More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0673 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0673  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 289 aa  577  1e-164  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.102205  normal  0.750884 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1864  LysR family transcriptional regulator  48.79 
 
 		 294 aa  259  3e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2919  LysR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 290 aa  251  7e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.226862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3185  LysR family transcriptional regulator  44.06 
 
 		 295 aa  232  5e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.377934  normal  0.982451 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2000  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 289 aa  171  9e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.504431  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1778  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 289 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000761412  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1916  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 289 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0657607  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1757  LysR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 289 aa  170  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1735  LysR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 289 aa  170  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.173814  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3423  transcriptional regulator, LysR family  35.96 
 
 		 289 aa  171  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000235779 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1790  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 289 aa  168  8e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000399419  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1952  transcriptional regulator, LysR family  34.58 
 
 		 263 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000018508 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2021  transcriptional regulator, LysR family  34.17 
 
 		 263 aa  149  6e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000475915  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1920  transcriptional regulator, LysR family  34.17 
 
 		 263 aa  149  7e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.304852  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2928  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 290 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3211  transcriptional regulator, LysR family  29.64 
 
 		 290 aa  143  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3140  LysR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4995  LysR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 302 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.631415  normal  0.721068 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3036  transcriptional regulator, LysR family  28.72 
 
 		 288 aa  126  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000194633  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3922  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 298 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2418  transcriptional regulator  33.45 
 
 		 294 aa  125  9e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0285418 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1120  LysR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 298 aa  124  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.359729  normal  0.248441 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0586  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.66 
 
 		 304 aa  122  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4386  LysR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 303 aa  122  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.343439  normal  0.243257 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1761  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 300 aa  122  9e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.982692  normal  0.0243449 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2390  LysR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1416  LysR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.691659 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1376  LysR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.809674  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3373  hypothetical protein  29.74 
 
 		 292 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1368  LysR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 304 aa  119  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.114163 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3441  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 306 aa  118  9e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.985803  hitchhiker  0.000545962 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4335  LysR family transcriptional regulator  31.83 
 
 		 297 aa  118  9e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.385889  normal  0.337801 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1735  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0864805  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1512  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0180  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0000907778  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1067  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4486  LysR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1910  OsmT protein  32.53 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.580889  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0986  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1757  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.233098  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1470  LysR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3883  LysR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4596  LysR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 303 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00651674 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4132  LysR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 303 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.977393  normal  0.0579117 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3561  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 297 aa  115  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2569  LysR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 300 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0243965  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1494  LysR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1013  LysR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4749  LysR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0228204 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4635  LysR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.646338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2563  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00385912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3618  LysR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1001  LysR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 303 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2935  transcriptional regulator, LysR family  30.1 
 
 		 304 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5534  LysR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 306 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.162022  normal  0.470463 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1253  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 		 308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0013481  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2509  putative transcriptional regulator  30.65 
 
 		 292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2694  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000201069  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2773  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 		 308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000207011  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02308  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.57 
 
 		 308 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000841101  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5818  LysR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 298 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2543  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 308 aa  110  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000981621  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0055  LysR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 309 aa  110  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1735  LysR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1270  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 308 aa  110  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000010142  hitchhiker  0.000508597 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2417  putative transcriptional regulator  30.65 
 
 		 292 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02269  hypothetical protein  28.57 
 
 		 308 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000658143  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2625  putative transcriptional regulator  30.65 
 
 		 292 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.351429 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2466  putative transcriptional regulator  30.65 
 
 		 292 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.11864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2521  putative transcriptional regulator  27.17 
 
 		 292 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3638  transcriptional regulator, LysR family  29.35 
 
 		 308 aa  109  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000159787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0509  transcriptional regulator, LysR family  32.66 
 
 		 293 aa  109  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.187244  hitchhiker  0.00160332 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1084  LysR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 297 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000126748  hitchhiker  0.00000896339 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5293  transcriptional regulator, LysR family  31.97 
 
 		 297 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1680  LysR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 293 aa  108  9.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.21592  normal  0.237518 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0528  LysR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 301 aa  108  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000454001 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5664  transcriptional regulator, LysR family  31.97 
 
 		 297 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3178  LysR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125712  normal  0.0310919 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2826  LysR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1626  transcriptional regulator, LysR family  29.76 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0614386 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5263  transcriptional regulator, LysR family  31.97 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3056  LysR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.20426 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2523  LysR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0665746  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5280  LysR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 297 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19930  transcriptional regulator  25.96 
 
 		 294 aa  107  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2789  OsmT protein  28.52 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2683  OsmT protein  28.52 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.567691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2659  OsmT protein  28.52 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4970  transcriptional regulator, LysR family  32.31 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.126085  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2617  OsmT protein  28.52 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3296  putative transcriptional regulator  30.58 
 
 		 306 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2568  OsmT protein  28.52 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0008695  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5025  LysR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 297 aa  106  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4855  LysR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 297 aa  106  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5406  LysR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 297 aa  106  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4870  LysR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 297 aa  105  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0101  transcriptional regulator, LysR family  36.04 
 
 		 311 aa  105  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5338  transcriptional regulator, LysR family  31.56 
 
 		 297 aa  105  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 293 aa  105  8e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2936  LysR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 311 aa  105  8e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00477843  normal  0.111677 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>