More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_3809 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_3809  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 285 aa  584  1e-166  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4031  LysR family transcriptional regulator  97.89 
 
 		 294 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3724  LysR family transcriptional regulator  97.89 
 
 		 294 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3740  LysR family transcriptional regulator  97.89 
 
 		 294 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4102  transcriptional regulator, LysR family  97.89 
 
 		 294 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.33917  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3997  transcriptional regulator, LysR family  97.89 
 
 		 294 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4085  transcriptional regulator, LysR family  97.89 
 
 		 294 aa  573  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1155  transcriptional regulator, LysR family  97.19 
 
 		 294 aa  571  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3892  LysR family transcriptional regulator  97.54 
 
 		 294 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.940003  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4195  LysR family transcriptional regulator  97.54 
 
 		 294 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2684  LysR family transcriptional regulator  93.68 
 
 		 285 aa  551  1e-156  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00184293  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0328  LysR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 284 aa  190  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0712  LysR substrate-binding  32.63 
 
 		 288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.471383  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0696  LysR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.820352  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2065  LysR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 320 aa  126  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.102765  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3211  LysR family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 283 aa  101  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1414  LysR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 290 aa  100  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.832122 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0883  transcriptional regulator, LysR family  26.07 
 
 		 291 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000429967 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3297  LysR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 283 aa  99.8  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3514  transcriptional regulator, LysR family  26.95 
 
 		 283 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3557  LysR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 283 aa  99.8  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.423553  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1855  transcriptional regulator, LysR family  24.59 
 
 		 308 aa  99.8  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3267  LysR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 283 aa  99.4  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.486644  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1575  LysR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 278 aa  98.2  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.684291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2579  LysR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 295 aa  97.1  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0667256 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2199  transcriptional regulator, LysR family  26.05 
 
 		 298 aa  96.3  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0054  LysR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 304 aa  95.9  7e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0309  transcriptional regulator, LysR family protein  26.69 
 
 		 289 aa  95.5  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2736  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  25.2 
 
 		 294 aa  95.5  8e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0132  LysR family transcriptional regulator  24.33 
 
 		 302 aa  95.1  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3511  LysR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 283 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0497  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 294 aa  95.5  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.479645  normal  0.474406 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6597  transcriptional regulator, LysR family  24.34 
 
 		 295 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0290538  normal  0.188655 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0150  transcriptional regulator, LysR family  24.33 
 
 		 307 aa  95.5  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0174  LysR family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 304 aa  94  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1389  LysR family transcriptional regulator  22.34 
 
 		 295 aa  94  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4969  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 297 aa  93.2  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2055  LysR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 302 aa  92.8  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.505103  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2282  LysR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 299 aa  92.8  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000573268  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3522  transcriptional regulator, LysR family  26.88 
 
 		 283 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1747  transcriptional regulator, LysR family  25.79 
 
 		 283 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.337394  normal  0.482419 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2327  transcriptional regulator CysB  34.48 
 
 		 324 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184075  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1768  transcriptional regulator CysB  34.48 
 
 		 324 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000142013 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3443  transcriptional regulator CysB  34.48 
 
 		 324 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0457028  hitchhiker  0.00255719 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1928  transcriptional regulator CysB  34.48 
 
 		 324 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0221409  hitchhiker  0.0000000000199307 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2819  LysR family transcriptional regulator  22.6 
 
 		 304 aa  92  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.664113  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3775  LysR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 292 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2546  transcriptional regulator CysB  34.56 
 
 		 324 aa  92  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000891923 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2885  LysR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 298 aa  91.7  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0745668  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1515  LysR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 292 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2087  LysR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 299 aa  92  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.589785  normal  0.993199 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3501  transcriptional regulator, LysR family  26.88 
 
 		 283 aa  92  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0701  transcriptional regulator, LysR family  29.59 
 
 		 307 aa  91.3  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3960  LysR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 320 aa  90.9  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.583838  normal  0.331614 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1984  LysR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 292 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.958357  normal  0.045506 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2469  transcriptional regulator CysB  33.83 
 
 		 324 aa  90.9  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1583  transcriptional regulator CysB  36.03 
 
 		 325 aa  90.9  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5763  LysR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 316 aa  91.3  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5280  LysR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 297 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2279  Cys regulon transcriptional activator  34.56 
 
 		 324 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0003435  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1937  LysR family transcriptional regulator  23.1 
 
 		 291 aa  90.5  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4870  transcriptional regulator, LysR family  26.51 
 
 		 298 aa  90.1  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1507  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  23.05 
 
 		 304 aa  90.5  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0237757  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4003  transcriptional regulator CysB  33.79 
 
 		 324 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.260583  normal  0.45598 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1877  LysR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 297 aa  90.5  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000269934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1667  transcriptional regulator CysB  33.76 
 
 		 324 aa  90.5  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00185974  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4870  LysR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 297 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5293  transcriptional regulator, LysR family  24.9 
 
 		 297 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1720  LysR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 289 aa  89  7e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178865  normal  0.0235109 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5338  transcriptional regulator, LysR family  24.9 
 
 		 297 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2649  transcriptional regulator CysB  33.09 
 
 		 324 aa  89  7e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0873  LysR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 299 aa  89  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2248  transcriptional regulator CysB  33.09 
 
 		 325 aa  89.4  7e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.841929  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5687  LysR family transcriptional regulator  23.69 
 
 		 295 aa  89  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.145424 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2024  transcriptional regulator, LysR family  22.68 
 
 		 303 aa  89  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0238191  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4950  LysR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 335 aa  89  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1939  transcriptional regulator, LysR family  25.4 
 
 		 290 aa  89  9e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.514267  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1731  transcriptional regulator CysB  33.09 
 
 		 324 aa  89  9e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00171097  normal  0.293254 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1587  transcriptional regulator CysB  33.09 
 
 		 324 aa  89  9e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.296126  normal  0.104148 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1662  transcriptional regulator CysB  33.09 
 
 		 324 aa  89  9e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0319237  unclonable  0.0000181404 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2380  transcriptional regulator, LysR family  24.68 
 
 		 324 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7088  LysR family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 314 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4855  LysR family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 297 aa  88.6  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5664  transcriptional regulator, LysR family  24.9 
 
 		 297 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2056  HTH-type transcriptional regulator GltR  25.17 
 
 		 285 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2787  LysR family transcriptional regulator  21.83 
 
 		 305 aa  88.2  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4763  LysR family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 307 aa  87.8  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2172  transcriptional regulator, LysR family  22.38 
 
 		 290 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25457  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23140  transcriptional regulator CysB  33.82 
 
 		 324 aa  87.8  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2329  transcriptional regulator, LysR family  24.37 
 
 		 324 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1985  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  24.6 
 
 		 300 aa  87.8  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.464368 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3464  LysR family transcriptional regulator  22.39 
 
 		 316 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0269  LysR substrate-binding  27.06 
 
 		 298 aa  87.8  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1729  LysR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 291 aa  87.4  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0978912  normal  0.139934 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1979  transcriptional regulator CysB  33.82 
 
 		 323 aa  88.2  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1345  transcriptional regulator, LysR family  26.35 
 
 		 307 aa  87  3e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41870  transcriptional regulator CysB  33.1 
 
 		 324 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2077  transcriptional regulator CysB  33.82 
 
 		 324 aa  87  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047105 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3213  LysR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 283 aa  87.4  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.146504  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3553  transcriptional regulator CysB  33.1 
 
 		 324 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>