More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1937 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1937  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 291 aa  595  1e-169  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1414  LysR family transcriptional regulator  83.74 
 
 		 290 aa  512  1e-144  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.832122 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1575  LysR family transcriptional regulator  83.39 
 
 		 278 aa  487  1e-137  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.684291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1982  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  41.61 
 
 		 290 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0403422 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2172  transcriptional regulator, LysR family  41.26 
 
 		 290 aa  236  4e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25457  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1515  LysR family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 292 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1984  LysR family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 292 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.958357  normal  0.045506 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2454  LysR family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 321 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.332878  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3775  LysR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 292 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2087  LysR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 299 aa  234  2.0000000000000002e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.589785  normal  0.993199 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1547  LysR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 292 aa  232  6e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.240499 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23730  LysR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 297 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0194065 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2090  LysR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 293 aa  231  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.115384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2011  LysR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 297 aa  230  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34290  Transcriptional regualtor, LysR family  40.91 
 
 		 294 aa  229  4e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1888  LysR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 306 aa  228  8e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0674933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2724  LysR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 293 aa  226  4e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0713788  normal  0.0834627 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02614  transcriptional regulator LysR family  41.61 
 
 		 296 aa  219  3e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1244  transcriptional regulator, LysR family  40.56 
 
 		 286 aa  212  5.999999999999999e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1566  LysR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 295 aa  186  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1720  transcriptional regulator, LysR family  36.8 
 
 		 294 aa  160  2e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.820276  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1345  transcriptional regulator, LysR family  34.84 
 
 		 290 aa  159  6e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.515489  normal  0.2022 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  30.93 
 
 		 301 aa  122  5e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0456  LysR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 294 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05450  transcriptional regulator, LysR family  28.17 
 
 		 296 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0434511  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0355  hypothetical protein  29.01 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01751  putative Rubisco transcriptional regulator  32.53 
 
 		 317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.348697  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2271  LysR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 300 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  29.96 
 
 		 300 aa  113  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2455  transcriptional regulator, LysR family  29.96 
 
 		 300 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2439  LysR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 300 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2533  transcriptional regulator, LysR family  29.96 
 
 		 300 aa  113  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00448001  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0149  putative Rubisco transcriptional regulator  31.34 
 
 		 319 aa  112  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1615  LysR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 299 aa  112  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.979938  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2065  LysR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 320 aa  112  6e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.102765  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 300 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  29.57 
 
 		 300 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  0.00000808392 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01621  putative Rubisco transcriptional regulator  30.14 
 
 		 322 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2188  LysR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.540994  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0295  putative Rubisco transcriptional regulator  29.39 
 
 		 331 aa  111  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1477  LysR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01641  putative Rubisco transcriptional regulator  30.63 
 
 		 314 aa  109  5e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.569388  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1151  transcriptional regulator, LysR family  32.02 
 
 		 302 aa  109  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2244  LysR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 305 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3732  transcriptional regulator, LysR family  31.05 
 
 		 300 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000560912  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01661  putative Rubisco transcriptional regulator  30.63 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3322  transcriptional regulator, LysR family  27.11 
 
 		 296 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151906  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2398  putative Rubisco transcriptional regulator  29.74 
 
 		 329 aa  106  5e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1791  LysR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 290 aa  106  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.027343 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2418  transcriptional regulator, LysR family  31.67 
 
 		 312 aa  105  6e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1236  transcriptional regulator, LysR family  28.01 
 
 		 292 aa  105  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.387856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2282  LysR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 299 aa  105  8e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000573268  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1855  transcriptional regulator, LysR family  31.1 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1980  LysR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 329 aa  104  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.362231  normal  0.28719 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0271  LysR family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0648353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3156  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.46 
 
 		 325 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.46065  normal  0.121521 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4616  LysR family regulatory protein  26.48 
 
 		 295 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4531  LysR family regulatory protein  26.48 
 
 		 295 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4666  LysR family regulatory protein  26.48 
 
 		 295 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4523  LysR family regulatory protein  26.48 
 
 		 295 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4614  LysR family regulatory protein  26.48 
 
 		 295 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.342206 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26681  putative Rubisco transcriptional regulator  29.31 
 
 		 323 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3036  transcriptional regulator, LysR family  28.33 
 
 		 288 aa  103  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000194633  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3117  transcriptional regulator, LysR family  31.01 
 
 		 306 aa  103  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4470  transcriptional regulator, LysR family  27.43 
 
 		 311 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0844089  normal  0.102172 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1985  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  29.03 
 
 		 300 aa  103  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.464368 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3313  LysR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 302 aa  103  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.600178  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4604  transcriptional regulator, LysR family  27.43 
 
 		 311 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0468  transcriptional regulator, LysR family  30.07 
 
 		 327 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0482  transcriptional regulator, LysR family  30.07 
 
 		 327 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.545808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0497  LysR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 294 aa  102  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.479645  normal  0.474406 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0509  transcriptional regulator, LysR family  26.71 
 
 		 293 aa  102  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.187244  hitchhiker  0.00160332 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2329  transcriptional regulator, LysR family  27.2 
 
 		 324 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2380  transcriptional regulator, LysR family  27.2 
 
 		 324 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  26.01 
 
 		 302 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0342  transcriptional regulator, LysR family  30.42 
 
 		 336 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0332  hypothetical protein  28.24 
 
 		 296 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1370  transcriptional regulator, LysR family  29.3 
 
 		 313 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173382  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2736  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  26.92 
 
 		 294 aa  100  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0284  LysR family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 294 aa  100  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2009  LysR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 334 aa  100  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.476347  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1084  LysR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000126748  hitchhiker  0.00000896339 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2494  transcriptional regulator, LysR family  27.56 
 
 		 322 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1345  transcriptional regulator, LysR family  25.5 
 
 		 307 aa  99.8  4e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0070  LysR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 296 aa  99.8  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5945  transcriptional regulator, LysR family  29.25 
 
 		 307 aa  99.8  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1599  transcriptional regulator, LysR family  27.39 
 
 		 320 aa  99.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.546474 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0309  transcriptional regulator, LysR family protein  26.03 
 
 		 289 aa  99.4  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1779  hydrogen peroxide-inducible genes activator  26.12 
 
 		 296 aa  99  7e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0660  LysR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 299 aa  99  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.558378 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2549  LysR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 337 aa  98.6  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.30655  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3454  LysR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 298 aa  98.2  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1778  hydrogen peroxide-inducible genes activator  26.72 
 
 		 296 aa  98.2  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1650  LysR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 301 aa  98.6  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1242  LysR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 309 aa  98.2  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00379242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1825  LysR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 302 aa  98.6  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0800  transcriptional regulator CysB-like protein  31.37 
 
 		 313 aa  98.2  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1717  transcriptional regulator  26.03 
 
 		 314 aa  97.8  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1050  LysR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 304 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.389314 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>