More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2625 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2625  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 299 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000460304  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3416  DNA-binding transcriptional regulator CynR  55.79 
 
 		 288 aa  298  5e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144678  normal  0.641219 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1875  LysR family transcriptional regulator  55.7 
 
 		 307 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.219767  normal  0.699734 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4828  transcriptional regulator, LysR family  34.02 
 
 		 291 aa  121  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26180  transcriptional regulator  33.22 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112143  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0830  transcriptional regulator, LysR family  39.43 
 
 		 313 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.398395  normal  0.0341942 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5552  transcriptional regulator, LysR family  36.01 
 
 		 316 aa  108  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1798  transcriptional regulator, LysR family  33.87 
 
 		 318 aa  108  9.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103195  normal  0.329714 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4722  transcriptional regulator, LysR family  36.04 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0807  LysR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 297 aa  106  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3425  DNA-binding transcriptional regulator CynR  32.59 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3462  DNA-binding transcriptional regulator CynR  32.59 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356635  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2464  DNA-binding transcriptional regulator CynR  32.59 
 
 		 311 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1243  DNA-binding transcriptional regulator CynR  32.59 
 
 		 311 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0383  DNA-binding transcriptional regulator CynR  32.59 
 
 		 311 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  32.88 
 
 		 301 aa  103  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3323  DNA-binding transcriptional regulator CynR  32.59 
 
 		 311 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3730  DNA-binding transcriptional regulator CynR  33.33 
 
 		 296 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107166  normal  0.247106 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2935  transcriptional regulator, LysR family  30.9 
 
 		 304 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2695  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 299 aa  98.6  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.311344 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5919  LysR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 332 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0217311  normal  0.163471 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29990  transcriptional regulator  31.74 
 
 		 309 aa  96.7  5e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.443484  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00292  DNA-binding transcriptional dual regulator  31.42 
 
 		 299 aa  96.3  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3268  transcriptional regulator, LysR family  31.42 
 
 		 299 aa  96.3  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00296  hypothetical protein  31.42 
 
 		 299 aa  96.3  6e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1389  LysR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 295 aa  96.3  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1840  transcriptional regulator CysB  32.64 
 
 		 324 aa  95.9  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000484032 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2016  transcriptional regulator CysB  33.06 
 
 		 324 aa  95.5  8e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.251178  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2317  transcriptional regulator CysB  33.06 
 
 		 324 aa  95.5  9e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01251  DNA-binding transcriptional dual regulator, O-acetyl-L-serine-binding  31.82 
 
 		 324 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2374  transcriptional regulator, LysR family  31.82 
 
 		 324 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00240492  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1856  transcriptional regulator CysB  31.82 
 
 		 324 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.314733  hitchhiker  2.57931e-19 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8459  LysR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 310 aa  95.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.983783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1384  transcriptional regulator CysB  31.82 
 
 		 324 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2180  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.22 
 
 		 307 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01261  hypothetical protein  31.82 
 
 		 324 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.234561  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1844  transcriptional regulator CysB  32.64 
 
 		 324 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00679598 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1902  transcriptional regulator CysB  32.64 
 
 		 324 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.834508  hitchhiker  4.2824e-16 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003682  transcriptional regulator LysR family  28.28 
 
 		 289 aa  95.1  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6793  transcriptional regulator, LysR family  33.2 
 
 		 319 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3462  DNA-binding transcriptional regulator CynR  32.59 
 
 		 311 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1434  transcriptional regulator CysB  32.64 
 
 		 324 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00237388  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2353  transcriptional regulator CysB  31.82 
 
 		 324 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0011024  unclonable  0.000000022716 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1501  transcriptional regulator CysB  31.82 
 
 		 324 aa  94.7  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.7918  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1475  transcriptional regulator CysB  31.82 
 
 		 324 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00044374  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1907  transcriptional regulator CysB  31.82 
 
 		 324 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0524894  hitchhiker  2.34231e-17 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2787  LysR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 305 aa  94  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1497  transcriptional regulator CysB  30.42 
 
 		 324 aa  94.4  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000166035  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2161  transcriptional regulator, LysR family  32.64 
 
 		 324 aa  94.7  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.281423  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3464  LysR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 316 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0879  LysR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 300 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.388933 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1923  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 324 aa  94.4  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1615  transcriptional regulator CysB  32.64 
 
