More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0975 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0975  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
309 aa  606  9.999999999999999e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417013 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4012  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 
298 aa  214  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5504  LysR family transcriptional regulator  38.23 
 
 
300 aa  196  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5102  transcriptional regulator, LysR family  38.14 
 
 
302 aa  190  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3346  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 
328 aa  189  4e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773676  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3073  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 
304 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3294  LysR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
294 aa  175  7e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.438685 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1466  LysR family transcriptional regulator  36.01 
 
 
314 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4404  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 
308 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1784  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 
308 aa  168  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.132591  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3806  LysR family transcriptional regulator  36.45 
 
 
307 aa  167  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4050  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 
308 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1352  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 
305 aa  162  5.0000000000000005e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1626  transcriptional regulator, LysR family  37.12 
 
 
300 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0614386 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1735  LysR family transcriptional regulator  37 
 
 
300 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26615  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4552  LysR family transcriptional regulator  36.71 
 
 
307 aa  161  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1930  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 
297 aa  159  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0417087 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2826  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 
300 aa  159  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1573  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 
297 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117572  normal  0.71184 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2054  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 
297 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142115  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3686  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 
297 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0298  LysR family transcriptional regulator  35.25 
 
 
313 aa  157  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.202952 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3164  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 
297 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0712  LysR family transcriptional regulator  35.4 
 
 
299 aa  155  6e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1344  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
298 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.749958  normal  0.0693843 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5523  transcriptional regulator, LysR family  31.85 
 
 
322 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.553864 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1268  putative HTH-type transcriptional regulator YbhD  34.35 
 
 
297 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2569  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 
300 aa  154  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0243965  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4509  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 
298 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2077  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
296 aa  153  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235572  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2421  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 
312 aa  153  5e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.324279 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1913  LysR family transcriptional regulator  28.97 
 
 
298 aa  152  5.9999999999999996e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0283777  normal  0.375382 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1366  LysR family transcriptional regulator  34.35 
 
 
298 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6662  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 
307 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0884  LysR family transcriptional regulator  34.35 
 
 
298 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6427  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 
307 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1621  LysR family transcriptional regulator  30.48 
 
 
297 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4078  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 
300 aa  151  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.325565 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3691  transcriptional regulator, LysR family  33.99 
 
 
301 aa  152  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5388  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 
299 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6260  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 
307 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0986  LysR family transcriptional regulator  37.72 
 
 
300 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1757  LysR family transcriptional regulator  37.72 
 
 
300 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.233098  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1067  LysR family transcriptional regulator  37.72 
 
 
300 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1910  OsmT protein  37.72 
 
 
300 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.580889  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1735  LysR family transcriptional regulator  37.72 
 
 
300 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0864805  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0180  LysR family transcriptional regulator  37.72 
 
 
300 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0000907778  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4089  transcriptional regulator, LysR family  31.96 
 
 
297 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1512  LysR family transcriptional regulator  37.72 
 
 
300 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4982  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
307 aa  151  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.960154 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1269  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 
298 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.151838 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1243  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 
298 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3479  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 
306 aa  149  4e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35259  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5656  LysR family transcriptional regulator  32.44 
 
 
305 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.601684 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5612  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 
294 aa  149  6e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2659  OsmT protein  33.01 
 
 
308 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4648  LysR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
305 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3720  LysR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
305 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.101076  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0835  LysR family transcriptional regulator  31.12 
 
 
364 aa  148  9e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.643048  normal  0.134814 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2789  OsmT protein  33.01 
 
 
308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2568  OsmT protein  33.01 
 
 
308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0008695  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2683  OsmT protein  33.01 
 
 
308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.567691  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1556  LysR family transcriptional regulator  31.56 
 
 
309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00011369  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5626  LysR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0807108 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6374  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.436439 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6323  MarR family transcriptional regulator  33.22 
 
 
294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.482978  normal  0.771209 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2617  OsmT protein  33.01 
 
 
308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5397  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.48 
 
 
297 aa  146  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0586  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.91 
 
 
304 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0545  transcriptional regulator, LysR family  32.09 
 
 
305 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51620  LysR family transcriptional regulator protein  33.45 
 
 
301 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0162  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
302 aa  144  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5879  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
299 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.927972  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3178  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 
305 aa  144  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125712  normal  0.0310919 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0528  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 
301 aa  143  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000454001 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1761  LysR family transcriptional regulator  34.58 
 
 
300 aa  143  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.982692  normal  0.0243449 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3955  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.99 
 
 
313 aa  142  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0532  transcriptional regulator, LysR family  32.09 
 
 
305 aa  142  7e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3664  transcriptional regulator, LysR family  31.48 
 
 
308 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1039  LysR family transcriptional regulator  32.45 
 
 
321 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.204243  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6026  transcriptional regulator, LysR family  34.29 
 
 
323 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.306271 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1416  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 
300 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.691659 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1376  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 
300 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.809674  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3441  LysR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
306 aa  140  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.985803  hitchhiker  0.000545962 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2504  transcriptional regulator, LysR family  29.01 
 
 
298 aa  139  6e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2537  transcription regulator transcription regulator protein  33.45 
 
 
297 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6009  LysR family transcriptional regulator  34.58 
 
 
322 aa  138  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.853275 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6811  LysR family transcriptional regulator  32.57 
 
 
309 aa  138  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.659925  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3334  transcriptional regulator, LysR family  32.75 
 
 
302 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3165  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.45 
 
 
302 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3576  LysR family transcriptional regulator  33.6 
 
 
305 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.300569  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1581  LysR family transcriptional regulator  35.31 
 
 
325 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.772749  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1743  LysR family transcriptional regulator  35.31 
 
 
325 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1555  LysR family transcriptional regulator  35.31 
 
 
325 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.729092  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0634  LysR family transcriptional regulator  35.31 
 
 
325 aa  135  8e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0961605  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0832  LysR family transcriptional regulator  35.31 
 
 
325 aa  135  8e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1353  LysR family transcriptional regulator  35.31 
 
 
325 aa  135  8e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4635  LysR family transcriptional regulator  34.92 
 
 
300 aa  135  8e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.646338  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0521  LysR family transcriptional regulator  35.31 
 
 
325 aa  135  8e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4412  LysR family transcriptional regulator  31.63 
 
 
300 aa  135  9e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.481295  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>