More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1774 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1774  transcriptional regulator CysB-like protein  100 
 
 		 309 aa  637    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1236  transcriptional regulator CysB-like protein  84.79 
 
 		 309 aa  567  1e-161  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0650048  normal  0.906995 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1155  transcriptional regulator CysB-like protein  85.71 
 
 		 309 aa  570  1e-161  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000427804  normal  0.581865 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0621  transcriptional regulator CysB-like protein  46.46 
 
 		 309 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1739  transcriptional regulator CysB-like protein  46.74 
 
 		 314 aa  267  1e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000279611  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2129  transcriptional regulator CysB-like protein  46.92 
 
 		 311 aa  263  4e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.74673e-16  decreased coverage  0.00000124662 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0963  LysR family transcriptional regulator  45.3 
 
 		 308 aa  258  9e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.377381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2818  transcriptional regulator CysB-like protein  44.14 
 
 		 313 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3810  LysR family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 312 aa  249  6e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.251082 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1625  transcriptional regulator CysB-like protein  43.05 
 
 		 308 aa  248  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.879627  normal  0.658708 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1145  transcriptional regulator CysB-like protein  43.79 
 
 		 308 aa  247  1e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.207377  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2698  transcriptional regulator CysB-like protein  43.79 
 
 		 313 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0341  transcriptional regulator CysB  44.83 
 
 		 333 aa  247  2e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.136754  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5610  LysR family transcriptional regulator  42.81 
 
 		 354 aa  247  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519955 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1379  transcriptional regulator CysB-like protein  42.57 
 
 		 316 aa  246  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1777  transcriptional regulator CysB-like protein  42.42 
 
 		 308 aa  246  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.16529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1521  transcriptional regulator CysB-like protein  41.75 
 
 		 308 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2466  transcriptional regulator CysB-like protein  42.42 
 
 		 308 aa  246  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1501  transcriptional regulator CysB-like protein  41.75 
 
 		 308 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33535  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1792  transcriptional regulator CysB-like protein  43.58 
 
 		 317 aa  246  4e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1967  transcriptional regulator CysB-like protein  43.24 
 
 		 315 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1287  transcriptional regulator CysB-like protein  42.91 
 
 		 319 aa  245  6e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.767639  normal  0.313196 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1224  transcriptional regulator CysB-like protein  42.91 
 
 		 319 aa  245  6.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.178615  normal  0.191747 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4743  transcriptional regulator CysB-like protein  42.07 
 
 		 308 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.217696  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2476  transcriptional regulator CysB-like protein  41.55 
 
 		 308 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1632  transcriptional regulator CysB-like protein  42.07 
 
 		 308 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1348  transcriptional regulator CysB-like protein  42.57 
 
 		 327 aa  243  3e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5807  transcriptional regulator CysB-like protein  43.79 
 
 		 313 aa  243  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0834641 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1394  transcriptional regulator CysB-like protein  42.57 
 
 		 317 aa  243  3e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2393  transcriptional regulator CysB-like protein  43.79 
 
 		 313 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2525  transcriptional regulator CysB-like protein  43.79 
 
 		 313 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1582  transcriptional regulator CysB-like protein  42.07 
 
 		 308 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.610687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1605  transcriptional regulator CysB-like protein  42.07 
 
 		 308 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339549  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1669  transcriptional regulator CysB-like protein  41.69 
 
 		 312 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0453898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0818  transcriptional regulator CysB-like protein  43.45 
 
 		 313 aa  242  6e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1125  transcriptional regulator CysB-like protein  41.72 
 
 		 308 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2428  transcriptional regulator CysB  43.6 
 
 		 323 aa  241  1e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0127  LysR family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 311 aa  240  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.191807  hitchhiker  0.00233416 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1851  transcriptional regulator CysB-like protein  40.74 
 
 		 308 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1205  transcriptional regulator CysB-like protein  40.74 
 
 		 308 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.215298  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2831  transcriptional regulator Cbl  40.88 
 
 		 316 aa  240  2e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000101541  normal  0.682702 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2018  transcriptional regulator CysB-like protein  40.74 
 
 		 308 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.962244  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1865  transcriptional regulator CysB-like protein  40.74 
 
 		 308 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0350  transcriptional regulator CysB-like protein  40.74 
 
 		 308 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0871745  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1697  transcriptional regulator CysB  43.45 
 
 		 326 aa  240  2e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828749 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1694  transcriptional regulator CysB-like protein  40.74 
 
 		 308 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.272702  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0810  transcriptional regulator CysB-like protein  40.74 
 
 		 308 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.259681  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2481  transcriptional regulator CysB-like protein  43.45 
 
 		 313 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2476  transcriptional regulator CysB-like protein  43.45 
 
 		 313 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14516  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1658  transcriptional regulator Cbl  41.22 
 
