More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCB4264_A1920 on replicon NC_011725
Organism: Bacillus cereus B4264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A2021  transcriptional regulator, LysR family  99.62 
 
 
263 aa  530  1e-150  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000475915  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1920  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 
263 aa  530  1e-150  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.304852  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1757  LysR family transcriptional regulator  96.96 
 
 
289 aa  523  1e-147  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1735  LysR family transcriptional regulator  95.82 
 
 
289 aa  517  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.173814  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1952  transcriptional regulator, LysR family  96.2 
 
 
263 aa  517  1e-146  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000018508 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2000  LysR family transcriptional regulator  95.44 
 
 
289 aa  514  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.504431  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1778  LysR family transcriptional regulator  95.06 
 
 
289 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000761412  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1916  LysR family transcriptional regulator  95.06 
 
 
289 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0657607  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3423  transcriptional regulator, LysR family  94.68 
 
 
289 aa  512  1e-144  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000235779 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1790  LysR family transcriptional regulator  93.92 
 
 
289 aa  507  1e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000399419  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2521  putative transcriptional regulator  38.24 
 
 
292 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2509  putative transcriptional regulator  38.24 
 
 
292 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2625  putative transcriptional regulator  38.24 
 
 
292 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.351429 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2417  putative transcriptional regulator  38.24 
 
 
292 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2466  putative transcriptional regulator  38.24 
 
 
292 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.11864 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2390  LysR family transcriptional regulator  36.97 
 
 
299 aa  168  7e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3373  hypothetical protein  36.97 
 
 
292 aa  167  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3211  transcriptional regulator, LysR family  35.91 
 
 
290 aa  165  8e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2928  LysR family transcriptional regulator  35.91 
 
 
290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2919  LysR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
290 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.226862  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3036  transcriptional regulator, LysR family  32.16 
 
 
288 aa  150  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000194633  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0673  LysR family transcriptional regulator  34.17 
 
 
289 aa  149  6e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.102205  normal  0.750884 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3185  LysR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
295 aa  142  7e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.377934  normal  0.982451 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1864  LysR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
294 aa  133  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3140  LysR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
295 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3883  LysR family transcriptional regulator  30.67 
 
 
298 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4486  LysR family transcriptional regulator  30.67 
 
 
298 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5818  LysR family transcriptional regulator  30.67 
 
 
298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1680  LysR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.21592  normal  0.237518 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4995  LysR family transcriptional regulator  30.25 
 
 
302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.631415  normal  0.721068 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19930  transcriptional regulator  29.55 
 
 
294 aa  129  7.000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169185  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1368  LysR family transcriptional regulator  29.83 
 
 
304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.114163 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0412  transcriptional regulator  33.33 
 
 
297 aa  121  9.999999999999999e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0159161  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1592  LysR family transcriptional regulator  31.09 
 
 
292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.030577  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2462  transcriptional regulator, LysR family  27.27 
 
 
294 aa  116  3.9999999999999997e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.341726  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3922  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
298 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4386  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
303 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.343439  normal  0.243257 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0807  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 
297 aa  108  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  29.96 
 
 
301 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03270  transcriptional regulator  26.97 
 
 
305 aa  107  3e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2935  transcriptional regulator, LysR family  29.81 
 
 
304 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3090  transcriptional regulator, LysR family  25.38 
 
 
283 aa  105  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2787  LysR family transcriptional regulator  30.22 
 
 
305 aa  105  8e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0101  transcriptional regulator, LysR family  31.79 
 
 
311 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2848  LysR family transcriptional regulator  25.91 
 
 
310 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.93078  normal  0.0328698 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0091  transcriptional regulator, LysR family  31.21 
 
 
311 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1224  LysR family transcriptional regulator  28.74 
 
 
289 aa  102  8e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3576  LysR family transcriptional regulator  28 
 
 
305 aa  102  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.300569  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1120  LysR family transcriptional regulator  28.45 
 
 
298 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.359729  normal  0.248441 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2418  transcriptional regulator  32.92 
 
 
294 aa  100  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0285418 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0084  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 
311 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446413  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2416  LysR family transcriptional regulator  27.76 
 
