More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1236 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1236  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 292 aa  577  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.387856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1323  transcriptional regulator, LysR family  92.12 
 
 		 292 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.672802  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3322  transcriptional regulator, LysR family  45.48 
 
 		 296 aa  232  5e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151906  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1370  transcriptional regulator, LysR family  43.88 
 
 		 313 aa  225  6e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173382  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3156  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  42.12 
 
 		 325 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.46065  normal  0.121521 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2994  LysR family transcriptional regulator  46.02 
 
 		 314 aa  213  3.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.735848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3436  LysR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 294 aa  212  7e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1309  LysR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 303 aa  206  5e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3123  transcriptional regulator, LysR family  37.85 
 
 		 293 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1047  LysR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 298 aa  149  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0070  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0134  transcriptional regulator, LysR family  34.02 
 
 		 296 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0284  LysR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 294 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2640  RuBisCO operon transcriptional regulator  33.81 
 
 		 305 aa  135  8e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1279  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 310 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5931  LysR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 307 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145733  normal  0.0470213 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1945  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.551445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5664  transcriptional regulator, LysR family  29.03 
 
 		 297 aa  130  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3615  transcriptional regulator, LysR family  33.68 
 
 		 294 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3293  transcriptional regulator, LysR family  33.68 
 
 		 294 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2455  transcriptional regulator, LysR family  27.84 
 
 		 300 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5293  transcriptional regulator, LysR family  29.03 
 
 		 297 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4307  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 294 aa  129  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0280475  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5280  LysR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 297 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71090  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 297 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4870  LysR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 297 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 300 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3716  LysR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 297 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2271  LysR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 300 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2439  LysR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 300 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3122  LysR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 294 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5025  LysR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4855  LysR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5263  transcriptional regulator, LysR family  29.03 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5406  LysR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5338  transcriptional regulator, LysR family  29.44 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6168  putative transcriptional regulator  33.45 
 
 		 296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220915  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2533  transcriptional regulator, LysR family  27.15 
 
 		 300 aa  126  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00448001  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2101  LysR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 292 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.205668  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4604  LysR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 294 aa  126  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4979  LysR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 294 aa  126  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.398741  normal  0.422466 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2188  LysR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 300 aa  125  7e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.540994  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0820  transcriptional regulator, LysR family  30.72 
 
 		 307 aa  125  7e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4969  LysR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 297 aa  125  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4529  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 294 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.393903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0334  LysR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000502074  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5149  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5710  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0762258 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6686  LysR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 294 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111777  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3632  LysR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 292 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.486007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3526  LysR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 294 aa  123  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1928  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.75 
 
 		 290 aa  123  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0121617  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3170  LysR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 294 aa  123  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0509  transcriptional regulator, LysR family  33.08 
 
 		 293 aa  123  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.187244  hitchhiker  0.00160332 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1767  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 294 aa  122  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.422305 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4612  transcriptional regulator, LysR family  34.13 
 
 		 298 aa  122  7e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.681307  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  26.8 
 
 		 300 aa  122  7e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1679  transcriptional regulator, LysR family  30.12 
 
 		 304 aa  122  8e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1478  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.13 
 
 		 347 aa  122  9e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2915  transcriptional regulator, LysR family  34 
 
 		 305 aa  122  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2244  LysR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 305 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1713  transcriptional regulator, LysR family  27.21 
 
 		 304 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  26.42 
 
 		 300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  0.00000808392 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1657  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.06 
 
 		 290 aa  120  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0307226  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2280  LysR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 293 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197799 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1825  LysR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 302 aa  120  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0396  LysR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2710  transcriptional regulator, LysR family  30.13 
 
 		 309 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.79073 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05450  transcriptional regulator, LysR family  27.44 
 
 		 296 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0434511  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3406  transcriptional regulator, LysR family  30.13 
 
 		 309 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1993  transcriptional regulator, LysR family  29.66 
 
 		 319 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1148  transcriptional regulator, LysR family  28.21 
 
 		 303 aa  119  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000219344  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2569  LysR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 300 aa  119  6e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0243965  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3178  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 305 aa  119  7.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125712  normal  0.0310919 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5945  transcriptional regulator, LysR family  32.08 
 
 		 307 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1708  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 311 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211796 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3464  LysR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2419  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.27 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2009  LysR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 334 aa  117  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.476347  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1047  LysR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 318 aa  117  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00687136  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2158  LysR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 298 aa  117  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000128289  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1555  LysR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 318 aa  117  3e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214293  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1454  LysR family transcriptional regulator  27.02 
 
 		 294 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0215589  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0953  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 311 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0145345  decreased coverage  0.00704929 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26681  putative Rubisco transcriptional regulator  32.68 
 
 		 323 aa  116  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4466  LysR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 316 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1050  transcriptional regulator, LysR family  33.56 
 
 		 308 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0198617  normal  0.025944 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  34.26 
 
 		 301 aa  116  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1110  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  33.56 
 
 		 306 aa  116  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000488361  normal  0.138015 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1791  LysR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 290 aa  116  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.027343 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3755  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 321 aa  116  5e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0901244  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2364  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 293 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1631  transcriptional regulator, LysR family  30.61 
 
 		 310 aa  115  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1477  LysR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 302 aa  115  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2324  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.03 
 
 		 286 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1733  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 321 aa  115  6.9999999999999995e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0192173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1761  LysR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 300 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.982692  normal  0.0243449 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2758  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.9 
 
 		 288 aa  115  7.999999999999999e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1376  LysR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 300 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.809674  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>