More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0611 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0611  DNA-binding transcriptional regulator CynR  100 
 
 
296 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.519974  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0161  DNA-binding transcriptional regulator CynR  97.64 
 
 
296 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0644  DNA-binding transcriptional regulator CynR  97.64 
 
 
296 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3730  DNA-binding transcriptional regulator CynR  91.5 
 
 
296 aa  509  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107166  normal  0.247106 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2742  DNA-binding transcriptional regulator CynR  82.99 
 
 
325 aa  455  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0588637  normal  0.665335 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3425  DNA-binding transcriptional regulator CynR  65.98 
 
 
311 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3323  DNA-binding transcriptional regulator CynR  65.98 
 
 
311 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2464  DNA-binding transcriptional regulator CynR  65.98 
 
 
311 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1243  DNA-binding transcriptional regulator CynR  65.98 
 
 
311 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3462  DNA-binding transcriptional regulator CynR  65.98 
 
 
311 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356635  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0383  DNA-binding transcriptional regulator CynR  65.98 
 
 
311 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3462  DNA-binding transcriptional regulator CynR  65.98 
 
 
311 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1200  DNA-binding transcriptional regulator CynR  65.64 
 
 
311 aa  343  2e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5705  DNA-binding transcriptional regulator CynR  61.4 
 
 
295 aa  341  8e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.202456 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5949  DNA-binding transcriptional regulator CynR  61.05 
 
 
295 aa  340  2e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.233312  normal  0.638196 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2145  DNA-binding transcriptional regulator CynR  57.75 
 
 
304 aa  330  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.276237  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2817  DNA-binding transcriptional regulator CynR  59.17 
 
 
298 aa  319  3e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4130  DNA-binding transcriptional regulator CynR  58.48 
 
 
298 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.717557 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4781  DNA-binding transcriptional regulator CynR  58.48 
 
 
298 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.749024  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3386  DNA-binding transcriptional regulator CynR  58.48 
 
 
298 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1535  DNA-binding transcriptional regulator CynR  56.34 
 
 
300 aa  307  1.0000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.195582  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5606  DNA-binding transcriptional regulator CynR  57.4 
 
 
328 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22241  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3094  DNA-binding transcriptional regulator CynR  54.04 
 
 
295 aa  285  7e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.899085  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00292  DNA-binding transcriptional dual regulator  52.08 
 
 
299 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3268  transcriptional regulator, LysR family  52.08 
 
 
299 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0369  DNA-binding transcriptional regulator CynR  52.43 
 
 
299 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00296  hypothetical protein  52.08 
 
 
299 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0362  DNA-binding transcriptional regulator CynR  52.43 
 
 
299 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.709016  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0403  DNA-binding transcriptional regulator CynR  52.43 
 
 
299 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3287  DNA-binding transcriptional regulator CynR  52.43 
 
 
299 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0411  DNA-binding transcriptional regulator CynR  52.43 
 
 
299 aa  282  5.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3234  DNA-binding transcriptional regulator CynR  51.59 
 
 
295 aa  276  4e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.842433  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0107  DNA-binding transcriptional regulator CynR  49.48 
 
 
315 aa  275  7e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3484  DNA-binding transcriptional regulator CynR  48.78 
 
 
292 aa  263  3e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.875325  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3368  DNA-binding transcriptional regulator CynR  49.83 
 
 
292 aa  262  6e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.578087  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37940  DNA-binding transcriptional regulator CynR  50.53 
 
 
295 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000278966  normal  0.0117616 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4861  DNA-binding transcriptional regulator CynR  47.45 
 
 
301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0956909 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0157  transcriptional regulator, LysR family  44.56 
 
 
308 aa  208  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0139  LysR family transcriptional regulator  43.86 
 
 
308 aa  202  4e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0198  LysR family transcriptional regulator  43.4 
 
 
308 aa  195  8.000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5650  transcriptional regulator, LysR family  38.44 
 
