More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2504 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2504  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 298 aa  607  9.999999999999999e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0586  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  48.45 
 
 		 304 aa  282  4.0000000000000003e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0528  LysR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 301 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000454001 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2659  OsmT protein  47.24 
 
 		 308 aa  279  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2617  OsmT protein  47.24 
 
 		 308 aa  279  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2683  OsmT protein  47.24 
 
 		 308 aa  279  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.567691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2568  OsmT protein  47.24 
 
 		 308 aa  279  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0008695  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2789  OsmT protein  47.24 
 
 		 308 aa  279  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3178  LysR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 305 aa  276  4e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125712  normal  0.0310919 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3441  LysR family transcriptional regulator  47.57 
 
 		 306 aa  275  7e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.985803  hitchhiker  0.000545962 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1735  LysR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 300 aa  273  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1626  transcriptional regulator, LysR family  46.05 
 
 		 300 aa  270  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0614386 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2826  LysR family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 300 aa  268  8e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2563  LysR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 308 aa  268  8.999999999999999e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00385912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2569  LysR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 300 aa  267  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0243965  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3638  transcriptional regulator, LysR family  46.71 
 
 		 308 aa  266  4e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000159787  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1253  transcriptional regulator, LysR family  46.71 
 
 		 308 aa  266  5e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0013481  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2773  transcriptional regulator, LysR family  46.71 
 
 		 308 aa  266  5e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000207011  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2694  LysR family transcriptional regulator  46.71 
 
 		 308 aa  266  5e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000201069  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02308  predicted DNA-binding transcriptional regulator  46.71 
 
 		 308 aa  265  8e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000841101  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2543  LysR family transcriptional regulator  46.71 
 
 		 308 aa  265  8e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000981621  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02269  hypothetical protein  46.71 
 
 		 308 aa  265  8e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000658143  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1270  LysR family transcriptional regulator  46.71 
 
 		 308 aa  265  8e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000010142  hitchhiker  0.000508597 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2936  LysR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 311 aa  263  2e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00477843  normal  0.111677 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2537  transcription regulator transcription regulator protein  46.92 
 
 		 297 aa  259  3e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1067  LysR family transcriptional regulator  47.08 
 
 		 300 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1735  LysR family transcriptional regulator  47.08 
 
 		 300 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0864805  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1910  OsmT protein  47.08 
 
 		 300 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.580889  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0180  LysR family transcriptional regulator  47.08 
 
 		 300 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0000907778  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1512  LysR family transcriptional regulator  47.08 
 
 		 300 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1757  LysR family transcriptional regulator  47.08 
 
 		 300 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.233098  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0986  LysR family transcriptional regulator  47.08 
 
 		 300 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1761  LysR family transcriptional regulator  47.08 
 
 		 300 aa  256  4e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.982692  normal  0.0243449 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1416  LysR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 300 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.691659 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1376  LysR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 300 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.809674  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2812  transcriptional regulator, LysR family  46.92 
 
 		 297 aa  249  3e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.260123  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2406  transcriptional regulator, LysR family  46.92 
 
 		 298 aa  249  5e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.237707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4635  LysR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 300 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.646338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1470  LysR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 300 aa  245  8e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1494  LysR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 300 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1013  LysR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 300 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4655  LysR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 310 aa  205  9e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0129573  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4367  LysR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 309 aa  190  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.764337  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5879  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 299 aa  185  9e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.927972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5397  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  37.19 
 
 		 297 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3806  LysR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 307 aa  181  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6026  transcriptional regulator, LysR family  34.58 
 
 		 323 aa  179  7e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.306271 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2261  LysR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 327 aa  178  9e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.015207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3576  LysR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.300569  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4552  LysR family transcriptional regulator  34.28 
 
 		 307 aa  172  9e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5504  LysR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 300 aa  170  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4699  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.254912  normal  0.0113206 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51620  LysR family transcriptional regulator protein  34.51 
 
 		 301 aa  161  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5523  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 322 aa  159  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.553864 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4982  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 307 aa  158  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.960154 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3479  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35259  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4814  transcriptional regulator, LysR family  34.6 
 
 		 299 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3737  transcriptional regulator, LysR family  34.6 
 
 		 299 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0298  LysR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.202952 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6260  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 307 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2421  LysR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 312 aa  157  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.324279 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3236  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.68 
 
 		 296 aa  155  9e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6427  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 307 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6662  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 307 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1671  LysR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0545  transcriptional regulator, LysR family  32.99 
 
 		 305 aa  152  5e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3294  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 294 aa  152  5e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.438685 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1817  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 310 aa  152  5e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.113228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1911  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 310 aa  152  5e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1913  LysR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 298 aa  152  5.9999999999999996e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0283777  normal  0.375382 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6374  LysR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 313 aa  152  8e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.436439 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4648  LysR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 305 aa  152  8e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3720  LysR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 305 aa  152  8e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.101076  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1573  LysR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 297 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117572  normal  0.71184 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5626  LysR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 316 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0807108 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1352  LysR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 305 aa  151  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3164  LysR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 297 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2054  LysR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 297 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3686  LysR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 297 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3056  LysR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 293 aa  150  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.20426 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5656  LysR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 305 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601684 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3073  LysR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 304 aa  149  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3334  transcriptional regulator, LysR family  30.14 
 
 		 302 aa  149  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02400  transcriptional regulator  30.14 
 
 		 300 aa  149  8e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2760  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 302 aa  148  9e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00129755  normal  0.164001 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3512  LysR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.069263  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1466  LysR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3393  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162722 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3296  putative transcriptional regulator  32.28 
 
 		 306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0532  transcriptional regulator, LysR family  31.62 
 
 		 305 aa  146  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4412  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 300 aa  147  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.481295  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0589  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 297 aa  146  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18480  transcriptional regulator  31.14 
 
 		 309 aa  146  5e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3454  transcriptional regulator, LysR family  32.62 
 
 		 296 aa  145  6e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3664  transcriptional regulator, LysR family  29.79 
 
 		 308 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0822  LysR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 317 aa  145  9e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.835428  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2590  transcriptional regulator, LysR family  29.76 
 
 		 317 aa  145  9e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2894  LysR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 317 aa  145  9e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0369741  normal  0.204254 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0871  transcriptional regulator, LysR family  29.76 
 
 		 317 aa  145  9e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2874  transcriptional regulator, LysR family  29.41 
 
 		 317 aa  144  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000130864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>