More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0969 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0969  transcriptional regulator CysB-like protein  100 
 
 		 313 aa  642    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3665  transcriptional regulator CysB-like protein  99.36 
 
 		 313 aa  640    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.891363 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2236  transcriptional regulator CysB-like protein  94.25 
 
 		 313 aa  609  1e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0818  transcriptional regulator CysB-like protein  91.05 
 
 		 313 aa  589  1e-167  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2393  transcriptional regulator CysB-like protein  91.05 
 
 		 313 aa  586  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2476  transcriptional regulator CysB-like protein  90.73 
 
 		 313 aa  584  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14516  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1865  transcriptional regulator CysB-like protein  90.73 
 
 		 313 aa  584  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2525  transcriptional regulator CysB-like protein  91.05 
 
 		 313 aa  586  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2481  transcriptional regulator CysB-like protein  90.73 
 
 		 313 aa  584  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5807  transcriptional regulator CysB-like protein  90.42 
 
 		 313 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0834641 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1005  transcriptional regulator CysB-like protein  89.78 
 
 		 313 aa  577  1e-164  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0662  transcriptional regulator CysB-like protein  89.78 
 
 		 313 aa  577  1e-164  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.631688  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2936  transcriptional regulator CysB-like protein  89.78 
 
 		 313 aa  577  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1165  transcriptional regulator CysB-like protein  89.78 
 
 		 313 aa  577  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1012  transcriptional regulator CysB-like protein  89.78 
 
 		 313 aa  577  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0813  transcriptional regulator CysB-like protein  89.46 
 
 		 313 aa  578  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1663  transcriptional regulator CysB-like protein  89.78 
 
 		 313 aa  577  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2349  transcriptional regulator CysB-like protein  89.78 
 
 		 313 aa  577  1e-164  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2698  transcriptional regulator CysB-like protein  74.76 
 
 		 313 aa  501  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2818  transcriptional regulator CysB-like protein  75.08 
 
 		 313 aa  500  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2691  transcriptional regulator CysB-like protein  73.48 
 
 		 313 aa  494  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.644017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2231  transcriptional regulator CysB-like protein  72.84 
 
 		 313 aa  492  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2427  transcriptional regulator CysB-like protein  72.52 
 
 		 313 aa  486  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0620  transcriptional regulator CysB-like protein  66.13 
 
 		 313 aa  449  1e-125  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0418657  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2726  transcriptional regulator CysB-like protein  57.51 
 
 		 313 aa  382  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.634553  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0127  LysR family transcriptional regulator  58.5 
 
 		 311 aa  378  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.191807  hitchhiker  0.00233416 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4926  transcriptional regulator CysB-like protein  57.19 
 
 		 313 aa  378  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.74642 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3166  transcriptional regulator CysB-like protein  57.51 
 
 		 313 aa  377  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0200207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2404  transcriptional regulator CysB-like protein  57.32 
 
 		 314 aa  375  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.044463  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1917  transcriptional regulator CysB-like protein  57.19 
 
 		 313 aa  375  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.832664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1721  transcriptional regulator CysB-like protein  56.87 
 
 		 313 aa  374  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1946  transcriptional regulator CysB-like protein  55.21 
 
 		 317 aa  372  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.226921  normal  0.0811949 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2173  transcriptional regulator CysB-like protein  57.32 
 
 		 314 aa  372  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.147691 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3535  transcriptional regulator CysB-like protein  56.87 
 
 		 326 aa  373  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00820033 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2599  transcriptional regulator CysB-like protein  56.69 
 
 		 321 aa  367  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.174943 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1521  transcriptional regulator CysB-like protein  54.1 
 
 		 308 aa  362  4e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1501  transcriptional regulator CysB-like protein  54.1 
 
 		 308 aa  362  4e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33535  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2476  transcriptional regulator CysB-like protein  53.77 
 
 		 308 aa  361  1e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1632  transcriptional regulator CysB-like protein  53.77 
 
 		 308 aa  360  2e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1205  transcriptional regulator CysB-like protein  53.44 
 
 		 308 aa  359  4e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.215298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0810  transcriptional regulator CysB-like protein  53.44 
 
 		 308 aa  359  4e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.259681  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2018  transcriptional regulator CysB-like protein  53.44 
 
 		 308 aa  359  4e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.962244  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1865  transcriptional regulator CysB-like protein  53.44 
 
 		 308 aa  359  4e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1694  transcriptional regulator CysB-like protein  53.44 
 
 		 308 aa  359  4e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.272702  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0350  transcriptional regulator CysB-like protein  53.44 
 
 		 308 aa  359  4e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0871745  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1851  transcriptional regulator CysB-like protein  53.44 
 
 		 308 aa  359  4e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4743  transcriptional regulator CysB-like protein  53.44 
 
 		 308 aa  358  6e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.217696  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1777  transcriptional regulator CysB-like protein  52.79 
 
 		 308 aa  358  8e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.16529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2466  transcriptional regulator CysB-like protein  52.79 
 
 		 308 aa  358  8e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3810  LysR family transcriptional regulator  54.87 
 
 		 312 aa  358  9e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.251082 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1582  transcriptional regulator CysB-like protein  53.44 
 
