator  38.31 
 
 
300 aa  162  9e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5916  LysR family transcriptional regulator  38.31 
 
 
308 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  37.26 
 
 
323 aa  161  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2161  LysR family transcriptional regulator  38.31 
 
 
308 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2649  transcriptional regulator  39.77 
 
 
300 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1400  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
303 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  32.75 
 
 
292 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1719  LysR family transcriptional regulator  32.87 
 
 
325 aa  160  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.553027  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3561  LysR family transcriptional regulator  38.2 
 
 
297 aa  159  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0824  LysR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
295 aa  159  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.607099 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2053  LysR family transcriptional regulator  36.64 
 
 
323 aa  159  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.79519  normal  0.0937075 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  35.98 
 
 
296 aa  159  5e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04822  transcription regulator protein  37.45 
 
 
306 aa  159  7e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05669  transcription regulator protein  37.45 
 
 
306 aa  159  7e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3013  LysR family transcriptional regulator  35.76 
 
 
293 aa  158  8e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
296 aa  158  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1527  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 
303 aa  158  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2198  LysR family transcriptional regulator  37.55 
 
 
300 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1685  LysR substrate binding domain protein  35.27 
 
 
299 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.533068  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5299  LysR family transcriptional regulator  36.54 
 
 
290 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0530813 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3117  transcriptional regulator, LysR family  35.07 
 
 
306 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1598  LysR substrate binding domain protein  35.27 
 
 
299 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1657  LysR substrate binding domain-containing protein  35.27 
 
 
299 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1888  LysR family transcriptional regulator  34.49 
 
 
297 aa  157  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.282153  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1852  LysR substrate binding domain-containing protein  35.27 
 
 
299 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1589  LysR substrate binding domain protein  35.27 
 
 
299 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.103905 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1832  LysR family transcriptional regulator  39.77 
 
 
300 aa  157  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4988  LysR family transcriptional regulator  36.54 
 
 
290 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1110  LysR family transcriptional regulator  36.78 
 
 
300 aa  157  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138088  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>