More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A4523 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A4523  LysR family regulatory protein  100 
 
 
295 aa  603  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4531  LysR family regulatory protein  100 
 
 
295 aa  603  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4614  LysR family regulatory protein  100 
 
 
295 aa  603  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.342206 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4666  LysR family regulatory protein  100 
 
 
295 aa  603  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54567  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4616  LysR family regulatory protein  100 
 
 
295 aa  603  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0271  LysR family transcriptional regulator  90.51 
 
 
295 aa  551  1e-156  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0648353  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4429  LysR family transcriptional regulator  68.04 
 
 
295 aa  394  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.353494  normal  0.612684 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1688  LysR family transcriptional regulator  44.25 
 
 
292 aa  275  7e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776975  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2922  LysR family transcriptional regulator  47.9 
 
 
319 aa  266  4e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3760  transcriptional regulator, LysR family  48.25 
 
 
320 aa  263  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1336  transcriptional regulator, LysR family  45.7 
 
 
297 aa  263  3e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.916876  normal  0.272272 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0176  LysR family transcriptional regulator  47.4 
 
 
334 aa  262  4e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1401  transcriptional regulator, LysR family  45.7 
 
 
297 aa  262  4e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.025944 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2769  LysR family transcriptional regulator  45.83 
 
 
307 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1873  LysR family transcriptional regulator  45.83 
 
 
307 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0236  LysR family transcriptional regulator  45.83 
 
 
307 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0024  LysR family transcriptional regulator  45.83 
 
 
307 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2679  LysR family transcriptional regulator  45.83 
 
 
307 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.626987  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0024  LysR family transcriptional regulator  45.83 
 
 
307 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3502  LysR family transcriptional regulator  45.83 
 
 
307 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0023  LysR family transcriptional regulator  45.83 
 
 
307 aa  259  3e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.189031  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0047  LysR family transcriptional regulator  47.02 
 
 
308 aa  258  9e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0026  LysR family transcriptional regulator  45.86 
 
 
308 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0044  LysR family transcriptional regulator  45.86 
 
 
308 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4084  LysR family transcriptional regulator  44.48 
 
 
302 aa  256  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1795  LysR family transcriptional regulator  43.99 
 
 
296 aa  255  7e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00491108  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0045  LysR family transcriptional regulator  46.18 
 
 
308 aa  255  7e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3228  LysR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
308 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.155209 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0063  LysR family transcriptional regulator  45.52 
 
 
308 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0036  LysR family transcriptional regulator  46.18 
 
 
308 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.565587  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0291  LysR family transcriptional regulator  44.26 
 
 
304 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0844  transcriptional regulator, LysR family  41.49 
 
 
295 aa  240  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.033432 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0856  LysR family transcriptional regulator  41.49 
 
 
295 aa  240  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.252777  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3514  LysR family transcriptional regulator  41.49 
 
 
295 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0347689  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0821  LysR family transcriptional regulator  41.49 
 
 
295 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0342019  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3435  LysR family transcriptional regulator  41.49 
 
 
295 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0107817  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0843  LysR family transcriptional regulator  41.13 
 
 
293 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3323  LysR family transcriptional regulator  41.49 
 
 
295 aa  238  9e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0711414  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0699  LysR family transcriptional regulator  41.49 
 
 
295 aa  237  2e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3153  LysR family transcriptional regulator  40.78 
 
 
295 aa  236  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00364917  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3562  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 
296 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0896  LysR family transcriptional regulator  40.77 
 
 
291 aa  231  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000948666 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0586  LysR family transcriptional regulator  41.34 
 
 
302 aa  229  3e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.364179  decreased coverage  0.000128837 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0551  transcriptional regulator, LysR family protein  39.58 
 
 
294 aa  229  4e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215454  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4335  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 
297 aa  223  3e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.385889  normal  0.337801 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0084  LysR family transcriptional regulator  42.61 
 
 
311 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446413  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0091  transcriptional regulator, LysR family  40.83 
 
 
311 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0101  transcriptional regulator, LysR family  40.83 
 
 
311 aa  206  5e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0243  LysR family transcriptional regulator  39 
 
 
302 aa  206  5e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2848  LysR family transcriptional regulator  35.84 
 
 
310 aa  203  3e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.93078  normal  0.0328698 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1693  LysR family transcriptional regulator  40.56 
 
 
300 aa  200  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19670  LysR family transcriptional regulator  40.56 
 
 
297 aa  199  5e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.663565  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4487  LysR family transcriptional regulator  37.72 
 
 
293 aa  195  7e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4627  LysR family transcriptional regulator  37.72 
 
 
293 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4611  LysR family transcriptional regulator  37.72 
 
 
293 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0937251  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0274  hypothetical protein  37.28 
 
 
294 aa  191  1e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2157  LysR family transcriptional regulator  32.52 
 
 
293 aa  190  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0269  hypothetical protein  37.06 
 
 
294 aa  189  5e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7208  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
293 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319627  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0909  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.29 
 
 
298 aa  185  7e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3794  transcriptional regulator, LysR family  37.99 
 
 
294 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.689518 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1575  transcriptional regulator, LysR family  32.77 
 
 
295 aa  181  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000381269  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0898  LysR family transcriptional regulator  37.02 
 
 
295 aa  178  8e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2565  LysR family transcriptional regulator  31.36 
 
 
292 aa  177  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2618  LysR substrate-binding  31.36 
 
 
292 aa  177  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3939  LysR family transcriptional regulator  36.24 
 
 
320 aa  173  3.9999999999999995e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2118  LysR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
294 aa  171  1e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1120  LysR family transcriptional regulator  36.71 
 
 
298 aa  169  3e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.359729  normal  0.248441 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0420  LysR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
296 aa  168  9e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0898  transcriptional regulator, LysR family  31.36 
 
 
293 aa  162  6e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0953  LysR family transcriptional regulator  31.51 
 
 
296 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0974  transcriptional regulator, LysR family  31.51 
 
 
296 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.966458  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3390  LysR family transcriptional regulator  31.51 
 
 
296 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0340  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 
296 aa  159  6e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0324  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 
296 aa  158  8e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0988  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 
296 aa  156  3e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3051  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 
296 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000517942  normal  0.0334887 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0884  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 
296 aa  154  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000164987  normal  0.231561 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0921  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 
296 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.422562  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1046  LysR family transcriptional regulator  32.19 
 
 
296 aa  152  8e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0266  LysR family transcriptional regulator  31.88 
 
 
307 aa  151  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2244  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 
305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0901  LysR family transcriptional regulator  30.14 
 
 
302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000228882 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0828  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
297 aa  146  5e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2736  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  28.67 
 
 
294 aa  145  8.000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3026  LysR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
296 aa  145  9e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2455  transcriptional regulator, LysR family  27.62 
 
 
300 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1389  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
295 aa  144  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148304  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1684  LysR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
299 aa  143  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00688867  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2271  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
300 aa  143  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
300 aa  143  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2439  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
300 aa  143  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0894  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
298 aa  143  4e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
300 aa  142  8e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2533  transcriptional regulator, LysR family  27.27 
 
 
300 aa  142  9e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00448001  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2188  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
300 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.540994  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1324  LysR family transcriptional regulator  29.62 
 
 
293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  26.92 
 
 
300 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  0.00000808392 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  26.92 
 
 
300 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2928  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
296 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0645759  normal  0.282889 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>