More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1414 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1414  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 290 aa  595  1e-169  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.832122 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1575  LysR family transcriptional regulator  99.28 
 
 		 278 aa  566  1e-160  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.684291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1937  LysR family transcriptional regulator  83.74 
 
 		 291 aa  512  1e-144  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2087  LysR family transcriptional regulator  44.25 
 
 		 299 aa  242  5e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.589785  normal  0.993199 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2454  LysR family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 321 aa  238  1e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.332878  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1515  LysR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 292 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2172  transcriptional regulator, LysR family  41.61 
 
 		 290 aa  236  3e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25457  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1982  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  40.91 
 
 		 290 aa  236  4e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0403422 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1984  LysR family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 292 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.958357  normal  0.045506 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3775  LysR family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 292 aa  235  7e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34290  Transcriptional regualtor, LysR family  41.96 
 
 		 294 aa  233  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1547  LysR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 292 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.240499 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23730  LysR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 297 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0194065 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2011  LysR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 297 aa  229  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2724  LysR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 293 aa  227  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0713788  normal  0.0834627 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2090  LysR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 293 aa  225  6e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.115384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1888  LysR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 306 aa  225  7e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0674933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02614  transcriptional regulator LysR family  41.61 
 
 		 296 aa  222  6e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1244  transcriptional regulator, LysR family  40.21 
 
 		 286 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1566  LysR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 295 aa  189  4e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1345  transcriptional regulator, LysR family  35.64 
 
 		 290 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.515489  normal  0.2022 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1720  transcriptional regulator, LysR family  34.2 
 
 		 294 aa  149  4e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.820276  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  30.21 
 
 		 301 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0271  LysR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 295 aa  121  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0648353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05450  transcriptional regulator, LysR family  28.62 
 
 		 296 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0434511  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4614  LysR family regulatory protein  29.48 
 
 		 295 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.342206 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4531  LysR family regulatory protein  29.48 
 
 		 295 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4616  LysR family regulatory protein  29.48 
 
 		 295 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1477  LysR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 302 aa  119  7e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4523  LysR family regulatory protein  29.48 
 
 		 295 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4666  LysR family regulatory protein  29.48 
 
 		 295 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54567  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0355  hypothetical protein  27.13 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0456  LysR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  30.71 
 
 		 300 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  0.00000808392 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2271  LysR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 300 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2439  LysR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 300 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2455  transcriptional regulator, LysR family  30.29 
 
 		 300 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  30.29 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2065  LysR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.102765  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2533  transcriptional regulator, LysR family  30.29 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00448001  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 300 aa  113  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2736  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  28.09 
 
 		 294 aa  113  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1615  LysR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 299 aa  112  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.979938  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2188  LysR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 300 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.540994  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3313  LysR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.600178  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2244  LysR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 305 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3322  transcriptional regulator, LysR family  29.03 
 
 		 296 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151906  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 300 aa  109  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3156  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.52 
 
 		 325 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.46065  normal  0.121521 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0509  transcriptional regulator, LysR family  27.24 
 
 		 293 aa  108  9.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.187244  hitchhiker  0.00160332 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1236  transcriptional regulator, LysR family  27.01 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.387856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1599  transcriptional regulator, LysR family  28.22 
 
 		 320 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.546474 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1084  LysR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 297 aa  105  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000126748  hitchhiker  0.00000896339 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1791  LysR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 290 aa  105  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.027343 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0332  hypothetical protein  26.36 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0295  putative Rubisco transcriptional regulator  27.7 
 
 		 331 aa  104  1e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3732  transcriptional regulator, LysR family  31.45 
 
 		 300 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000560912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1945  LysR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.551445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1650  LysR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0309  transcriptional regulator, LysR family protein  26.69 
 
 		 289 aa  103  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0187  transcriptional regulator, LysR family  25 
 
 		 322 aa  103  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.502015  normal  0.832957 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1050  LysR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 304 aa  102  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.389314 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1684  LysR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 299 aa  102  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00688867  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0269  hypothetical protein  28.63 
 
 		 294 aa  102  7e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2398  putative Rubisco transcriptional regulator  27.36 
 
 		 329 aa  102  7e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1370  transcriptional regulator, LysR family  28.92 
 
 		 313 aa  102  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173382  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2673  LysR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 303 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4872  LysR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.511733  normal  0.704501 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2120  LysR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 292 aa  101  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.112359  normal  0.184045 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1151  transcriptional regulator, LysR family  29.13 
 
 		 302 aa  101  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1717  transcriptional regulator  27.3 
 
 		 314 aa  101  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0284  LysR family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 294 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0274  hypothetical protein  28.23 
 
 		 294 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2243  LysR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 289 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2710  transcriptional regulator, LysR family  27.82 
 
 		 309 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.79073 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3406  transcriptional regulator, LysR family  27.82 
 
 		 309 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3809  LysR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 285 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1779  hydrogen peroxide-inducible genes activator  25.38 
 
 		 296 aa  100  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1985  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  29.08 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.464368 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3454  LysR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01751  putative Rubisco transcriptional regulator  29.58 
 
 		 317 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.348697  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0497  LysR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.479645  normal  0.474406 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1155  transcriptional regulator, LysR family  24.14 
 
 		 294 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0660  LysR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 299 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.558378 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4031  LysR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 294 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3724  LysR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 294 aa  99.8  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3740  LysR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 294 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1855  transcriptional regulator, LysR family  27.3 
 
 		 308 aa  99.8  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1345  transcriptional regulator, LysR family  26.64 
 
 		 307 aa  99.8  5e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0800  transcriptional regulator CysB-like protein  30.42 
 
 		 313 aa  99.8  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3997  transcriptional regulator, LysR family  24.14 
 
 		 294 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4102  transcriptional regulator, LysR family  24.14 
 
 		 294 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.33917  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3036  transcriptional regulator, LysR family  26.71 
 
 		 288 aa  99.8  5e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000194633  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3892  LysR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 294 aa  99.4  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.940003  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4085  transcriptional regulator, LysR family  24.14 
 
 		 294 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4195  LysR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 294 aa  99.4  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1778  hydrogen peroxide-inducible genes activator  25.94 
 
 		 296 aa  99  7e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0149  putative Rubisco transcriptional regulator  28.06 
 
 		 319 aa  99  8e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0070  LysR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 296 aa  99  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2640  RuBisCO operon transcriptional regulator  27.78 
 
 		 305 aa  99  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>