More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3118 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3118  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 309 aa  609  1e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181053  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4632  transcriptional regulator, LysR family  59.41 
 
 		 295 aa  325  5e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  58.25 
 
 		 288 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1507  transcriptional regulator, LysR family  55.87 
 
 		 288 aa  291  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.74974  normal  0.352143 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1796  transcriptional regulator, LysR family  55.82 
 
 		 308 aa  281  8.000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  48.92 
 
 		 305 aa  236  4e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5452  transcriptional regulator, LysR family  47.83 
 
 		 297 aa  229  5e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2386  transcriptional regulator, LysR family  48.93 
 
 		 309 aa  223  4e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00159604  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  42.12 
 
 		 327 aa  206  3e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  40.42 
 
 		 301 aa  199  5e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2648  transcriptional regulator, LysR family  44.85 
 
 		 306 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2292  transcriptional regulator, LysR family  41.35 
 
 		 315 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.863525  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02220  transcriptional regulator  38.87 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2134  transcriptional regulator, LysR family  38.28 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  39.68 
 
 		 315 aa  156  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  40.64 
 
 		 312 aa  153  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6763  transcriptional regulator, LysR family  34.78 
 
 		 303 aa  152  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 301 aa  150  3e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5552  putative transcriptional regulator protein, LysR family  36.42 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  38.25 
 
 		 301 aa  147  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3940  transcriptional regulator, LysR family  37.71 
 
 		 310 aa  142  8e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2098  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 312 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0305237  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0540  transcriptional regulator, LysR family  34.54 
 
 		 291 aa  139  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15621  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4073  transcriptional regulator, LysR family  39.15 
 
 		 313 aa  138  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.127902  normal  0.817309 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2018  LysR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 304 aa  138  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0569  transcriptional regulator, LysR family  37.2 
 
 		 324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19590  transcriptional regulator  36.94 
 
 		 311 aa  136  6.0000000000000005e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.221792  normal  0.0758544 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3338  transcriptional regulator, LysR family  32.82 
 
 		 312 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6247  transcriptional regulator, LysR family  34.27 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0914  transcriptional regulator, LysR family  35.5 
 
 		 301 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5881  transcriptional regulator, LysR family  36.95 
 
 		 304 aa  133  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5125  LysR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 296 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932924  normal  0.723753 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1625  transcriptional regulator, LysR family  30.54 
 
 		 298 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1104  transcriptional regulator, LysR family  33.02 
 
 		 298 aa  129  7.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5618  transcriptional regulator, LysR family  32.11 
 
 		 300 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000121214 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3454  LysR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2187  LysR substrate-binding protein  36.03 
 
 		 309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  35.2 
 
 		 316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6150  LysR family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 295 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0301422 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3502  LysR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1423  LysR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 339 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.174338  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3489  LysR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3552  LysR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7868  transcriptional regulator, LysR family  34.93 
 
 		 296 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.365024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6287  transcriptional regulator, LysR family  33.6 
 
 		 304 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5341  transcriptional regulator, LysR family  32.11 
 
 		 294 aa  127  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3497  transcriptional regulator, LysR family  36.99 
 
 		 307 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137062 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5689  transcriptional regulator, LysR family  36.65 
 
 		 314 aa  125  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2097  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 306 aa  125  8.000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.732708  normal  0.0491263 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2225  transcriptional regulator, LysR family  37.33 
 
 		 302 aa  125  9e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00118451  normal  0.339624 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5069  LysR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 294 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5454  LysR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 294 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.533779  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1355  LysR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 296 aa  124  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5392  transcriptional regulator, LysR family  32.11 
 
 		 294 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5012  LysR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 294 aa  125  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2243  transcriptional regulator, LysR family  35.38 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3534  LysR substrate-binding protein  30.91 
 
 		 292 aa  123  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5335  LysR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 294 aa  123  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5310  transcriptional regulator, LysR family  31.71 
 
 		 294 aa  123  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1453799999999997e-20 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4901  LysR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 294 aa  122  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4914  LysR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 294 aa  122  8e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1381  transcriptional regulator, LysR family  37.7 
 
 		 300 aa  121  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0155943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0655  transcriptional regulator, LysR family  35.57 
 
 		 311 aa  121  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4100  transcriptional regulator, LysR family  37.08 
 
 		 319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  0.0246683 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  34.41 
 
 		 327 aa  120  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3406  transcriptional regulator, LysR family  29.67 
 
 		 309 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2710  transcriptional regulator, LysR family  29.67 
 
 		 309 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.79073 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1602  fhu operon transcriptional regulator  30.17 
 
 		 310 aa  119  6e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6522  transcriptional regulator, LysR family  37.35 
 
 		 300 aa  119  7.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2822  transcriptional regulator, LysR family  34.19 
 
 		 310 aa  119  7.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.438739  normal  0.714096 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4824  transcriptional regulator, LysR family  33.21 
 
 		 308 aa  118  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00015803  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34330  transcriptional regulator  33.73 
 
 		 308 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1684  LysR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00688867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4546  LysR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4412  LysR family transcriptional regulator  31 
 
 		 300 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.481295  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0267  LysR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 300 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.334674  normal  0.614052 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2340  transcriptional regulator, LysR family  32.14 
 
 		 302 aa  116  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  0.887111 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1976  transcriptional regulator, LysR family  34.66 
 
 		 343 aa  115  8.999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.66022  normal  0.44727 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0352  transcriptional regulator, LysR family  36.21 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256379  normal  0.0881916 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  31.85 
 
 		 302 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0838  LysR family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00258172  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3924  transcriptional regulator, LysR family  34.77 
 
 		 316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1575  transcriptional regulator, LysR family  27.31 
 
 		 295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000381269  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2244  LysR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2582  LysR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2271  LysR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 300 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2439  LysR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 300 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0157  transcriptional regulator, LysR family  32.79 
 
 		 308 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2120  LysR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 292 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.112359  normal  0.184045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4400  transcriptional regulator, LysR family  36 
 
 		 301 aa  113  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103907  hitchhiker  0.00279425 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 300 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 300 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1896  LysR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 296 aa  112  7.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.349748 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  28.46 
 
 		 300 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44500  Transcriptinal regulator, LysR family  35.14 
 
 		 301 aa  112  8.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.581761  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0139  LysR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 308 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1853  transcriptional regulator, LysR family  34.65 
 
 		 350 aa  112  9e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54026 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2455  transcriptional regulator, LysR family  28.81 
 
 		 300 aa  112  9e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4076  transcriptional regulator, LysR family  33.23 
 
 		 331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  29.44 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  0.00000808392 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>