More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0807 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_0807  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 297 aa  607  1e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2935  transcriptional regulator, LysR family  59.26 
 
 		 304 aa  350  2e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2418  transcriptional regulator  48.77 
 
 		 294 aa  259  3e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0285418 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0412  transcriptional regulator  30.88 
 
 		 297 aa  134  3e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0159161  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3036  transcriptional regulator, LysR family  28.22 
 
 		 288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000194633  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1778  LysR family transcriptional regulator  31 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000761412  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3423  transcriptional regulator, LysR family  31.27 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000235779 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1916  LysR family transcriptional regulator  31 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0657607  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1790  LysR family transcriptional regulator  30.55 
 
 		 289 aa  126  5e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000399419  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1735  LysR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 289 aa  125  9e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.173814  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1757  LysR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 289 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3211  transcriptional regulator, LysR family  29.34 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2000  LysR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 289 aa  124  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.504431  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1604  transcriptional regulator, LysR family  35.06 
 
 		 293 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.218506 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2928  LysR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 293 aa  110  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1920  transcriptional regulator, LysR family  30.61 
 
 		 263 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.304852  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2021  transcriptional regulator, LysR family  30.61 
 
 		 263 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000475915  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3185  LysR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.377934  normal  0.982451 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2625  transcriptional regulator, LysR family  34.66 
 
 		 299 aa  107  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000460304  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1952  transcriptional regulator, LysR family  29.8 
 
 		 263 aa  106  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000018508 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3056  LysR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 293 aa  105  9e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.20426 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0055  LysR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 309 aa  102  9e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2509  putative transcriptional regulator  30.2 
 
 		 292 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2390  LysR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 299 aa  100  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6150  LysR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 295 aa  99.8  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0301422 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2417  putative transcriptional regulator  30.89 
 
 		 292 aa  99.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3140  LysR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 295 aa  99.4  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2466  putative transcriptional regulator  30.89 
 
 		 292 aa  99.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.11864 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2625  putative transcriptional regulator  30.89 
 
 		 292 aa  99.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.351429 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3806  LysR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 307 aa  98.2  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2521  putative transcriptional regulator  29.93 
 
 		 292 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6818  transcriptional regulator, LysR family  31.28 
 
 		 294 aa  97.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3810  LysR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 372 aa  97.4  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1864  LysR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 294 aa  97.8  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19930  transcriptional regulator  27.82 
 
 		 294 aa  97.1  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3346  LysR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 328 aa  97.1  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3178  LysR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 305 aa  97.1  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125712  normal  0.0310919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8459  LysR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 310 aa  97.4  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.983783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003682  transcriptional regulator LysR family  30.81 
 
 		 289 aa  97.1  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3373  hypothetical protein  29.67 
 
 		 292 aa  96.7  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0362  LysR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 301 aa  96.7  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1692  LysR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 329 aa  96.3  6e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0958  transcriptional regulator, LysR family  33.85 
 
 		 298 aa  96.3  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.181705  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46680  Transcriptional regulator, LysR-family  30.51 
 
 		 297 aa  95.9  7e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0817  transcriptional regulator, LysR family  33.85 
 
 		 296 aa  95.9  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08961  transcriptional regulator, LysR family protein  31.25 
 
 		 312 aa  95.5  9e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01942  probable transcriptional regulator  29.44 
 
 		 287 aa  95.1  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.22412  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2919  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 290 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.226862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3170  LysR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 294 aa  95.5  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2462  transcriptional regulator, LysR family  27.57 
 
 		 294 aa  95.1  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.341726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26180  transcriptional regulator  25.84 
 
 		 302 aa  94.7  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2243  LysR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 289 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4132  LysR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 303 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.977393  normal  0.0579117 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1486  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 291 aa  95.5  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2659  OsmT protein  26.84 
 
 		 308 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0068  transcriptional regulator, LysR family  35.76 
 
 		 318 aa  94  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1592  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 292 aa  93.6  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.030577  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2789  OsmT protein  26.84 
 
 		 308 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2617  OsmT protein  26.84 
 
 		 308 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2683  OsmT protein  26.84 
 
 		 308 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.567691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2568  OsmT protein  26.84 
 
 		 308 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0008695  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0383  transcriptional regulator, LysR family  28.32 
 
 		 297 aa  93.2  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715241  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4596  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 303 aa  93.2  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00651674 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2098  LysR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 312 aa  92.4  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0305237  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03270  transcriptional regulator  26.77 
 
 		 305 aa  92.4  7e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6028  LysR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 300 aa  92.4  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.171858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3114  transcriptional regulator, LysR family  26.72 
 
 		 304 aa  91.7  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4460  LysR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 291 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.220159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1001  LysR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 303 aa  92  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3441  LysR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 306 aa  91.7  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.985803  hitchhiker  0.000545962 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1585  LysR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 306 aa  91.7  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.173107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1141  LysR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 297 aa  92  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.387698 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2886  LysR family transcriptional regulator  29 
 
 		 301 aa  91.7  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3996  LysR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 291 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4529  LysR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 294 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.393903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3236  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  29.67 
 
 		 296 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01621  putative Rubisco transcriptional regulator  32.68 
 
 		 322 aa  90.9  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1278  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 291 aa  90.9  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.492603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2340  transcriptional regulator, LysR family  34.04 
 
 		 313 aa  91.3  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51620  LysR family transcriptional regulator protein  28.69 
 
 		 301 aa  90.9  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1556  LysR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 309 aa  91.7  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00011369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5738  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 291 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0329452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2244  LysR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 305 aa  90.5  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2077  LysR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 296 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0589  LysR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 297 aa  90.5  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5544  LysR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 301 aa  90.9  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.899335 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2217  LysR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 324 aa  90.5  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.335771  normal  0.670692 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5710  LysR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 294 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0762258 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3801  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 291 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5149  LysR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 294 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4567  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 291 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.17477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4199  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.33 
 
 		 298 aa  90.1  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02139  transcriptional regulator  28.79 
 
 		 289 aa  90.1  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4389  LysR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 301 aa  90.1  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3416  DNA-binding transcriptional regulator CynR  33.14 
 
 		 288 aa  90.1  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144678  normal  0.641219 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6567  hydrogen peroxide-inducible genes activator protein  27.18 
 
 		 314 aa  90.1  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.222143  hitchhiker  0.00672743 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 300 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4552  LysR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 307 aa  90.1  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1039  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 321 aa  89.7  5e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.204243  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>