 		 316 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000765107  normal  0.0208007 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1865  transcriptional regulator CysB-like protein  43.45 
 
 		 313 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0813  transcriptional regulator CysB-like protein  43.45 
 
 		 313 aa  239  4e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01897  DNA-binding transcriptional activator of cysteine biosynthesis  41.22 
 
 		 316 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000685239  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1668  transcriptional regulator, LysR family  41.22 
 
 		 316 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000112362  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01886  hypothetical protein  41.22 
 
 		 316 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000554591  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2427  transcriptional regulator CysB-like protein  43.45 
 
 		 313 aa  238  6.999999999999999e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2269  transcriptional regulator Cbl  41.22 
 
 		 316 aa  238  6.999999999999999e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000889139  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2292  transcriptional regulator CysB-like protein  42.23 
 
 		 306 aa  238  8e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.524252  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1137  transcriptional regulator Cbl  41.22 
 
 		 316 aa  238  8e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000142733  hitchhiker  0.0000552963 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2917  transcriptional regulator CysB-like protein  40.88 
 
 		 317 aa  237  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1005  transcriptional regulator CysB-like protein  43.1 
 
 		 313 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0662  transcriptional regulator CysB-like protein  43.1 
 
 		 313 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.631688  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2349  transcriptional regulator CysB-like protein  43.1 
 
 		 313 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1165  transcriptional regulator CysB-like protein  43.1 
 
 		 313 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2936  transcriptional regulator CysB-like protein  43.1 
 
 		 313 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1012  transcriptional regulator CysB-like protein  43.1 
 
 		 313 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1663  transcriptional regulator CysB-like protein  43.1 
 
 		 313 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0971  transcriptional regulator Cbl  41.22 
 
 		 316 aa  236  3e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000168411  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2110  transcriptional regulator Cbl  41.22 
 
 		 316 aa  236  4e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.3178700000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4926  transcriptional regulator CysB-like protein  42.91 
 
 		 313 aa  235  7e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.74642 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2231  transcriptional regulator CysB-like protein  43.1 
 
 		 313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2599  transcriptional regulator CysB-like protein  42.67 
 
 		 321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.174943 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2705  transcriptional regulator CysB-like protein  43.24 
 
 		 317 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2404  transcriptional regulator CysB-like protein  42.91 
 
 		 314 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.044463  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2691  transcriptional regulator CysB-like protein  42.76 
 
 		 313 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.644017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1289  transcriptional regulator CysB-like protein  41.22 
 
 		 317 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2236  transcriptional regulator CysB-like protein  41.38 
 
 		 313 aa  231  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1721  transcriptional regulator CysB-like protein  41.55 
 
 		 313 aa  231  1e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2341  transcriptional regulator CysB  41.52 
 
 		 335 aa  231  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00664929 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2726  transcriptional regulator CysB-like protein  41.69 
 
 		 313 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.634553  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0800  transcriptional regulator CysB-like protein  40.83 
 
 		 313 aa  230  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0699  sulfur assimilation transcriptional regulator, LysR family  41.69 
 
 		 320 aa  229  3e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.735105  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1917  transcriptional regulator CysB-like protein  41.22 
 
 		 313 aa  229  3e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.832664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0847  transcriptional regulator, LysR family  41.69 
 
 		 320 aa  229  3e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.960379 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3535  transcriptional regulator CysB-like protein  41.89 
 
 		 326 aa  229  5e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00820033 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1667  transcriptional regulator CysB  41.52 
 
 		 324 aa  229  5e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00185974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003883  regulatory protein CysB  41.1 
 
 		 324 aa  229  6e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.803514  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3039  LysR family transcriptional regulator  42.12 
 
 		 309 aa  228  1e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.275315  normal  0.0769631 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3166  transcriptional regulator CysB-like protein  41.22 
 
 		 313 aa  228  1e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0200207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2173  transcriptional regulator CysB-like protein  42.42 
 
 		 314 aa  227  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.147691 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3665  transcriptional regulator CysB-like protein  41.38 
 
 		 313 aa  227  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.891363 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0969  transcriptional regulator CysB-like protein  40.89 
 
 		 313 aa  227  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01793  transcriptional regulator CysB  41.1 
 
 		 324 aa  226  3e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23140  transcriptional regulator CysB  42.21 
 
 		 324 aa  226  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2279  Cys regulon transcriptional activator  42.56 
 
 		 324 aa  226  4e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0003435  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2077  transcriptional regulator CysB  42.56 
 
 		 324 aa  226  4e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047105 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1296  transcriptional regulator, LysR family  40.68 
 
 		 320 aa  226  4e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.842409  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0061  transcriptional regulator, LysR family  45.17 
 
 		 314 aa  226  4e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3443  transcriptional regulator CysB  42.21 
 
 		 324 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0457028  hitchhiker  0.00255719 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2327  transcriptional regulator CysB  42.21 
 
 		 324 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184075  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>