More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1047 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1047  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 298 aa  588  1e-167  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0134  transcriptional regulator, LysR family  69.7 
 
 		 296 aa  410  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0070  LysR family transcriptional regulator  69.36 
 
 		 296 aa  410  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4604  LysR family transcriptional regulator  58.45 
 
 		 294 aa  331  1e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1767  LysR family transcriptional regulator  57.43 
 
 		 294 aa  327  1.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.422305 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3526  LysR family transcriptional regulator  57.77 
 
 		 294 aa  324  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6686  LysR family transcriptional regulator  56.76 
 
 		 294 aa  323  3e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3615  transcriptional regulator, LysR family  55.7 
 
 		 294 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3293  transcriptional regulator, LysR family  55.7 
 
 		 294 aa  312  3.9999999999999997e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4307  LysR family transcriptional regulator  55.52 
 
 		 294 aa  311  6.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0280475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4979  LysR family transcriptional regulator  56.79 
 
 		 294 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.398741  normal  0.422466 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3122  LysR family transcriptional regulator  56.43 
 
 		 294 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4529  LysR family transcriptional regulator  56.16 
 
 		 294 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.393903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5710  LysR family transcriptional regulator  55.48 
 
 		 294 aa  299  4e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0762258 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5149  LysR family transcriptional regulator  55.48 
 
 		 294 aa  299  4e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3170  LysR family transcriptional regulator  55.03 
 
 		 294 aa  297  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2280  LysR family transcriptional regulator  55.89 
 
 		 293 aa  275  6e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197799 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3632  LysR family transcriptional regulator  55.41 
 
 		 292 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.486007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2101  LysR family transcriptional regulator  55.25 
 
 		 292 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.205668  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2364  LysR family transcriptional regulator  53.87 
 
 		 293 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0996  LysR family transcriptional regulator  46.1 
 
 		 298 aa  215  9e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3156  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.57 
 
 		 325 aa  162  7e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.46065  normal  0.121521 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3436  LysR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 294 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3322  transcriptional regulator, LysR family  34.01 
 
 		 296 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151906  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1236  transcriptional regulator, LysR family  37.25 
 
 		 292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.387856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1323  transcriptional regulator, LysR family  34.45 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.672802  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1370  transcriptional regulator, LysR family  33.78 
 
 		 313 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173382  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3123  transcriptional regulator, LysR family  29.93 
 
 		 293 aa  132  5e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1309  LysR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1855  transcriptional regulator, LysR family  29.7 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0383  transcriptional regulator, LysR family  32.65 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715241  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3238  LysR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1282  LysR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497428  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3989  LysR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0509  transcriptional regulator, LysR family  30.65 
 
 		 293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.187244  hitchhiker  0.00160332 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5225  transcriptional regulator, LysR family  31.14 
 
 		 316 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0236  LysR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 293 aa  109  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0946906  normal  0.151625 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1244  transcriptional regulator, LysR family  33.75 
 
 		 286 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02614  transcriptional regulator LysR family  31.88 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23730  LysR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 297 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0194065 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1268  putative HTH-type transcriptional regulator YbhD  28.9 
 
 		 297 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3164  LysR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 297 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2724  LysR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 293 aa  106  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0713788  normal  0.0834627 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1791  LysR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 290 aa  105  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.027343 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2054  LysR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 297 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1573  LysR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 297 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117572  normal  0.71184 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4070  LysR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 297 aa  105  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.409277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3686  LysR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 297 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  30.08 
 
 		 292 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  33.2 
 
 		 315 aa  105  9e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1877  LysR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 297 aa  104  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000269934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3464  LysR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1279  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 310 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2994  LysR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.735848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5504  LysR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2011  LysR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 297 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0114  LysR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 294 aa  103  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0284  LysR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 294 aa  103  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3273  LysR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 293 aa  103  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.215219 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2087  LysR family transcriptional regulator  27.99 
 
 		 299 aa  103  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.589785  normal  0.993199 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1566  LysR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 295 aa  103  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1711  LysR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 311 aa  103  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316204  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 296 aa  102  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4637  LysR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 306 aa  102  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1036  transcriptional regulator, LysR family  27.72 
 
 		 300 aa  102  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8459  LysR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 310 aa  102  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.983783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2161  LysR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 299 aa  102  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0803244  normal  0.636405 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1708  LysR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 311 aa  101  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211796 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1888  LysR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 306 aa  102  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0674933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2058  transcriptional regulator, LysR family  31.52 
 
 		 299 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.90545  hitchhiker  0.00248149 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4202  LysR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 295 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.932359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 305 aa  101  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  32.18 
 
 		 301 aa  101  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0820  transcriptional regulator, LysR family  28.09 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1547  LysR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 292 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.240499 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1434  transcriptional regulator, LysR family  28.69 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4969  LysR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2097  transcriptional regulator, LysR family  32.38 
 
 		 302 aa  100  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1384  LysR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 303 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.510026  normal  0.961764 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5945  transcriptional regulator, LysR family  34 
 
 		 307 aa  99.8  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3007  LysR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 308 aa  99.8  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1366  LysR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 303 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1984  LysR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 292 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.958357  normal  0.045506 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3225  transcriptional regulator, LysR family  27.72 
 
 		 300 aa  99.4  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.456811 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5664  transcriptional regulator, LysR family  29.1 
 
 		 297 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2253  transcriptional regulator, LysR family  31.79 
 
 		 303 aa  99.4  7e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.105468  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1842  LysR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 307 aa  99.4  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1477  LysR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 314 aa  99  8e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.490418  normal  0.438801 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1028  LysR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 292 aa  99  9e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0634  transcriptional regulator, LysR family  30.74 
 
 		 310 aa  99  9e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0411  LysR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 308 aa  99  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1993  transcriptional regulator, LysR family  27.74 
 
 		 319 aa  99  9e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2454  LysR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 321 aa  99  9e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.332878  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2179  LysR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 300 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1414  LysR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 290 aa  98.6  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.832122 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1825  LysR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 302 aa  98.2  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2161  LysR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 308 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34290  Transcriptional regualtor, LysR family  29.57 
 
 		 294 aa  98.2  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5916  LysR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 308 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1515  LysR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 292 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>