More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1875 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1875  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 307 aa  588  1e-167  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.219767  normal  0.699734 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3416  DNA-binding transcriptional regulator CynR  69.2 
 
 		 288 aa  379  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144678  normal  0.641219 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2625  transcriptional regulator, LysR family  56.14 
 
 		 299 aa  282  5.000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000460304  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26180  transcriptional regulator  32.64 
 
 		 302 aa  117  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4828  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 291 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2291  LysR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 320 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11333  normal  0.519031 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5705  DNA-binding transcriptional regulator CynR  34.51 
 
 		 295 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.202456 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0830  transcriptional regulator, LysR family  35.05 
 
 		 313 aa  98.6  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.398395  normal  0.0341942 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5949  DNA-binding transcriptional regulator CynR  34.51 
 
 		 295 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.233312  normal  0.638196 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2787  LysR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 305 aa  98.2  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29990  transcriptional regulator  30.17 
 
 		 309 aa  95.1  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.443484  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2710  transcriptional regulator, LysR family  26.42 
 
 		 309 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.79073 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3406  transcriptional regulator, LysR family  26.42 
 
 		 309 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4767  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 313 aa  94.7  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1120  transcriptional regulator, LysR family  38.95 
 
 		 350 aa  94  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3924  transcriptional regulator, LysR family  34.01 
 
 		 316 aa  93.6  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02139  transcriptional regulator  27.48 
 
 		 289 aa  93.2  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3855  transcriptional regulator, LysR family  28.17 
 
 		 316 aa  92.4  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08961  transcriptional regulator, LysR family protein  36.29 
 
 		 312 aa  92.4  9e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3730  DNA-binding transcriptional regulator CynR  31.79 
 
 		 296 aa  91.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107166  normal  0.247106 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2004  LysR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 304 aa  91.7  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0411  LysR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 308 aa  91.3  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8459  LysR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 310 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.983783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2400  LysR substrate-binding  23.21 
 
 		 294 aa  90.5  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1224  LysR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 289 aa  90.5  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2357  LysR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 294 aa  90.5  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4062  hypothetical protein  33.02 
 
 		 302 aa  90.9  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.228225  normal  0.120917 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2886  LysR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 301 aa  90.1  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0498  transcriptional regulator, LysR family  24.07 
 
 		 292 aa  89.7  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3287  DNA-binding transcriptional regulator CynR  29.77 
 
 		 299 aa  89.7  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0807  LysR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 297 aa  89.4  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3264  transcriptional regulator, LysR family  30.61 
 
 		 290 aa  89  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3464  LysR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 316 aa  89  9e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0858  transcriptional regulator, LysR family  31.31 
 
 		 309 aa  89  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000521501  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2618  LysR substrate-binding  24.28 
 
 		 292 aa  88.6  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3204  transcriptional regulator, LysR family  28.77 
 
 		 326 aa  88.6  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0357264  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2022  LysR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 309 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0620122  normal  0.0797415 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2565  LysR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 292 aa  88.6  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1281  transcriptional regulator, LysR family  37.14 
 
 		 290 aa  88.6  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.20663  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003682  transcriptional regulator LysR family  26.64 
 
 		 289 aa  88.2  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2935  transcriptional regulator, LysR family  30.88 
 
 		 304 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5552  transcriptional regulator, LysR family  31.89 
 
 		 316 aa  88.6  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1826  transcriptional regulator, LysR family  32.12 
 
 		 327 aa  88.2  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04020  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  30.99 
 
 		 290 aa  87.8  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.057098  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3038  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 290 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000600808  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  33.7 
 
 		 302 aa  87.8  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3271  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 290 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0161  DNA-binding transcriptional regulator CynR  31.64 
 
 		 296 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0644  DNA-binding transcriptional regulator CynR  31.64 
 
 		 296 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4911  transcriptional regulator, LysR family  32.88 
 
 		 303 aa  87  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000218109  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0396  LysR family transcriptional regulator  34.7 
 
 		 300 aa  87  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0002  transcriptional regulator, LysR family  33.87 
 
