More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4535 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_4535  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 312 aa  635    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0664  transcriptional regulator, LysR family  70 
 
 		 331 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1599  transcriptional regulator, LysR family  71.38 
 
 		 320 aa  437  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.546474 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2380  transcriptional regulator, LysR family  66.77 
 
 		 324 aa  434  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4333  LysR family transcriptional regulator  65.3 
 
 		 325 aa  434  1e-120  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2329  transcriptional regulator, LysR family  66.14 
 
 		 324 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1242  LysR family transcriptional regulator  54.15 
 
 		 309 aa  330  1e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00379242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0791  LysR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 317 aa  127  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0871  transcriptional regulator, LysR family  28.75 
 
 		 317 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2894  LysR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 317 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0369741  normal  0.204254 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2590  transcriptional regulator, LysR family  28.75 
 
 		 317 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0822  LysR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 317 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.835428  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2874  transcriptional regulator, LysR family  28.75 
 
 		 317 aa  126  6e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000130864  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0795  LysR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0383  transcriptional regulator, LysR family  32.98 
 
 		 297 aa  122  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715241  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1389  LysR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 295 aa  119  6e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  29.8 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3056  LysR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 293 aa  117  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.20426 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3380  transcriptional regulator, LysR family  33.09 
 
 		 299 aa  116  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213081  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34290  Transcriptional regualtor, LysR family  31.45 
 
 		 294 aa  115  6.9999999999999995e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0970  LysR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 303 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205462  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1984  LysR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.958357  normal  0.045506 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3806  LysR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1515  LysR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 292 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3775  LysR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1225  LysR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0511  transcriptional regulator, LysR family  35.04 
 
 		 699 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00795049 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2724  LysR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0713788  normal  0.0834627 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3464  LysR family transcriptional regulator  30.55 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  31.17 
 
 		 300 aa  113  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1279  LysR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 310 aa  113  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0586  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.56 
 
 		 304 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3576  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.300569  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1477  LysR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2671  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.43 
 
 		 313 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00916902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4552  LysR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 307 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0266  LysR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 307 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2172  transcriptional regulator, LysR family  31.35 
 
 		 290 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25457  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1913  LysR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0283777  normal  0.375382 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1556  LysR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 309 aa  110  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00011369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1708  LysR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211796 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2787  LysR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 305 aa  109  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5879  LysR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 299 aa  109  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.927972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2011  LysR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 297 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2064  transcriptional regulator, LysR family  29.7 
 
 		 306 aa  108  8.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.053811  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0331  transcriptional regulator, LysR family  29.7 
 
 		 306 aa  108  8.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.172645  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1982  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.08 
 
 		 290 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0403422 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0309  transcriptional regulator, LysR family protein  28.57 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5225  transcriptional regulator, LysR family  31.2 
 
 		 316 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0613  transcriptional regulator, LysR family  28.43 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.311225 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03773  transcriptional regulator LysR family  33.99 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2087  LysR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.589785  normal  0.993199 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  29.39 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8459  LysR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 310 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.983783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23730  LysR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 297 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0194065 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1547  LysR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 292 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.240499 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1888  LysR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 306 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0674933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1711  LysR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 311 aa  106  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316204  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3294  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 294 aa  107  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.438685 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2455  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 		 300 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0223  transcriptional regulator, LysR family  29.87 
 
 		 314 aa  106  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 300 aa  105  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2328  LysR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 302 aa  105  7e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.418813  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3334  transcriptional regulator, LysR family  26.17 
 
 		 302 aa  105  8e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1911  transcriptional regulator, LysR family  30.1 
 
 		 310 aa  105  8e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1566  LysR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 295 aa  105  8e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1278  LysR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2271  LysR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1817  LysR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 310 aa  105  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.113228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2439  LysR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0975  LysR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417013 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0157  transcriptional regulator, LysR family  29.34 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1293  LysR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 294 aa  105  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000772751  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2090  LysR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.115384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1036  transcriptional regulator, LysR family  26.62 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5523  transcriptional regulator, LysR family  27.09 
 
 		 322 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.553864 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3296  putative transcriptional regulator  28.97 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1907  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.279335  unclonable  0.0000102783 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1573  LysR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 297 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117572  normal  0.71184 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  28.98 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  0.00000808392 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2454  LysR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 321 aa  104  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.332878  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1027  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.922112  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2588  transcription regulator protein  29.32 
 
 		 314 aa  103  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3165  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  26.17 
 
 		 302 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5650  transcriptional regulator, LysR family  29.32 
 
 		 303 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00706693  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2077  LysR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 296 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1120  transcriptional regulator, LysR family  30.85 
 
 		 350 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2710  transcriptional regulator, LysR family  28.02 
 
 		 309 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.79073 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3406  transcriptional regulator, LysR family  28.02 
 
 		 309 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2482  LysR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 303 aa  103  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.086853  normal  0.0180215 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0139  LysR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 308 aa  103  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4012  LysR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 298 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2054  LysR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 297 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2533  transcriptional regulator, LysR family  27.76 
 
 		 300 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00448001  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3686  LysR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 297 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1166  transcriptional regulator, LysR family  25.81 
 
 		 299 aa  102  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.02159  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3415  LysR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 386 aa  102  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2244  LysR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 305 aa  102  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3299  LysR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 287 aa  102  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0793122  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>