More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_02580 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_02580  transcriptional regulator  100 
 
 		 309 aa  585  1e-166  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2560  transcriptional regulator, LysR family  45.66 
 
 		 325 aa  206  4e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000128008 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2847  LysR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 327 aa  181  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113513  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06400  transcriptional regulator  43.72 
 
 		 305 aa  162  6e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.450023  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2214  transcriptional regulator, LysR family  41.34 
 
 		 331 aa  160  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00637243  hitchhiker  0.0000100352 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0112  transcriptional regulator, LysR family  40.82 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.262181  normal  0.0290414 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  32.64 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  32.19 
 
 		 302 aa  152  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0641  transcriptional regulator, LysR family  36.6 
 
 		 309 aa  144  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4722  transcriptional regulator, LysR family  40.36 
 
 		 301 aa  143  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1381  transcriptional regulator, LysR family  41.33 
 
 		 300 aa  142  6e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0155943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1383  transcriptional regulator, LysR family  32.3 
 
 		 300 aa  138  8.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0790  transcriptional regulator, LysR family  39.1 
 
 		 361 aa  125  8.000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.156253  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4901  LysR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 294 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5069  LysR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 294 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5454  LysR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 294 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.533779  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5618  transcriptional regulator, LysR family  29.8 
 
 		 300 aa  122  7e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000121214 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4914  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 294 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5341  transcriptional regulator, LysR family  29.39 
 
 		 294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4029  transcriptional regulator, LysR family  38.93 
 
 		 299 aa  120  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185534  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5392  transcriptional regulator, LysR family  29.39 
 
 		 294 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5335  LysR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 294 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1275  transcriptional regulator, LysR family  38.61 
 
 		 291 aa  119  7e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5310  transcriptional regulator, LysR family  28.98 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1453799999999997e-20 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3576  LysR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 305 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.300569  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3464  LysR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1708  LysR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211796 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2511  transcriptional regulator, LysR family  34.38 
 
 		 290 aa  114  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5012  LysR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 294 aa  112  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1976  transcriptional regulator, LysR family  36.99 
 
 		 343 aa  112  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.66022  normal  0.44727 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  32.6 
 
 		 327 aa  112  8.000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0833  transcriptional regulator, LysR family  31.97 
 
 		 294 aa  112  9e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1711  LysR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316204  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1279  LysR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1269  LysR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.151838 
 
 
-
 
NC_003296  RS05372  transcription regulator protein  36.33 
 
 		 335 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1243  LysR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 298 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  33.08 
 
 		 301 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_003296  RS04822  transcription regulator protein  35.34 
 
 		 306 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05669  transcription regulator protein  35.34 
 
 		 306 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2682  LysR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1344  LysR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.749958  normal  0.0693843 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3565  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 303 aa  108  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116622  normal  0.0782096 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1930  LysR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 297 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0417087 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1405  LysR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.893483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5552  putative transcriptional regulator protein, LysR family  33.91 
 
 		 303 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3362  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 301 aa  106  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0184586  normal  0.124308 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5225  transcriptional regulator, LysR family  29.87 
 
 		 316 aa  105  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4044  transcriptional regulator, LysR family  34.92 
 
 		 307 aa  105  7e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180327  normal  0.114171 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0884  LysR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 298 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1366  LysR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 298 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3927  LysR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 303 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2537  LysR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 299 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4509  LysR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1001  LysR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 303 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2061  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 306 aa  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4603  LysR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 294 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0215938 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5436  LysR family transcriptional regulator  32.25 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5149  LysR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3618  LysR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4749  LysR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0228204 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2671  LysR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 299 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0656105  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3179  LysR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 299 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4453  transcriptional regulator, LysR family  33.47 
 
 		 298 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.47384 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4587  transcriptional regulator, LysR family  33.47 
 
 		 298 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.781824  normal  0.831534 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3454  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 298 aa  102  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4649  LysR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 315 aa  102  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4596  LysR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 303 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00651674 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1033  transcriptional regulator CysB  30.4 
 
 		 323 aa  102  8e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.113266  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1113  transcriptional regulator, LysR family  29.14 
 
 		 311 aa  102  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66490  LysR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 301 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1268  putative HTH-type transcriptional regulator YbhD  28.47 
 
 		 297 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1355  LysR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 296 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45170  Transcriptional regulator, LysR family  31.85 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68920  LysR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 304 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5534  LysR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 306 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.162022  normal  0.470463 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5766  putative transcriptional regulator  32.93 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1573  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 297 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117572  normal  0.71184 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5606  DNA-binding transcriptional regulator CynR  31.09 
 
 		 328 aa  100  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1905  LysR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 304 aa  100  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.204877 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2054  LysR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 297 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3691  transcriptional regulator, LysR family  31.67 
 
 		 301 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3686  LysR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 297 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2803  LysR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 316 aa  99.4  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.765199 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3164  LysR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 297 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00292  DNA-binding transcriptional dual regulator  28.51 
 
 		 299 aa  99.4  7e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3268  transcriptional regulator, LysR family  28.51 
 
 		 299 aa  99.4  7e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2454  lysR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 317 aa  99.4  7e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1151  transcriptional regulator, LysR family  32.77 
 
 		 307 aa  99.4  7e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.88835 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00296  hypothetical protein  28.51 
 
 		 299 aa  99.4  7e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2069  LysR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 295 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.450351  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3660  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 295 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0417  LysR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 298 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784631  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3471  LysR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 305 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1978  LysR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 296 aa  98.6  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224272  normal  0.0418865 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1225  LysR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 306 aa  99  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1036  transcriptional regulator, LysR family  29.41 
 
 		 300 aa  98.6  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4132  LysR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 303 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.977393  normal  0.0579117 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2243  transcriptional regulator, LysR family  32.38 
 
 		 296 aa  98.6  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2243  LysR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 302 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.839693  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>