More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1988 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 
301 aa  606  9.999999999999999e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  42.52 
 
 
327 aa  224  2e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  45.24 
 
 
305 aa  223  4e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  45.73 
 
 
288 aa  217  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2386  transcriptional regulator, LysR family  46 
 
 
309 aa  207  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00159604  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1796  transcriptional regulator, LysR family  42.45 
 
 
308 aa  202  6e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2648  transcriptional regulator, LysR family  44.58 
 
 
306 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3118  transcriptional regulator, LysR family  40.42 
 
 
309 aa  199  5e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181053  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1507  transcriptional regulator, LysR family  41.16 
 
 
288 aa  193  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.74974  normal  0.352143 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02220  transcriptional regulator  39.73 
 
 
304 aa  192  7e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4632  transcriptional regulator, LysR family  43.08 
 
 
295 aa  189  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3940  transcriptional regulator, LysR family  40.07 
 
 
310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
312 aa  178  8e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  37.87 
 
 
315 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1104  transcriptional regulator, LysR family  37 
 
 
298 aa  166  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5125  LysR family transcriptional regulator  38.78 
 
 
296 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932924  normal  0.723753 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0655  transcriptional regulator, LysR family  37.83 
 
 
311 aa  156  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2098  LysR family transcriptional regulator  36.82 
 
 
312 aa  151  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0305237  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6150  LysR family transcriptional regulator  40.24 
 
 
295 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0301422 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4073  transcriptional regulator, LysR family  40.23 
 
 
313 aa  150  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.127902  normal  0.817309 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2292  transcriptional regulator, LysR family  35.9 
 
 
315 aa  149  6e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.863525  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6522  transcriptional regulator, LysR family  35.79 
 
 
300 aa  147  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  37.05 
 
 
301 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6287  transcriptional regulator, LysR family  38.1 
 
 
304 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4424  LysR family transcriptional regulator  37.15 
 
 
292 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2446  transcriptional regulator, LysR family  38.06 
 
 
308 aa  140  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7868  transcriptional regulator, LysR family  36.45 
 
 
296 aa  139  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.365024 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3489  LysR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
323 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3552  LysR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
323 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191532  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5452  transcriptional regulator, LysR family  34.15 
 
 
297 aa  138  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2545  transcriptional regulator, LysR family  34.53 
 
 
309 aa  138  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.794961 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3502  LysR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
323 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  35.23 
 
 
316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2822  transcriptional regulator, LysR family  34.9 
 
 
310 aa  136  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.438739  normal  0.714096 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5881  transcriptional regulator, LysR family  35.87 
 
 
304 aa  135  9e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6763  transcriptional regulator, LysR family  37.45 
 
 
303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  28.09 
 
 
300 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0569  transcriptional regulator, LysR family  34.94 
 
 
324 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2782  transcriptional regulator, LysR family  35.49 
 
 
294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2187  LysR substrate-binding protein  37.5 
 
 
309 aa  130  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5552  putative transcriptional regulator protein, LysR family  36.8 
 
 
303 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  35.89 
 
 
301 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  27.42 
 
 
300 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  0.00000808392 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19590  transcriptional regulator  32.67 
 
 
311 aa  129  8.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.221792  normal  0.0758544 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36460  transcriptional regulator  36.23 
 
 
304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.776376  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2031  transcriptional regulator, LysR family  35.23 
 
 
333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205829  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6024  transcriptional regulator, LysR family  32.93 
 
 
298 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73094  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1602  fhu operon transcriptional regulator  29.64 
 
 
310 aa  127  3e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2134  transcriptional regulator, LysR family  35.06 
 
 
287 aa  127  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  26.76 
 
 
300 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2097  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
306 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.732708  normal  0.0491263 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1625  transcriptional regulator, LysR family  31.51 
 
 
298 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0540  transcriptional regulator, LysR family  34.8 
 
 
291 aa  126  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15621  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 
327 aa  125  6e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4546  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
300 aa  125  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
300 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1422  LysR family transcriptional regulator  32.36 
 
 
308 aa  124  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00195938  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2271  LysR family transcriptional regulator  26.09 
 
 
300 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2244  LysR family transcriptional regulator  26.69 
 
 
305 aa  123  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1321  transcriptional regulator, LysR family  32.62 
 
 
308 aa  124  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  0.107974 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2439  LysR family transcriptional regulator  26.09 
 
 
300 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0914  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 
301 aa  123  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3454  LysR family transcriptional regulator  33.59 
 
 
298 aa  123  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2455  transcriptional regulator, LysR family  26.09 
 
 
300 aa  123  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4400  transcriptional regulator, LysR family  38 
 
 
301 aa  123  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103907  hitchhiker  0.00279425 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5618  transcriptional regulator, LysR family  29.3 
 
 
300 aa  122  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000121214 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3497  transcriptional regulator, LysR family  39.33 
 
 
307 aa  122  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00137062 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0267  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 
300 aa  122  8e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.334674  normal  0.614052 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2188  LysR family transcriptional regulator  26.09 
 
 
300 aa  122  9e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.540994  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2508  LysR substrate-binding protein  33.2 
 
 
316 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2254  LysR family transcriptional regulator  34.7 
 
 
314 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6247  transcriptional regulator, LysR family  34.73 
 
 
328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2225  transcriptional regulator, LysR family  31.58 
 
 
302 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00118451  normal  0.339624 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2018  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 
304 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2533  transcriptional regulator, LysR family  25.75 
 
 
300 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00448001  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4901  LysR family transcriptional regulator  28.21 
 
 
294 aa  119  7e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0716  transcriptional regulator, LysR family  34.54 
 
 
308 aa  119  9e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.711839  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7065  transcriptional regulator, LysR family  35.56 
 
 
294 aa  118  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4368  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 
300 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000508648  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34330  transcriptional regulator  33.33 
 
 
308 aa  118  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2340  transcriptional regulator, LysR family  30.64 
 
 
302 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  0.887111 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0208  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 
301 aa  118  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5335  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4914  LysR family transcriptional regulator  27.84 
 
 
294 aa  117  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1684  LysR family transcriptional regulator  31.47 
 
 
299 aa  117  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00688867  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5341  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 
294 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3338  transcriptional regulator, LysR family  31.08 
 
 
312 aa  116  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5069  LysR family transcriptional regulator  27.84 
 
 
294 aa  115  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5454  LysR family transcriptional regulator  27.84 
 
 
294 aa  115  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.533779  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5310  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 
294 aa  115  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1453799999999997e-20 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2120  LysR family transcriptional regulator  32.45 
 
 
319 aa  116  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.526762  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4132  LysR family transcriptional regulator  35.86 
 
 
303 aa  115  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.977393  normal  0.0579117 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5012  LysR family transcriptional regulator  27.84 
 
 
294 aa  116  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2872  transcriptional regulator, LysR family  31.2 
 
 
302 aa  115  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0303  LysR family transcriptional regulator  32.77 
 
 
307 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1976  transcriptional regulator, LysR family  34.29 
 
 
343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.66022  normal  0.44727 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1355  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5392  transcriptional regulator, LysR family  27.84 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3013  LysR family transcriptional regulator  35.04 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5689  transcriptional regulator, LysR family  33.73 
 
 
314 aa  113  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>