More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B3170 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B3170  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 294 aa  570  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5710  LysR family transcriptional regulator  93.54 
 
 		 294 aa  531  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0762258 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4529  LysR family transcriptional regulator  93.88 
 
 		 294 aa  530  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.393903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5149  LysR family transcriptional regulator  93.54 
 
 		 294 aa  531  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4979  LysR family transcriptional regulator  92.86 
 
 		 294 aa  525  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.398741  normal  0.422466 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3122  LysR family transcriptional regulator  92.18 
 
 		 294 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4604  LysR family transcriptional regulator  78.77 
 
 		 294 aa  449  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1767  LysR family transcriptional regulator  79.11 
 
 		 294 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.422305 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6686  LysR family transcriptional regulator  78.08 
 
 		 294 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3615  transcriptional regulator, LysR family  75.85 
 
 		 294 aa  438  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3526  LysR family transcriptional regulator  77.74 
 
 		 294 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3293  transcriptional regulator, LysR family  75.51 
 
 		 294 aa  437  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2101  LysR family transcriptional regulator  70.83 
 
 		 292 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.205668  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3632  LysR family transcriptional regulator  69.52 
 
 		 292 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.486007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2280  LysR family transcriptional regulator  69.86 
 
 		 293 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197799 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2364  LysR family transcriptional regulator  66.1 
 
 		 293 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4307  LysR family transcriptional regulator  61.22 
 
 		 294 aa  348  5e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0280475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0070  LysR family transcriptional regulator  54.48 
 
 		 296 aa  295  4e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1047  LysR family transcriptional regulator  55.03 
 
 		 298 aa  295  6e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0134  transcriptional regulator, LysR family  52.88 
 
 		 296 aa  281  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0996  LysR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 298 aa  203  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3156  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  37.29 
 
 		 325 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.46065  normal  0.121521 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3322  transcriptional regulator, LysR family  35.14 
 
 		 296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151906  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1370  transcriptional regulator, LysR family  34.01 
 
 		 313 aa  140  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173382  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3436  LysR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 294 aa  139  7e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3123  transcriptional regulator, LysR family  33.11 
 
 		 293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1236  transcriptional regulator, LysR family  31.74 
 
 		 292 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.387856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1323  transcriptional regulator, LysR family  31.74 
 
 		 292 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.672802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1855  transcriptional regulator, LysR family  31.89 
 
 		 308 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3995  LysR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 297 aa  116  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1279  LysR family transcriptional regulator  32 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1443  transcriptional regulator, LysR family  28.91 
 
 		 299 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.181358  normal  0.808865 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1379  transcriptional regulator, LysR family  28.52 
 
 		 299 aa  112  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.884009  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_003296  RS05312  transcription regulator protein  30 
 
 		 294 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.57895  normal  0.489476 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5504  LysR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 300 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4080  LysR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 327 aa  108  9.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5983  LysR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.95489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4632  transcriptional regulator, LysR family  35.52 
 
 		 295 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1477  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 314 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.490418  normal  0.438801 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6279  LysR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1244  transcriptional regulator, LysR family  34.43 
 
 		 286 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1735  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6344  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.552099  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0715  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 293 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1309  LysR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 303 aa  106  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1748  LysR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 297 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.8769 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8459  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 310 aa  106  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.983783  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3924  transcriptional regulator, LysR family  30.21 
 
 		 316 aa  105  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1405  LysR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 302 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.893483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5225  transcriptional regulator, LysR family  30.66 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3757  LysR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.634887 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5902  LysR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.446699 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0383  transcriptional regulator, LysR family  30.28 
 
 		 297 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715241  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02614  transcriptional regulator LysR family  32.36 
 
 		 296 aa  103  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3809  LysR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.22688  hitchhiker  0.00755616 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5537  LysR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2454  lysR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 317 aa  103  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3973  LysR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 296 aa  103  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.981589 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4141  transcriptional regulator, LysR family  29.2 
 
 		 294 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46680  Transcriptional regulator, LysR-family  33.81 
 
 		 297 aa  103  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4253  transcriptional regulator, LysR family  29.2 
 
 		 294 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.944931 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3464  LysR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 316 aa  103  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3901  transcriptional regulator  30.17 
 
 		 300 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.356442 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1711  LysR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 311 aa  102  9e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316204  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0448  LysR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 297 aa  102  9e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2780  transcriptional regulator, LysR family  33.52 
 
 		 315 aa  101  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.967057  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0704  LysR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 303 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2306  LysR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 303 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.846399  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1554  transcriptional regulator, LysR family  28.25 
 
 		 309 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.15921 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2223  LysR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 303 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.429616  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1120  transcriptional regulator, LysR family  33.07 
 
 		 350 aa  101  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4176  LysR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 290 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0055  LysR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 309 aa  101  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4698  LysR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 290 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.981446 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  26.71 
 
 		 300 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  0.00000808392 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1708  LysR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 311 aa  100  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211796 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0919  LysR family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 290 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1883  transcriptional regulator, LysR family  28.25 
 
 		 309 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0687382  normal  0.7379 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1980  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 329 aa  100  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.362231  normal  0.28719 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0528  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 301 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000454001 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5031  transcriptional regulator, LysR family  33.47 
 
 		 289 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1422  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00195938  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1842  LysR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 307 aa  100  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6962  LysR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5031  LysR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 297 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.361143 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  26.35 
 
 		 300 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5945  transcriptional regulator, LysR family  29.64 
 
 		 307 aa  99.8  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6614  LysR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 305 aa  99.8  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4856  LysR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 297 aa  99.4  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0305285 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2243  LysR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 302 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.839693  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0914  transcriptional regulator, LysR family  36.07 
 
 		 301 aa  99.4  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3118  transcriptional regulator, LysR family  32.23 
 
 		 309 aa  99  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181053  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2061  LysR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 306 aa  99  8e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1931  LysR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 303 aa  99  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0266  LysR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 307 aa  99  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1724  LysR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 303 aa  99  9e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1654  LysR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 303 aa  99  9e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0607  LysR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 303 aa  99  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0509  transcriptional regulator, LysR family  28.93 
 
 		 293 aa  98.6  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.187244  hitchhiker  0.00160332 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2099  LysR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 300 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>