More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BT9727_2928 on replicon NC_005957
Organism: Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_005957  BT9727_2928  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 290 aa  594  1e-169  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3211  transcriptional regulator, LysR family  94.48 
 
 		 290 aa  563  1e-160  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3140  LysR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 295 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3036  transcriptional regulator, LysR family  39.08 
 
 		 288 aa  227  2e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000194633  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0412  transcriptional regulator  37.14 
 
 		 297 aa  194  1e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0159161  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1757  LysR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 289 aa  193  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3423  transcriptional regulator, LysR family  36.84 
 
 		 289 aa  193  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000235779 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1735  LysR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 289 aa  192  5e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.173814  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2000  LysR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 289 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.504431  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1778  LysR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 289 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000761412  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1916  LysR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 289 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0657607  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1790  LysR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 289 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000399419  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19930  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 294 aa  176  3e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2462  transcriptional regulator, LysR family  31.25 
 
 		 294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.341726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03270  transcriptional regulator  32.87 
 
 		 305 aa  172  9e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2021  transcriptional regulator, LysR family  35.91 
 
 		 263 aa  165  9e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000475915  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1920  transcriptional regulator, LysR family  35.91 
 
 		 263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.304852  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1952  transcriptional regulator, LysR family  35.52 
 
 		 263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000018508 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2919  LysR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.226862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0673  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 289 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.102205  normal  0.750884 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2935  transcriptional regulator, LysR family  29.33 
 
 		 304 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2390  LysR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 299 aa  138  8.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3373  hypothetical protein  30.57 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1864  LysR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 294 aa  137  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3185  LysR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 295 aa  137  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.377934  normal  0.982451 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2418  transcriptional regulator  30.74 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0285418 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2521  putative transcriptional regulator  29.06 
 
 		 292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2509  putative transcriptional regulator  28.68 
 
 		 292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2417  putative transcriptional regulator  28.68 
 
 		 292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2466  putative transcriptional regulator  28.68 
 
 		 292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.11864 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2625  putative transcriptional regulator  28.68 
 
 		 292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.351429 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1597  putative transcriptional regulator LysR-type  32.43 
 
 		 308 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0551  transcriptional regulator, LysR family protein  32 
 
 		 294 aa  125  6e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215454  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2244  LysR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1825  LysR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 302 aa  123  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1110  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 300 aa  122  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  29.33 
 
 		 300 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  0.00000808392 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  28.81 
 
 		 300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4070  LysR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 297 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.409277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3562  LysR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 296 aa  119  6e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2710  transcriptional regulator, LysR family  28.79 
 
 		 309 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.79073 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3406  transcriptional regulator, LysR family  28.79 
 
 		 309 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5151  LysR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 302 aa  119  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.606064  normal  0.58822 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3561  LysR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 297 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3153  LysR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 295 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00364917  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2817  LysR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 296 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4995  LysR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 302 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.631415  normal  0.721068 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5470  LysR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 300 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000367157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  28.96 
 
 		 300 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3435  LysR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 295 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0107817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2179  LysR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0843  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1084  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000126748  hitchhiker  0.00000896339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5293  LysR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.382002 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0948  transcriptional regulator, LysR family  30.11 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0699  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  30 
 
 		 301 aa  117  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2416  LysR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 301 aa  117  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2159  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 303 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  27.39 
 
 		 302 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5916  LysR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 308 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2198  LysR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 300 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2161  LysR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 308 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2072  LysR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 300 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0807  LysR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2511  transcriptional regulator, LysR family  31.55 
 
 		 290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3323  LysR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0711414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0831  LysR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1001  LysR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0055  LysR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1543  transcriptional regulator, LysR family  29.07 
 
 		 298 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114968 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5262  LysR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 296 aa  114  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0804009  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2271  LysR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 300 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0856  LysR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 295 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.252777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4466  LysR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 316 aa  113  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0821  LysR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 295 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0342019  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2439  LysR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 300 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3514  LysR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 295 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0347689  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0844  transcriptional regulator, LysR family  29.71 
 
 		 295 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.033432 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3380  transcriptional regulator, LysR family  29.82 
 
 		 299 aa  113  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213081  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2455  transcriptional regulator, LysR family  27.95 
 
 		 300 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2282  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000573268  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17790  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2533  transcriptional regulator, LysR family  27.61 
 
 		 300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00448001  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3618  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1478  LysR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0854082  hitchhiker  0.000187974 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4749  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0228204 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2523  LysR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 298 aa  110  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0665746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2188  LysR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.540994  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0157  transcriptional regulator, LysR family  28.68 
 
 		 308 aa  110  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 305 aa  110  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1036  transcriptional regulator, LysR family  25.97 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1368  LysR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 304 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.114163 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3312  transcriptional regulator, LysR family  28.63 
 
 		 301 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.782402 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24800  transcriptional regulator  27.85 
 
 		 225 aa  110  4.0000000000000004e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1477  LysR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4548  LysR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 295 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456524 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3527  LysR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 324 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0977004 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>