 
301 aa  100  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3761  redox-sensitive transcriptional activator OxyR  28.63 
 
 
314 aa  99.4  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2648  transcriptional regulator, LysR family  28.19 
 
 
306 aa  99  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  27.27 
 
 
300 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  0.00000808392 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4132  LysR family transcriptional regulator  29.36 
 
 
303 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.977393  normal  0.0579117 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003682  transcriptional regulator LysR family  24.71 
 
 
289 aa  97.4  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  27.64 
 
 
300 aa  96.7  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2617  OsmT protein  26.72 
 
 
308 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1913  LysR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
298 aa  96.3  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0283777  normal  0.375382 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1779  hydrogen peroxide-inducible genes activator  28.9 
 
 
296 aa  96.7  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4596  LysR family transcriptional regulator  28.51 
 
 
303 aa  96.7  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00651674 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0055  LysR family transcriptional regulator  26.75 
 
 
309 aa  96.7  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2568  OsmT protein  26.72 
 
 
308 aa  96.3  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0008695  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2789  OsmT protein  26.72 
 
 
308 aa  96.3  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3178  LysR family transcriptional regulator  27.45 
 
 
305 aa  95.9  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125712  normal  0.0310919 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2683  OsmT protein  26.72 
 
 
308 aa  96.3  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.567691  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2055  LysR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
302 aa  95.9  6e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.505103  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1778  hydrogen peroxide-inducible genes activator  28.9 
 
 
296 aa  95.9  6e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3181  LysR family transcriptional regulator  27.2 
 
 
299 aa  95.5  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2994  LysR family transcriptional regulator  26.46 
 
 
295 aa  95.5  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0317639  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1389  LysR family transcriptional regulator  25.95 
 
 
295 aa  95.5  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148304  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2659  OsmT protein  25.67 
 
 
308 aa  95.5  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2157  LysR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
293 aa  95.1  9e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2054  LysR family transcriptional regulator  25.38 
 
 
297 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142115  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2271  LysR family transcriptional regulator  26.14 
 
 
300 aa  94.7  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2439  LysR family transcriptional regulator  26.14 
 
 
300 aa  94.7  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3686  LysR family transcriptional regulator  25.38 
 
 
297 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6941  transcriptional regulator, LysR family  29.07 
 
 
298 aa  94.7  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  26.52 
 
 
300 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  26.14 
 
 
300 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  25.56 
 
 
302 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4934  LysR family transcriptional regulator  28.11 
 
 
304 aa  94  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.565253  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1684  LysR family transcriptional regulator  26.05 
 
 
299 aa  94.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00688867  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02139  transcriptional regulator  24.32 
 
 
289 aa  94  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0162  LysR family transcriptional regulator  30.65 
 
 
302 aa  93.6  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1171  LysR family transcriptional regulator  29.19 
 
 
325 aa  93.6  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2850  LysR family substrate binding transcriptional regulator  26.25 
 
 
290 aa  93.2  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.46504  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0858  transcriptional regulator  28.79 
 
 
296 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.311751  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0799  transcriptional regulator  28.79 
 
 
296 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.603179  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3618  LysR family transcriptional regulator  28.39 
 
 
303 aa  93.2  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4749  LysR family transcriptional regulator  28.39 
 
 
303 aa  93.2  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0228204 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3056  LysR family transcriptional regulator  29.82 
 
 
293 aa  92.8  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.20426 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1001  LysR family transcriptional regulator  28.81 
 
 
303 aa  92.8  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1883  transcriptional regulator, LysR family  28.2 
 
 
309 aa  92.8  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0687382  normal  0.7379 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2455  transcriptional regulator, LysR family  25.76 
 
 
300 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5151  LysR family transcriptional regulator  27.06 
 
 
302 aa  92.8  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.606064  normal  0.58822 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0827  transcriptional regulator  28.41 
 
 
296 aa  92.4  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.237922  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1573  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 
297 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117572  normal  0.71184 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2001  transcriptional regulator, LysR family  25.91 
 
 
298 aa  92.4  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.536649 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>