More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0355 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp0355  hypothetical protein  100 
 
 		 293 aa  597  1e-170  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0332  hypothetical protein  89.76 
 
 		 296 aa  527  1e-149  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1760  hypothetical protein  38.49 
 
 		 302 aa  193  2e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1760  hypothetical protein  38.14 
 
 		 302 aa  193  3e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2050  hypothetical protein  37.37 
 
 		 301 aa  185  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2060  hypothetical protein  36.68 
 
 		 301 aa  183  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2087  LysR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 299 aa  139  6e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.589785  normal  0.993199 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2454  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 321 aa  132  6e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.332878  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2724  LysR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0713788  normal  0.0834627 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1244  transcriptional regulator, LysR family  31.27 
 
 		 286 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23730  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0194065 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2011  LysR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 297 aa  126  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1888  LysR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 306 aa  125  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0674933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1547  LysR family transcriptional regulator  27 
 
 		 292 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.240499 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3775  LysR family transcriptional regulator  27 
 
 		 292 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1984  LysR family transcriptional regulator  27 
 
 		 292 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.958357  normal  0.045506 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1515  LysR family transcriptional regulator  27 
 
 		 292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1982  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  27.86 
 
 		 290 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0403422 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34290  Transcriptional regualtor, LysR family  27.38 
 
 		 294 aa  120  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2172  transcriptional regulator, LysR family  27.1 
 
 		 290 aa  119  7e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25457  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02614  transcriptional regulator LysR family  27.86 
 
 		 296 aa  119  7e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1414  LysR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 290 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.832122 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1566  LysR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1937  LysR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2090  LysR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 293 aa  115  8.999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.115384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1945  LysR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.551445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0456  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1993  transcriptional regulator, LysR family  28.41 
 
 		 319 aa  112  9e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1575  LysR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 278 aa  109  6e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.684291  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3255  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 297 aa  105  9e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.841591  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3192  LysR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 295 aa  103  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.863853  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3285  LysR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 297 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0242325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3543  LysR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 297 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3500  transcriptional regulator, LysR family  30.08 
 
 		 297 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3495  LysR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 297 aa  102  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0190038  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3313  LysR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 302 aa  102  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.600178  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1976  transcriptional regulator, LysR family  29.8 
 
 		 343 aa  102  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.66022  normal  0.44727 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3482  transcriptional regulator, LysR family  29.5 
 
 		 297 aa  102  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.26216  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1825  LysR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 302 aa  101  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1477  LysR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 302 aa  101  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2065  LysR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 320 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.102765  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2640  RuBisCO operon transcriptional regulator  24.63 
 
 		 305 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1767  transcriptional regulator, LysR family  28.62 
 
 		 297 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.114066  normal  0.776401 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0820  transcriptional regulator, LysR family  25.17 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3323  DNA-binding transcriptional regulator CynR  27.72 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2464  DNA-binding transcriptional regulator CynR  27.72 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1243  DNA-binding transcriptional regulator CynR  27.72 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0383  DNA-binding transcriptional regulator CynR  27.72 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  25.16 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3425  DNA-binding transcriptional regulator CynR  27.34 
 
 		 311 aa  99.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3462  DNA-binding transcriptional regulator CynR  27.34 
 
 		 311 aa  99.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356635  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1720  transcriptional regulator, LysR family  26.24 
 
 		 294 aa  100  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.820276  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3199  LysR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 297 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0827152  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2158  transcriptional regulator, LysR family  24.11 
 
 		 301 aa  99.4  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1817  transcriptional regulator, LysR family  24.11 
 
 		 303 aa  99.4  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0309  transcriptional regulator, LysR family protein  25.17 
 
 		 289 aa  99  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1175  LysR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 304 aa  98.2  1e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.852723  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1791  LysR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 290 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.027343 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2651  transcriptional regulator  28.45 
 
 		 316 aa  97.1  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1614  LysR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 311 aa  97.1  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.625262  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1345  transcriptional regulator, LysR family  26.17 
 
 		 290 aa  96.7  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.515489  normal  0.2022 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0727  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 298 aa  96.3  5e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0714  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 298 aa  96.3  5e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  27.49 
 
 		 302 aa  95.5  9e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3565  LysR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 303 aa  95.5  9e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116622  normal  0.0782096 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3732  transcriptional regulator, LysR family  23.61 
 
 		 300 aa  95.1  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000560912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2659  LysR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 313 aa  95.1  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3454  LysR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 298 aa  95.1  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1717  transcriptional regulator  27.2 
 
 		 314 aa  95.1  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0223  transcriptional regulator, LysR family  25.86 
 
 		 314 aa  95.1  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1555  LysR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 318 aa  95.1  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214293  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0044  LysR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 297 aa  95.5  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0266  LysR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 313 aa  95.1  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1599  transcriptional regulator, LysR family  26.17 
 
 		 320 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.546474 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3462  DNA-binding transcriptional regulator CynR  27.34 
 
 		 311 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0127  LysR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 311 aa  94.7  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.191807  hitchhiker  0.00233416 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3036  transcriptional regulator, LysR family  29.66 
 
 		 288 aa  94.7  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000194633  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0229  LysR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 306 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.00000000369009  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2282  LysR family transcriptional regulator  24.92 
 
 		 299 aa  93.6  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000573268  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0237  LysR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 306 aa  94  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000618389  unclonable  0.0000000000250683 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2671  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  25.93 
 
 		 313 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00916902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0127  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  26.88 
 
 		 305 aa  93.2  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.985261  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6329  transcriptional regulator, LysR family  26.24 
 
 		 299 aa  93.2  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0290063  hitchhiker  0.00524783 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2425  LysR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 308 aa  93.2  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.540189  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2796  LysR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 309 aa  93.6  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000015017  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1902  LysR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 292 aa  93.2  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1307  transcriptional regulator, LysR family  25.76 
 
 		 295 aa  93.2  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5108  LysR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 301 aa  92.8  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.336118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2080  transcriptional regulator, LysR family  28.86 
 
 		 295 aa  92.8  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0290  LysR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 309 aa  92.8  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000353581  unclonable  0.0000000000404999 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2158  LysR family transcriptional regulator  23.49 
 
 		 298 aa  92.4  8e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000128289  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2531  transcriptional regulator, LysR family  23.86 
 
 		 308 aa  92  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.351481  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0027  transcriptional regulatory protein  25.28 
 
 		 312 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000739069  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3859  LysR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 312 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000387155  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1310  ndhF3 operon transcriptional regulator  24.18 
 
 		 323 aa  91.7  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2159  transcriptional regulator, LysR family  23.86 
 
 		 308 aa  92  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.597139  hitchhiker  0.0000167573 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3119  transcriptional regulatory protein  25.28 
 
 		 312 aa  91.7  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234841  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3798  LysR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 312 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000000255369  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1726  LysR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 294 aa  91.7  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000302117  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3060  transcriptional regulator, LysR family  25.19 
 
 		 293 aa  92  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000262954  decreased coverage  0.0000000999677 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>