 		 324 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000907367 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5703  transcriptional regulator, LysR family  28.95 
 
 		 295 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.351778 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2228  transcriptional regulator CysB  32.64 
 
 		 324 aa  93.6  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000587269  hitchhiker  0.00110252 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4822  putative transcriptional regulatory protein (nitrogen assimilation control protein)  31.69 
 
 		 331 aa  94  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.672498  normal  0.337818 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1281  transcriptional regulator, LysR family  36.78 
 
 		 290 aa  93.6  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.20663  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2032  transcriptional regulator CysB  32.64 
 
 		 324 aa  93.6  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.30659  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1922  transcriptional regulator CysB  32.64 
 
 		 324 aa  93.6  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.303693  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3287  DNA-binding transcriptional regulator CynR  31.42 
 
 		 299 aa  94  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0611  DNA-binding transcriptional regulator CynR  35.42 
 
 		 296 aa  93.6  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.519974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2656  transcriptional regulator CysB  32.64 
 
 		 324 aa  93.2  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00546956  unclonable  0.0000000382364 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0989  LysR, substrate-binding  36.78 
 
 		 300 aa  93.2  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.745768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5705  DNA-binding transcriptional regulator CynR  33.33 
 
 		 295 aa  92.8  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.202456 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2004  LysR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 304 aa  92.8  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5949  DNA-binding transcriptional regulator CynR  33.33 
 
 		 295 aa  92.8  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.233312  normal  0.638196 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1279  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 310 aa  92.4  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2195  transcriptional regulator CysB  32.23 
 
 		 324 aa  92.8  7e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000422628 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0362  DNA-binding transcriptional regulator CynR  31.03 
 
 		 299 aa  92.4  7e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.709016  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0403  DNA-binding transcriptional regulator CynR  31.03 
 
 		 299 aa  92.4  7e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02139  transcriptional regulator  27.93 
 
 		 289 aa  91.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2217  LysR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 324 aa  91.3  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.335771  normal  0.670692 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2055  LysR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 302 aa  91.3  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.505103  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3484  DNA-binding transcriptional regulator CynR  32.05 
 
 		 292 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.875325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2291  LysR family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 320 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11333  normal  0.519031 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0369  DNA-binding transcriptional regulator CynR  30.65 
 
 		 299 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1200  DNA-binding transcriptional regulator CynR  33.47 
 
 		 311 aa  90.5  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2511  transcriptional regulator, LysR family  30.9 
 
 		 290 aa  90.5  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0301  transcriptional regulator CysB  32.23 
 
 		 324 aa  90.5  3e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  29.77 
 
 		 300 aa  90.5  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2742  DNA-binding transcriptional regulator CynR  33.9 
 
 		 325 aa  90.1  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0588637  normal  0.665335 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003883  regulatory protein CysB  30 
 
 		 324 aa  90.1  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.803514  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0161  DNA-binding transcriptional regulator CynR  34.69 
 
 		 296 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0644  DNA-binding transcriptional regulator CynR  34.69 
 
 		 296 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2034  LysR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 303 aa  90.1  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.376919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1689  transcriptional regulator CysB  29.17 
 
 		 324 aa  89.4  6e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.372652  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0443  transcriptional regulator, LysR family  31.54 
 
 		 301 aa  89.7  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2145  DNA-binding transcriptional regulator CynR  31.65 
 
 		 304 aa  89.7  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.276237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1777  LysR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 351 aa  89.4  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4421  LysR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 304 aa  89.4  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.655491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5176  transcriptional regulator, LysR family  34.82 
 
 		 300 aa  89  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3553  transcriptional regulator CysB  30.42 
 
 		 324 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0383  transcriptional regulator, LysR family  32.01 
 
 		 297 aa  88.6  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715241  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23140  transcriptional regulator CysB  31.25 
 
 		 324 aa  88.6  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2434  LysR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 301 aa  88.6  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5843  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 304 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271378 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2839  transcriptional regulator CysB  30.58 
 
 		 324 aa  89  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  hitchhiker  0.00000219555 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1979  transcriptional regulator CysB  30.04 
 
 		 323 aa  88.6  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3123  transcriptional regulator, LysR family  30.26 
 
 		 293 aa  87.4  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4632  transcriptional regulator, LysR family  33.57 
 
 		 295 aa  87.4  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>