 		 316 aa  87  3e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0362  DNA-binding transcriptional regulator CynR  29.72 
 
 		 299 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.709016  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3323  DNA-binding transcriptional regulator CynR  29.82 
 
 		 311 aa  86.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1543  transcriptional regulator, LysR family  32.37 
 
 		 298 aa  87  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114968 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2464  DNA-binding transcriptional regulator CynR  29.82 
 
 		 311 aa  86.7  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1243  DNA-binding transcriptional regulator CynR  29.82 
 
 		 311 aa  86.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0403  DNA-binding transcriptional regulator CynR  29.72 
 
 		 299 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0383  DNA-binding transcriptional regulator CynR  29.82 
 
 		 311 aa  86.7  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01251  DNA-binding transcriptional dual regulator, O-acetyl-L-serine-binding  29.68 
 
 		 324 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2374  transcriptional regulator, LysR family  29.68 
 
 		 324 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00240492  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1907  transcriptional regulator CysB  29.68 
 
 		 324 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0524894  hitchhiker  2.34231e-17 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1856  transcriptional regulator CysB  29.68 
 
 		 324 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.314733  hitchhiker  2.57931e-19 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0611  DNA-binding transcriptional regulator CynR  30.91 
 
 		 296 aa  86.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.519974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0383  transcriptional regulator, LysR family  36.56 
 
 		 297 aa  86.7  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715241  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1501  transcriptional regulator CysB  29.68 
 
 		 324 aa  86.7  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.7918  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2353  transcriptional regulator CysB  29.68 
 
 		 324 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0011024  unclonable  0.000000022716 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  35.5 
 
 		 301 aa  86.7  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0369  DNA-binding transcriptional regulator CynR  29.1 
 
 		 299 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1475  transcriptional regulator CysB  29.68 
 
 		 324 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00044374  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1384  transcriptional regulator CysB  29.68 
 
 		 324 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01261  hypothetical protein  29.68 
 
 		 324 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.234561  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00292  DNA-binding transcriptional dual regulator  29.1 
 
 		 299 aa  86.3  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3268  transcriptional regulator, LysR family  29.1 
 
 		 299 aa  86.3  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00296  hypothetical protein  29.1 
 
 		 299 aa  86.3  6e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5650  transcriptional regulator, LysR family  31.08 
 
 		 303 aa  86.3  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00706693  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2454  lysR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 317 aa  86.3  7e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3056  LysR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 293 aa  85.9  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.20426 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5843  LysR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 304 aa  86.3  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271378 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2273  transcriptional regulator LysR family  29.07 
 
 		 294 aa  85.9  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.351493  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3287  LysR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 316 aa  85.9  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1279  LysR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 310 aa  85.9  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3462  DNA-binding transcriptional regulator CynR  29.86 
 
 		 311 aa  85.5  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356635  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4389  LysR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 301 aa  85.5  9e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3425  DNA-binding transcriptional regulator CynR  29.86 
 
 		 311 aa  85.5  9e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3205  LysR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 314 aa  85.5  9e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003883  regulatory protein CysB  29.68 
 
 		 324 aa  85.1  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.803514  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1847  transcriptional regulator, LysR family  41.6 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1923  transcriptional regulator, LysR family  30.59 
 
 		 324 aa  85.1  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0963  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 308 aa  85.5  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.377381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3467  LysR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 308 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.39067 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4861  DNA-binding transcriptional regulator CynR  33.64 
 
 		 301 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0956909 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2425  LysR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 308 aa  85.1  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.540189  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3927  LysR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 303 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5655  transcriptional regulator, LysR family  30.82 
 
 		 310 aa  84.7  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1434  transcriptional regulator CysB  30.18 
 
 		 324 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00237388  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0411  DNA-binding transcriptional regulator CynR  30.99 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1902  transcriptional regulator CysB  30.18 
 
 		 324 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.834508  hitchhiker  4.2824e-16 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6793  transcriptional regulator, LysR family  32.99 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1844  transcriptional regulator CysB  30.18 
 
 		 324 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00679598 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>