 		 308 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.610687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1605  transcriptional regulator CysB-like protein  53.44 
 
 		 308 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339549  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1125  transcriptional regulator CysB-like protein  53.11 
 
 		 308 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1625  transcriptional regulator CysB-like protein  52.79 
 
 		 308 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.879627  normal  0.658708 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5610  LysR family transcriptional regulator  52.61 
 
 		 354 aa  350  1e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519955 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0800  transcriptional regulator CysB-like protein  53.59 
 
 		 313 aa  350  3e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1145  transcriptional regulator CysB-like protein  52.96 
 
 		 308 aa  345  5e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.207377  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2112  transcriptional regulator CysB-like protein  56.74 
 
 		 317 aa  343  2e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1669  transcriptional regulator CysB-like protein  52.46 
 
 		 312 aa  343  2e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0453898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2129  transcriptional regulator CysB-like protein  51.8 
 
 		 311 aa  341  1e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.74673e-16  decreased coverage  0.00000124662 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0071  LysR family transcriptional regulator  56.21 
 
 		 314 aa  338  7e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1224  transcriptional regulator CysB-like protein  51.32 
 
 		 319 aa  338  9e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.178615  normal  0.191747 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1287  transcriptional regulator CysB-like protein  51.32 
 
 		 319 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.767639  normal  0.313196 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2910  transcriptional regulator CysB-like protein  49.84 
 
 		 313 aa  335  7e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.170902  normal  0.254391 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0061  transcriptional regulator, LysR family  53 
 
 		 314 aa  334  1e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1348  transcriptional regulator CysB-like protein  50.33 
 
 		 327 aa  330  1e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0847  transcriptional regulator, LysR family  49.34 
 
 		 320 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.960379 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1967  transcriptional regulator CysB-like protein  51.29 
 
 		 315 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0699  sulfur assimilation transcriptional regulator, LysR family  49.34 
 
 		 320 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.735105  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1379  transcriptional regulator CysB-like protein  50.66 
 
 		 316 aa  325  5e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1296  transcriptional regulator, LysR family  49.01 
 
 		 320 aa  325  7e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.842409  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3039  LysR family transcriptional regulator  53.27 
 
 		 309 aa  324  1e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.275315  normal  0.0769631 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1739  transcriptional regulator CysB-like protein  48.85 
 
 		 314 aa  320  9.999999999999999e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000279611  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0621  transcriptional regulator CysB-like protein  48.69 
 
 		 309 aa  319  3.9999999999999996e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2292  transcriptional regulator CysB-like protein  47.7 
 
 		 306 aa  312  4.999999999999999e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.524252  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0963  LysR family transcriptional regulator  48.38 
 
 		 308 aa  310  2.9999999999999997e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.377381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1697  transcriptional regulator CysB  45.9 
 
 		 326 aa  308  1.0000000000000001e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828749 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1033  transcriptional regulator CysB  46.86 
 
 		 323 aa  294  1e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.113266  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2428  transcriptional regulator CysB  44.41 
 
 		 323 aa  292  6e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1324  transcriptional regulator CysB  45.07 
 
 		 324 aa  291  9e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.121135 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0341  transcriptional regulator CysB  43.14 
 
 		 333 aa  291  9e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.136754  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1667  transcriptional regulator CysB  42.49 
 
 		 324 aa  291  1e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00185974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1979  transcriptional regulator CysB  43.61 
 
 		 323 aa  290  3e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1583  transcriptional regulator CysB  43.09 
 
 		 325 aa  288  6e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2161  transcriptional regulator, LysR family  43.42 
 
 		 324 aa  288  8e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.281423  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01251  DNA-binding transcriptional dual regulator, O-acetyl-L-serine-binding  43.42 
 
 		 324 aa  288  1e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2374  transcriptional regulator, LysR family  43.42 
 
 		 324 aa  288  1e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00240492  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1907  transcriptional regulator CysB  43.42 
 
 		 324 aa  288  1e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0524894  hitchhiker  2.34231e-17 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1384  transcriptional regulator CysB  43.42 
 
 		 324 aa  288  1e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1475  transcriptional regulator CysB  43.42 
 
 		 324 aa  288  1e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00044374  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01261  hypothetical protein  43.42 
 
 		 324 aa  288  1e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.234561  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1501  transcriptional regulator CysB  43.42 
 
 		 324 aa  288  1e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.7918  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2353  transcriptional regulator CysB  43.42 
 
 		 324 aa  288  1e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0011024  unclonable  0.000000022716 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1856  transcriptional regulator CysB  43.42 
 
 		 324 aa  287  2e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.314733  hitchhiker  2.57931e-19 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1923  transcriptional regulator, LysR family  42.95 
 
 		 324 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01945  transcriptional regulator CysB  42.43 
 
 		 324 aa  286  2.9999999999999996e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00567188  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1624  transcriptional regulator CysB  42.11 
 
 		 324 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.483368  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2016  transcriptional regulator CysB  41.78 
 
 		 324 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.251178  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2649  transcriptional regulator CysB  43.42 
 
 		 324 aa  285  5e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2317  transcriptional regulator CysB  41.78 
 
 		 324 aa  286  5e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>