More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1599 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1599  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 320 aa  650    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.546474 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4535  LysR family transcriptional regulator  71.38 
 
 		 312 aa  437  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2380  transcriptional regulator, LysR family  65.48 
 
 		 324 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2329  transcriptional regulator, LysR family  65.16 
 
 		 324 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0664  transcriptional regulator, LysR family  65.8 
 
 		 331 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4333  LysR family transcriptional regulator  63.07 
 
 		 325 aa  398  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1242  LysR family transcriptional regulator  51.95 
 
 		 309 aa  313  1.9999999999999998e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00379242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0791  LysR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 317 aa  127  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2590  transcriptional regulator, LysR family  26.23 
 
 		 317 aa  126  5e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0822  LysR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 317 aa  126  5e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.835428  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0795  LysR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 317 aa  126  5e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2894  LysR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 317 aa  126  5e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0369741  normal  0.204254 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0871  transcriptional regulator, LysR family  26.23 
 
 		 317 aa  126  5e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2874  transcriptional regulator, LysR family  25.9 
 
 		 317 aa  125  9e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000130864  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  32.91 
 
 		 301 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2090  LysR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.115384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4552  LysR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 307 aa  124  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34290  Transcriptional regualtor, LysR family  31.4 
 
 		 294 aa  123  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1389  LysR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 295 aa  122  6e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148304  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1984  LysR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 292 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.958357  normal  0.045506 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1515  LysR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 292 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3775  LysR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 292 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3806  LysR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 307 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5705  DNA-binding transcriptional regulator CynR  29.03 
 
 		 295 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.202456 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1477  LysR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 302 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5949  DNA-binding transcriptional regulator CynR  29.03 
 
 		 295 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.233312  normal  0.638196 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 300 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2455  transcriptional regulator, LysR family  28.37 
 
 		 300 aa  119  6e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2087  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 299 aa  119  6e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.589785  normal  0.993199 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2271  LysR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 300 aa  119  7e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1888  LysR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 306 aa  119  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0674933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2439  LysR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 300 aa  119  7e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2533  transcriptional regulator, LysR family  28.37 
 
 		 300 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00448001  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  30.33 
 
 		 300 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2188  LysR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.540994  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0498  transcriptional regulator, LysR family  31.4 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2454  LysR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.332878  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1547  LysR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.240499 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 300 aa  117  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2787  LysR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 305 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2830  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 303 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  30.23 
 
 		 302 aa  116  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  30.33 
 
 		 300 aa  116  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  0.00000808392 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  30.99 
 
 		 300 aa  116  6e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23730  LysR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 297 aa  116  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0194065 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2724  LysR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 293 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0713788  normal  0.0834627 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1566  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 295 aa  115  6.9999999999999995e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0266  LysR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 307 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2011  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 297 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2172  transcriptional regulator, LysR family  31.23 
 
 		 290 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25457  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3294  LysR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.438685 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0511  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 699 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00795049 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0223  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 		 314 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2244  LysR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 305 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0383  transcriptional regulator, LysR family  34.6 
 
 		 297 aa  112  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715241  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3346  LysR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 328 aa  112  7.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1982  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.43 
 
 		 290 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0403422 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01751  putative Rubisco transcriptional regulator  29.81 
 
 		 317 aa  112  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.348697  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1244  transcriptional regulator, LysR family  31.33 
 
 		 286 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4044  transcriptional regulator, LysR family  33.48 
 
 		 307 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180327  normal  0.114171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4466  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 316 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3576  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 305 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.300569  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02614  transcriptional regulator LysR family  29.93 
 
 		 296 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1913  LysR family transcriptional regulator  26.1 
 
 		 298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0283777  normal  0.375382 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1556  LysR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 309 aa  110  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00011369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3464  LysR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 316 aa  109  5e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0331  transcriptional regulator, LysR family  30.71 
 
 		 306 aa  109  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.172645  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2064  transcriptional regulator, LysR family  30.71 
 
 		 306 aa  109  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.053811  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1650  LysR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 301 aa  109  8.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4648  LysR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 305 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3720  LysR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 305 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.101076  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1036  transcriptional regulator, LysR family  26.18 
 
 		 300 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1279  LysR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 310 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2215  LysR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3380  transcriptional regulator, LysR family  32.95 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213081  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2065  LysR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.102765  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2328  LysR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.418813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2625  putative transcriptional regulator  33.73 
 
 		 292 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.351429 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1684  LysR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 299 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00688867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2466  putative transcriptional regulator  33.73 
 
 		 292 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.11864 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2417  putative transcriptional regulator  33.73 
 
 		 292 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1166  transcriptional regulator, LysR family  27.88 
 
 		 299 aa  107  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.02159  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5656  LysR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601684 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1225  LysR family transcriptional regulator  24.67 
 
 		 306 aa  107  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2521  putative transcriptional regulator  34.13 
 
 		 292 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01641  putative Rubisco transcriptional regulator  29.71 
 
 		 314 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.569388  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3415  LysR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 386 aa  107  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3619  LysR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 292 aa  107  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2077  LysR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 296 aa  106  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2509  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 292 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3165  transcriptional regulator, LysR family  27.56 
 
 		 299 aa  106  5e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000392866  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1027  transcriptional regulator, LysR family  28.24 
 
 		 317 aa  106  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.922112  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02191  putative Rubisco transcriptional regulator  27.19 
 
 		 316 aa  106  5e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.989894 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2511  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 290 aa  106  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1414  LysR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 290 aa  106  6e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.832122 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1573  LysR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 297 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117572  normal  0.71184 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0970  LysR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 303 aa  106  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0497  LysR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 294 aa  106  6e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.479645  normal  0.474406 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1859  LysR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 314 aa  106  7e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.430795  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3225  transcriptional regulator, LysR family  26.18 
 
 		 300 aa  106  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.456811 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>