More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3090 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3090  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 283 aa  544  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1790  LysR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 289 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000399419  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2390  LysR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 299 aa  133  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1735  LysR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 289 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.173814  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2521  putative transcriptional regulator  30.68 
 
 		 292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3373  hypothetical protein  29.92 
 
 		 292 aa  132  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2000  LysR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 289 aa  132  6e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.504431  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3036  transcriptional regulator, LysR family  27.97 
 
 		 288 aa  132  6e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000194633  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1757  LysR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 289 aa  132  9e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1778  LysR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000761412  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2417  putative transcriptional regulator  30.68 
 
 		 292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2466  putative transcriptional regulator  30.68 
 
 		 292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.11864 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1916  LysR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0657607  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2625  putative transcriptional regulator  30.68 
 
 		 292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.351429 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2509  putative transcriptional regulator  30.68 
 
 		 292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3423  transcriptional regulator, LysR family  25.87 
 
 		 289 aa  130  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000235779 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  36.86 
 
 		 316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2919  LysR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 290 aa  122  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.226862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3211  transcriptional regulator, LysR family  28.12 
 
 		 290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1680  LysR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 293 aa  119  6e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.21592  normal  0.237518 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2928  LysR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1952  transcriptional regulator, LysR family  26.15 
 
 		 263 aa  115  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000018508 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2021  transcriptional regulator, LysR family  25.77 
 
 		 263 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000475915  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1920  transcriptional regulator, LysR family  25.38 
 
 		 263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.304852  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5881  transcriptional regulator, LysR family  36.73 
 
 		 304 aa  113  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1592  LysR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 292 aa  113  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.030577  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0898  LysR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 295 aa  112  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2077  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 296 aa  112  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4335  LysR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.385889  normal  0.337801 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6024  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 298 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5818  LysR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3883  LysR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4486  LysR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1368  LysR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 304 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.114163 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2055  LysR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 302 aa  109  6e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.505103  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4995  LysR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.631415  normal  0.721068 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2291  LysR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 320 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11333  normal  0.519031 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1077  LysR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.134423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0767  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.16 
 
 		 306 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3140  LysR family transcriptional regulator  21.72 
 
 		 295 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2418  transcriptional regulator  32.18 
 
 		 294 aa  106  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0285418 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  33.44 
 
 		 327 aa  106  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2432  LysR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 320 aa  105  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0383  transcriptional regulator, LysR family  32.23 
 
 		 297 aa  105  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715241  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3185  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 295 aa  105  8e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.377934  normal  0.982451 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0509  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 293 aa  105  9e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.187244  hitchhiker  0.00160332 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2329  transcriptional regulator, LysR family  30.69 
 
 		 324 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4611  LysR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 293 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0937251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2380  transcriptional regulator, LysR family  29.55 
 
 		 324 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4657  LysR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 316 aa  103  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.933923 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2148  LysR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 329 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4627  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 293 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44500  Transcriptinal regulator, LysR family  30.2 
 
 		 301 aa  103  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.581761  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1236  transcriptional regulator, LysR family  36.9 
 
 		 292 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.387856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1708  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 311 aa  102  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211796 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3794  transcriptional regulator, LysR family  32.22 
 
 		 294 aa  102  6e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.689518 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1864  LysR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 294 aa  102  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2072  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 300 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1242  LysR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 293 aa  102  7e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.231339  normal  0.120176 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1141  LysR family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 297 aa  102  8e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.387698 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46680  Transcriptional regulator, LysR-family  33.08 
 
 		 297 aa  101  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1242  LysR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 309 aa  101  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00379242  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0914  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 301 aa  101  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2659  OsmT protein  32.42 
 
 		 308 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4616  LysR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.194737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2683  OsmT protein  32.42 
 
 		 308 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.567691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2617  OsmT protein  32.42 
 
 		 308 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2789  OsmT protein  32.42 
 
 		 308 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0147  LysR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 312 aa  100  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951871  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2173  transcriptional regulator, LysR family  29.43 
 
 		 308 aa  100  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2568  OsmT protein  32.42 
 
 		 308 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0008695  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1084  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000126748  hitchhiker  0.00000896339 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0673  LysR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 289 aa  100  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.102205  normal  0.750884 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1554  transcriptional regulator, LysR family  30.34 
 
 		 309 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.15921 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4487  LysR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 293 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  32.76 
 
 		 301 aa  99.8  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4012  LysR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 298 aa  99.8  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  29.41 
 
 		 300 aa  99.4  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1919  LysR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 314 aa  99.8  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.156623  normal  0.456297 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2935  transcriptional regulator, LysR family  30.45 
 
 		 304 aa  99.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4050  LysR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 308 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0274  hypothetical protein  27.6 
 
 		 294 aa  99.4  6e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2671  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.84 
 
 		 313 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00916902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3424  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 296 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1355  LysR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 296 aa  99.4  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1711  LysR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 311 aa  99.4  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316204  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2198  LysR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 300 aa  99.4  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0665  putative transcriptional regulator OxyR  34.68 
 
 		 301 aa  99.4  6e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1883  transcriptional regulator, LysR family  30.34 
 
 		 309 aa  99.4  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0687382  normal  0.7379 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0412  transcriptional regulator  23.79 
 
 		 297 aa  99  7e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0159161  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3056  LysR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 293 aa  99  8e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.20426 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5225  transcriptional regulator, LysR family  30.95 
 
 		 316 aa  99  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4244  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 298 aa  99  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.291884 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0091  transcriptional regulator, LysR family  34.48 
 
 		 311 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1110  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 300 aa  98.6  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5165  LysR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 298 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0084  LysR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 311 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446413  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2504  transcriptional regulator, LysR family  28.17 
 
 		 298 aa  98.6  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4367  LysR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 309 aa  98.6  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.764337  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3939  LysR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 320 aa  98.2  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>