More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1575 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1575  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 278 aa  570  1e-161  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.684291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1414  LysR family transcriptional regulator  99.28 
 
 		 290 aa  566  1e-160  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.832122 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1937  LysR family transcriptional regulator  83.39 
 
 		 291 aa  487  1e-137  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2087  LysR family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 299 aa  236  4e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.589785  normal  0.993199 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2172  transcriptional regulator, LysR family  43.01 
 
 		 290 aa  230  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25457  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1982  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  42.28 
 
 		 290 aa  230  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0403422 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2454  LysR family transcriptional regulator  44.28 
 
 		 321 aa  228  6e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.332878  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1515  LysR family transcriptional regulator  43.22 
 
 		 292 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1984  LysR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 292 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.958357  normal  0.045506 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34290  Transcriptional regualtor, LysR family  42.86 
 
 		 294 aa  225  6e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23730  LysR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 297 aa  225  6e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0194065 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3775  LysR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 292 aa  225  6e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2011  LysR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 297 aa  224  9e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2724  LysR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0713788  normal  0.0834627 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1547  LysR family transcriptional regulator  42.49 
 
 		 292 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.240499 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1888  LysR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 306 aa  219  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0674933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2090  LysR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 293 aa  215  5e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.115384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02614  transcriptional regulator LysR family  41.91 
 
 		 296 aa  211  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1244  transcriptional regulator, LysR family  40.29 
 
 		 286 aa  202  6e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1566  LysR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 295 aa  176  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1345  transcriptional regulator, LysR family  35.74 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.515489  normal  0.2022 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1720  transcriptional regulator, LysR family  35.45 
 
 		 294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.820276  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  30.63 
 
 		 301 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  31.14 
 
 		 300 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  0.00000808392 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4531  LysR family regulatory protein  27.84 
 
 		 295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4666  LysR family regulatory protein  27.84 
 
 		 295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4616  LysR family regulatory protein  27.84 
 
 		 295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4523  LysR family regulatory protein  27.84 
 
 		 295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1477  LysR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4614  LysR family regulatory protein  27.84 
 
 		 295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.342206 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2455  transcriptional regulator, LysR family  30.7 
 
 		 300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2271  LysR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2439  LysR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  30.7 
 
 		 300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0271  LysR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 295 aa  112  6e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0648353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2533  transcriptional regulator, LysR family  30.7 
 
 		 300 aa  112  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00448001  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05450  transcriptional regulator, LysR family  27.86 
 
 		 296 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0434511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2188  LysR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.540994  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0355  hypothetical protein  27.69 
 
 		 293 aa  109  6e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0456  LysR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 294 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2736  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  28.35 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2244  LysR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2065  LysR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 320 aa  106  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.102765  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3322  transcriptional regulator, LysR family  28 
 
 		 296 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151906  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0295  putative Rubisco transcriptional regulator  29.07 
 
 		 331 aa  105  7e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2398  putative Rubisco transcriptional regulator  28.72 
 
 		 329 aa  103  3e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3313  LysR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 302 aa  103  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.600178  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0509  transcriptional regulator, LysR family  26.98 
 
 		 293 aa  102  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.187244  hitchhiker  0.00160332 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1791  LysR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 290 aa  102  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.027343 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1650  LysR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 301 aa  101  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3156  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.26 
 
 		 325 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.46065  normal  0.121521 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01751  putative Rubisco transcriptional regulator  30.4 
 
 		 317 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.348697  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2673  LysR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 303 aa  99.8  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1599  transcriptional regulator, LysR family  28.51 
 
 		 320 aa  99.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.546474 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1615  LysR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 299 aa  99.8  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.979938  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2710  transcriptional regulator, LysR family  28.27 
 
 		 309 aa  99.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.79073 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0149  putative Rubisco transcriptional regulator  29.48 
 
 		 319 aa  99.4  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3406  transcriptional regulator, LysR family  28.27 
 
 		 309 aa  99.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1155  transcriptional regulator, LysR family  25.18 
 
 		 294 aa  99  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0187  transcriptional regulator, LysR family  25.44 
 
 		 322 aa  98.6  9e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.502015  normal  0.832957 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3809  LysR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 285 aa  98.2  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4085  transcriptional regulator, LysR family  25.18 
 
 		 294 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0468  transcriptional regulator, LysR family  27.97 
 
 		 327 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4031  LysR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 294 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3892  LysR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 294 aa  98.2  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.940003  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3724  LysR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 294 aa  98.6  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3740  LysR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 294 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0342  transcriptional regulator, LysR family  28.92 
 
 		 336 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3997  transcriptional regulator, LysR family  25.18 
 
 		 294 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0482  transcriptional regulator, LysR family  27.97 
 
 		 327 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.545808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1684  LysR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 299 aa  98.2  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00688867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4195  LysR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 294 aa  98.2  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4102  transcriptional regulator, LysR family  25.18 
 
 		 294 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.33917  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01641  putative Rubisco transcriptional regulator  29.1 
 
 		 314 aa  98.6  1e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.569388  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2494  transcriptional regulator, LysR family  25.64 
 
 		 322 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1985  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  29.21 
 
 		 300 aa  97.8  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.464368 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1084  LysR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 297 aa  97.4  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000126748  hitchhiker  0.00000896339 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1980  LysR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 329 aa  97.4  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.362231  normal  0.28719 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4872  LysR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 295 aa  97.4  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.511733  normal  0.704501 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1050  LysR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 304 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.389314 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26681  putative Rubisco transcriptional regulator  28.12 
 
 		 323 aa  97.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0660  LysR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 299 aa  97.1  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.558378 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2640  RuBisCO operon transcriptional regulator  27.8 
 
 		 305 aa  96.3  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0332  hypothetical protein  26.86 
 
 		 296 aa  96.3  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1717  transcriptional regulator  27.07 
 
 		 314 aa  96.3  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0284  LysR family transcriptional regulator  23.13 
 
 		 294 aa  96.7  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01661  putative Rubisco transcriptional regulator  29.1 
 
 		 314 aa  96.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0800  transcriptional regulator CysB-like protein  30.11 
 
 		 313 aa  96.7  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1370  transcriptional regulator, LysR family  28.69 
 
 		 313 aa  95.9  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173382  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1236  transcriptional regulator, LysR family  26.05 
 
 		 292 aa  95.5  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.387856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3365  LysR substrate-binding  28 
 
 		 320 aa  95.5  9e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.415783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3036  transcriptional regulator, LysR family  27.17 
 
 		 288 aa  95.1  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000194633  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0497  LysR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 294 aa  95.1  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.479645  normal  0.474406 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2226  LysR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 319 aa  94.7  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2120  LysR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 292 aa  94.7  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.112359  normal  0.184045 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1945  LysR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 300 aa  95.1  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.551445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01621  putative Rubisco transcriptional regulator  27.4 
 
 		 322 aa  94.7  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0269  hypothetical protein  27.97 
 
 		 294 aa  94.7  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>