More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0914 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0914  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 301 aa  590  1e-168  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  57.43 
 
 		 316 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4400  transcriptional regulator, LysR family  59.04 
 
 		 301 aa  326  3e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103907  hitchhiker  0.00279425 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0569  transcriptional regulator, LysR family  52.84 
 
 		 324 aa  289  4e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0267  LysR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 300 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.334674  normal  0.614052 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5881  transcriptional regulator, LysR family  49.5 
 
 		 304 aa  265  8.999999999999999e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2446  transcriptional regulator, LysR family  47.83 
 
 		 308 aa  261  8e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0807  transcriptional regulator, LysR family  37.79 
 
 		 304 aa  171  9e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  35.08 
 
 		 327 aa  159  5e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6024  transcriptional regulator, LysR family  36.91 
 
 		 298 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22480  transcriptional regulator  39.19 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.542371 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2097  LysR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 306 aa  156  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.732708  normal  0.0491263 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2134  transcriptional regulator, LysR family  36.59 
 
 		 287 aa  156  5.0000000000000005e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4368  LysR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 300 aa  155  6e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000508648  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0540  transcriptional regulator, LysR family  35.14 
 
 		 291 aa  155  8e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15621  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1625  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 298 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36460  transcriptional regulator  43.08 
 
 		 304 aa  154  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.776376  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4546  LysR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 300 aa  152  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  35.91 
 
 		 312 aa  151  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5125  LysR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 296 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932924  normal  0.723753 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1104  transcriptional regulator, LysR family  36.24 
 
 		 298 aa  149  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1321  transcriptional regulator, LysR family  36.12 
 
 		 308 aa  149  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  0.107974 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19590  transcriptional regulator  40.82 
 
 		 311 aa  149  6e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.221792  normal  0.0758544 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2567  LysR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259086  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2545  transcriptional regulator, LysR family  35.12 
 
 		 309 aa  147  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.794961 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 305 aa  145  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1422  LysR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00195938  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3118  transcriptional regulator, LysR family  35.6 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181053  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3999  transcriptional regulator, LysR family  37.87 
 
 		 311 aa  143  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  37.13 
 
 		 315 aa  142  9e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0303  LysR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 307 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6247  transcriptional regulator, LysR family  34.47 
 
 		 328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4424  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 292 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2254  LysR family transcriptional regulator  35 
 
 		 314 aa  140  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4632  transcriptional regulator, LysR family  39.2 
 
 		 295 aa  138  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  32.78 
 
 		 301 aa  138  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6522  transcriptional regulator, LysR family  36.45 
 
 		 300 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6871  LysR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 283 aa  136  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0129  transcriptional regulator, LysR family  35.38 
 
 		 315 aa  135  9e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00685914  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2872  transcriptional regulator, LysR family  32.21 
 
 		 302 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3856  transcriptional regulator, LysR family  35.34 
 
 		 313 aa  134  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00162069  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2031  transcriptional regulator, LysR family  33.44 
 
 		 333 aa  133  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205829  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3489  LysR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 323 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3552  LysR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 323 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3502  LysR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 323 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5552  putative transcriptional regulator protein, LysR family  32.55 
 
 		 303 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0716  transcriptional regulator, LysR family  37.29 
 
 		 308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.711839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 301 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2508  LysR substrate-binding protein  35.22 
 
 		 316 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6763  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 303 aa  129  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 288 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3675  transcriptional regulator, LysR family  32.63 
 
 		 303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0582  transcriptional regulator, LysR family  35.55 
 
 		 312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2340  transcriptional regulator, LysR family  31.27 
 
 		 302 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  0.887111 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2648  transcriptional regulator, LysR family  37.1 
 
 		 306 aa  125  7e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7065  transcriptional regulator, LysR family  34.25 
 
 		 294 aa  125  8.000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2582  LysR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 313 aa  125  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2098  LysR family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 312 aa  124  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0305237  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  34.4 
 
 		 327 aa  124  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4246  transcriptional regulator, LysR family  34.93 
 
 		 295 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20222  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34330  transcriptional regulator  33.22 
 
 		 308 aa  124  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3454  LysR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 298 aa  123  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6287  transcriptional regulator, LysR family  34.81 
 
 		 304 aa  122  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4100  transcriptional regulator, LysR family  34.63 
 
 		 319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  0.0246683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1507  transcriptional regulator, LysR family  34.75 
 
 		 288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.74974  normal  0.352143 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3886  LysR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 311 aa  120  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9290  LysR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 311 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5689  transcriptional regulator, LysR family  34.6 
 
 		 314 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4076  transcriptional regulator, LysR family  32.35 
 
 		 331 aa  119  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5879  LysR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 299 aa  119  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.927972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2616  transcriptional regulator, LysR family  36.71 
 
 		 306 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000734486  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2292  transcriptional regulator, LysR family  32.97 
 
 		 315 aa  117  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.863525  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4403  LysR substrate-binding protein  32.53 
 
 		 303 aa  117  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.900242  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5656  LysR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 305 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601684 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1796  transcriptional regulator, LysR family  35.18 
 
 		 308 aa  116  5e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2541  ArsR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 307 aa  115  6e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204275  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1853  transcriptional regulator, LysR family  38.25 
 
 		 350 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54026 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3720  LysR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.101076  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4648  LysR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3497  transcriptional regulator, LysR family  34.95 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137062 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2988  transcriptional regulator, LysR family  28.09 
 
 		 300 aa  112  6e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.8288  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4824  transcriptional regulator, LysR family  32.99 
 
 		 308 aa  112  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00015803  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8854  LysR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 375 aa  112  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1552  LysR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 297 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122604 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3170  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 294 aa  112  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1001  LysR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2822  transcriptional regulator, LysR family  32.98 
 
 		 310 aa  111  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.438739  normal  0.714096 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3618  LysR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4749  LysR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0228204 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1749  LysR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 337 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.301666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  29.17 
 
 		 301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1980  LysR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 329 aa  110  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.362231  normal  0.28719 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3090  transcriptional regulator, LysR family  31.53 
 
 		 283 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3713  LysR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 334 aa  110  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7868  transcriptional regulator, LysR family  34.44 
 
 		 296 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.365024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6150  LysR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 295 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0301422 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2386  transcriptional regulator, LysR family  34.54 
 
 		 309 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00159604  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26681  putative Rubisco transcriptional regulator  30.52 
 
 		 323 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2018  LysR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 304 aa  109  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5397  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.88 
 
 		 297 aa  109  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>