 
303 aa  192  7e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00706693  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1896  LysR family transcriptional regulator  38.87 
 
 
296 aa  190  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.349748 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5108  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 
301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.336118  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  35.19 
 
 
300 aa  183  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  0.00000808392 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  34.84 
 
 
300 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2271  LysR family transcriptional regulator  33.8 
 
 
300 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2439  LysR family transcriptional regulator  33.8 
 
 
300 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2455  transcriptional regulator, LysR family  33.8 
 
 
300 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  33.8 
 
 
300 aa  178  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2482  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 
303 aa  178  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.086853  normal  0.0180215 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2244  LysR family transcriptional regulator  34.49 
 
 
305 aa  177  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 
300 aa  176  4e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2533  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 
300 aa  176  4e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00448001  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2188  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 
300 aa  175  8e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.540994  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2120  LysR family transcriptional regulator  39.03 
 
 
292 aa  170  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.112359  normal  0.184045 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4331  LysR family transcriptional regulator  34.86 
 
 
298 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0186917 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3755  LysR substrate-binding  31.27 
 
 
294 aa  151  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2003  LysR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
291 aa  150  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1224  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 
289 aa  148  9e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2787  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 
305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1282  LysR family transcriptional regulator  29.27 
 
 
293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.20294  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1930  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 
297 aa  142  8e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0417087 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1036  transcriptional regulator, LysR family  30.69 
 
 
300 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003682  transcriptional regulator LysR family  30.66 
 
 
289 aa  140  3.9999999999999997e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5618  transcriptional regulator, LysR family  31.4 
 
 
300 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000121214 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3225  transcriptional regulator, LysR family  31.03 
 
 
300 aa  139  7e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.456811 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1976  transcriptional regulator, LysR family  37.59 
 
 
343 aa  139  7.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.66022  normal  0.44727 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4509  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 
298 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3294  LysR family transcriptional regulator  32.3 
 
 
294 aa  136  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.438685 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3565  LysR family transcriptional regulator  35.76 
 
 
303 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116622  normal  0.0782096 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4901  LysR family transcriptional regulator  31.06 
 
 
294 aa  136  5e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4335  LysR family transcriptional regulator  33.8 
 
 
297 aa  136  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.385889  normal  0.337801 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4914  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 
294 aa  135  8e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4775  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  30.69 
 
 
305 aa  135  8e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.760624  hitchhiker  0.00336049 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1269  LysR family transcriptional regulator  36.39 
 
 
298 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.151838 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5310  transcriptional regulator, LysR family  31.06 
 
 
294 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1453799999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5341  transcriptional regulator, LysR family  31.06 
 
 
294 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1243  LysR family transcriptional regulator  36.39 
 
 
298 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0884  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 
298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1366  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 
298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0187  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  31.05 
 
 
302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0266  LysR family transcriptional regulator  29.86 
 
 
307 aa  133  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0193  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  31.05 
 
 
302 aa  133  3e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5069  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 
294 aa  134  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1344  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 
298 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.749958  normal  0.0693843 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5454  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 
294 aa  134  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.533779  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05450  transcriptional regulator, LysR family  25.17 
 
 
296 aa  134  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0434511  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3788  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  31.41 
 
 
302 aa  133  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1817  transcriptional regulator, LysR family  30.77 
 
 
303 aa  132  6e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2158  transcriptional regulator, LysR family  30.77 
 
 
301 aa  132  6e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5392  transcriptional regulator, LysR family  30.72 
 
 
294 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02139  transcriptional regulator  29.27 
 
 
289 aa  132  6.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0127  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  31.41 
 
 
305 aa  132  7.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.985261  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5335  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 
294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5012  LysR family transcriptional regulator  30.03 
 
 
294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4079  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  30.32 
 
 
305 aa  130  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0138  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  30.32 
 
 
305 aa  130  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0119  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  30.32 
 
 
305 aa  130  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.985596  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5585  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 
298 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462735  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2862  hypothetical protein  30.88 
 
 
292 aa  130  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>