More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4995 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_4995  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 302 aa  603  9.999999999999999e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.631415  normal  0.721068 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1368  LysR family transcriptional regulator  86.49 
 
 		 304 aa  508  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.114163 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5818  LysR family transcriptional regulator  84.8 
 
 		 298 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3883  LysR family transcriptional regulator  84.8 
 
 		 298 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3922  LysR family transcriptional regulator  84.12 
 
 		 298 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4486  LysR family transcriptional regulator  84.8 
 
 		 298 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4386  LysR family transcriptional regulator  83.11 
 
 		 303 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.343439  normal  0.243257 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1757  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 289 aa  154  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1790  LysR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 289 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000399419  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2000  LysR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 289 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.504431  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1778  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 289 aa  153  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000761412  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1916  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 289 aa  153  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0657607  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3423  transcriptional regulator, LysR family  32.45 
 
 		 289 aa  152  5e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000235779 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1735  LysR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 289 aa  152  7e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.173814  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1920  transcriptional regulator, LysR family  30.25 
 
 		 263 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.304852  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2021  transcriptional regulator, LysR family  30.25 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000475915  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0673  LysR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 289 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.102205  normal  0.750884 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1952  transcriptional regulator, LysR family  28.99 
 
 		 263 aa  126  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000018508 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3036  transcriptional regulator, LysR family  30.04 
 
 		 288 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000194633  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3211  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 		 290 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2928  LysR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 290 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2919  LysR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 290 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.226862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3140  LysR family transcriptional regulator  26.3 
 
 		 295 aa  114  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2935  transcriptional regulator, LysR family  32 
 
 		 304 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2418  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 294 aa  105  8e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0285418 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5976  LysR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 316 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2509  putative transcriptional regulator  27.44 
 
 		 292 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2625  putative transcriptional regulator  27.44 
 
 		 292 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.351429 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2466  putative transcriptional regulator  27.44 
 
 		 292 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.11864 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2417  putative transcriptional regulator  27.44 
 
 		 292 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6272  LysR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 316 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3090  transcriptional regulator, LysR family  31.9 
 
 		 283 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2390  LysR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 299 aa  100  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2521  putative transcriptional regulator  26.89 
 
 		 292 aa  99  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1864  LysR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 294 aa  99  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1614  LysR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 311 aa  99  9e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.625262  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3185  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 295 aa  98.2  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.377934  normal  0.982451 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1680  LysR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 293 aa  98.6  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.21592  normal  0.237518 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3373  hypothetical protein  24.14 
 
 		 292 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0640  LysR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 318 aa  96.7  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404969  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1592  LysR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 292 aa  96.7  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.030577  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2077  LysR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 296 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6151  transcriptional regulator, LysR family  32.99 
 
 		 323 aa  95.1  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0589  LysR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 297 aa  93.2  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4070  LysR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 297 aa  93.2  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.409277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3720  LysR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 305 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.101076  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4648  LysR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 305 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3415  LysR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 386 aa  91.3  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17090  Transcriptional regulator, LysR family  26.09 
 
 		 299 aa  90.9  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5656  LysR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 305 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601684 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2803  LysR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 316 aa  91.3  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.765199 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1671  LysR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 296 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3205  LysR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 314 aa  91.3  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3454  LysR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 298 aa  90.9  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3561  LysR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 297 aa  90.5  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0284  LysR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 294 aa  90.5  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1120  LysR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 298 aa  90.1  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.359729  normal  0.248441 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05060  transcriptional regulator  30.49 
 
 		 297 aa  90.5  4e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8459  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 310 aa  90.1  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.983783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0970  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 303 aa  89.7  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4950  LysR family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 335 aa  89.4  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3512  LysR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 304 aa  89  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.069263  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3845  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  26.77 
 
 		 297 aa  88.6  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.249595  decreased coverage  0.0000000043089 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2101  transcriptional regulator, LysR family  31.4 
 
 		 304 aa  88.6  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.515959  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0266  LysR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 307 aa  87.4  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3296  putative transcriptional regulator  28.94 
 
 		 306 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5882  transcriptional regulator, LysR family  28.2 
 
 		 325 aa  87.4  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5919  LysR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 332 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0217311  normal  0.163471 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0412  transcriptional regulator  22.38 
 
 		 297 aa  87.8  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0159161  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2220  LysR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 317 aa  87  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  28.78 
 
 		 316 aa  87.4  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0276  transcriptional regulator, LysR family  30.63 
 
 		 295 aa  87.4  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.265614 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  30.63 
 
 		 327 aa  87.4  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2243  LysR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 302 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.839693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1110  LysR family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 300 aa  87  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6323  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 294 aa  86.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.482978  normal  0.771209 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4400  transcriptional regulator, LysR family  28.78 
 
 		 301 aa  86.7  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103907  hitchhiker  0.00279425 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3322  transcriptional regulator, LysR family  25.45 
 
 		 296 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151906  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2069  LysR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 295 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.450351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1141  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 297 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.387698 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4227  LysR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 345 aa  85.9  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5470  LysR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000367157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2243  LysR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 289 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0975  LysR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 309 aa  85.5  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417013 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3056  LysR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 293 aa  85.1  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.20426 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02400  transcriptional regulator  28.06 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3806  LysR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0586  LysR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 302 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.364179  decreased coverage  0.000128837 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1543  transcriptional regulator, LysR family  30.62 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114968 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2466  LysR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.708031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1684  LysR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00688867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1850  LysR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 328 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2461  LysR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 328 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3660  LysR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 295 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2282  LysR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000573268  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0833  LysR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 304 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1459  LysR family transcriptional regulator  28 
 
 		 311 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.828972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5176  transcriptional regulator, LysR family  28.03 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4609  transcriptional regulator, LysR family  33 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.461419 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2158  LysR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000128289  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>