More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1592 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_1592  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 292 aa  578  1e-164  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.030577  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1790  LysR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 289 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000399419  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1735  LysR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 289 aa  139  6e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.173814  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2000  LysR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 289 aa  138  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.504431  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1757  LysR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 289 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1778  LysR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000761412  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1916  LysR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0657607  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3423  transcriptional regulator, LysR family  30.68 
 
 		 289 aa  133  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000235779 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1952  transcriptional regulator, LysR family  31.51 
 
 		 263 aa  122  8e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000018508 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1920  transcriptional regulator, LysR family  31.09 
 
 		 263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.304852  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2021  transcriptional regulator, LysR family  31.09 
 
 		 263 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000475915  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1680  LysR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.21592  normal  0.237518 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2521  putative transcriptional regulator  29.2 
 
 		 292 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2509  putative transcriptional regulator  29.3 
 
 		 292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2625  putative transcriptional regulator  29.3 
 
 		 292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.351429 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2417  putative transcriptional regulator  29.3 
 
 		 292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2466  putative transcriptional regulator  29.3 
 
 		 292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.11864 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5255  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 295 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.294771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3090  transcriptional regulator, LysR family  34.3 
 
 		 283 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3211  transcriptional regulator, LysR family  27.05 
 
 		 290 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4958  LysR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 295 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.468232 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3338  LysR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 295 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.714315  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5029  LysR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 295 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.534863  normal  0.59636 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4438  LysR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 295 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948245 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2833  LysR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 293 aa  99.8  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2815  LysR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 293 aa  99.8  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2958  LysR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 293 aa  99.8  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0543101 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2928  LysR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 290 aa  99.4  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1543  transcriptional regulator, LysR family  26.37 
 
 		 293 aa  99  8e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4995  LysR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 302 aa  96.7  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.631415  normal  0.721068 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2935  transcriptional regulator, LysR family  33.07 
 
 		 304 aa  96.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2054  LysR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 297 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3036  transcriptional regulator, LysR family  26.07 
 
 		 288 aa  94.4  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000194633  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0665  putative transcriptional regulator OxyR  25.94 
 
 		 301 aa  94  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3686  LysR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 297 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3883  LysR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 298 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4486  LysR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 298 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2390  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 299 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4552  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 307 aa  94  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1696  LysR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 293 aa  94  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5626  LysR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 316 aa  93.6  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0807108 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6374  LysR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 313 aa  93.2  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.436439 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0807  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 297 aa  93.6  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1573  LysR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 297 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117572  normal  0.71184 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6009  LysR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 322 aa  93.2  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.853275 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6028  LysR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 300 aa  92.8  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.171858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1621  LysR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 293 aa  92.8  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.358841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1691  LysR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 293 aa  92.8  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0709  transcriptional regulator OxyR, putative  25.6 
 
 		 301 aa  92.4  7e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3833  LysR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 301 aa  92  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1730  LysR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 293 aa  92  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1916  LysR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 293 aa  91.3  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5656  LysR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 305 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601684 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5095  transcriptional regulator, LysR family  31.73 
 
 		 302 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3373  hypothetical protein  27.27 
 
 		 292 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3479  LysR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 306 aa  90.9  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35259  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3806  LysR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 307 aa  90.9  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0545  transcriptional regulator, LysR family  25.9 
 
 		 305 aa  90.9  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5818  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 298 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3720  LysR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 305 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.101076  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4648  LysR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 305 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4982  LysR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 307 aa  89.7  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.960154 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2919  LysR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 290 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.226862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1309  LysR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 303 aa  89.4  7e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4828  transcriptional regulator, LysR family  29.07 
 
 		 291 aa  89.4  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1370  transcriptional regulator, LysR family  29.02 
 
 		 313 aa  89  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173382  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02400  transcriptional regulator  27.42 
 
 		 300 aa  89  9e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3185  LysR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 295 aa  89  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.377934  normal  0.982451 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3140  LysR family transcriptional regulator  21.72 
 
 		 295 aa  88.2  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4725  transcriptional regulator, LysR family  28.14 
 
 		 304 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255479  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0532  transcriptional regulator, LysR family  25.85 
 
 		 305 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5842  LysR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 302 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.328842  hitchhiker  0.000251126 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6323  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 294 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.482978  normal  0.771209 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1368  LysR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 304 aa  88.2  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.114163 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1930  LysR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 297 aa  87.8  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0417087 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3512  LysR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 304 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.069263  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1345  transcriptional regulator, LysR family  22.84 
 
 		 307 aa  86.7  4e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4509  LysR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 298 aa  86.7  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3576  LysR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 305 aa  86.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.300569  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2421  LysR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 312 aa  86.7  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.324279 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0434  transcriptional regulator, LysR family  30.16 
 
 		 312 aa  86.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.351851  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1164  transcriptional regulator, LysR family  31.28 
 
 		 302 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.221601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0884  LysR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 298 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3164  LysR family transcriptional regulator  26.3 
 
 		 297 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1366  LysR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 298 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0202  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  26.07 
 
 		 307 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2728  LysR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 304 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.159737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0334  transcriptional regulator, LysR family  26.96 
 
 		 323 aa  86.3  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.937617  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2418  transcriptional regulator  29.46 
 
 		 294 aa  85.9  7e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0285418 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3922  LysR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 298 aa  85.9  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3165  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  25 
 
 		 302 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2625  transcriptional regulator, LysR family  32 
 
 		 299 aa  85.5  9e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000460304  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0147  LysR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 312 aa  85.5  9e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2659  OsmT protein  27.46 
 
 		 308 aa  85.5  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4681  transcriptional regulator, LysR family  27.78 
 
 		 304 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.468795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0323  transcriptional regulator, LysR family  26.96 
 
 		 323 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.712215  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5025  transcriptional regulator, LysR family  28.78 
 
 		 295 aa  85.1  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.860643  normal  0.224116 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0528  LysR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 301 aa  85.5  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000454001 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0066  oxidative stress regulatory protein OxyR, putative  26.07 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1268  putative HTH-type transcriptional regulator YbhD  25.76 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>