More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1692 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1692  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 329 aa  625  1e-178  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2418  transcriptional regulator  36.39 
 
 		 294 aa  156  4e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0285418 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2935  transcriptional regulator, LysR family  35.92 
 
 		 304 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0807  LysR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 297 aa  132  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2928  LysR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 290 aa  123  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3211  transcriptional regulator, LysR family  29.89 
 
 		 290 aa  117  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3090  transcriptional regulator, LysR family  40.58 
 
 		 283 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5397  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.3 
 
 		 297 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1604  transcriptional regulator, LysR family  34.75 
 
 		 293 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.218506 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8569  transcriptional regulator, LysR family  29.17 
 
 		 316 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3441  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 306 aa  99  9e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.985803  hitchhiker  0.000545962 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1790  LysR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 289 aa  98.6  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000399419  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4995  LysR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 302 aa  97.1  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.631415  normal  0.721068 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3883  LysR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 298 aa  97.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3927  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 303 aa  97.1  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4486  LysR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 298 aa  97.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03270  transcriptional regulator  28.32 
 
 		 305 aa  96.7  5e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3859  LysR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 308 aa  96.3  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207692 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1778  LysR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 289 aa  95.1  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000761412  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1916  LysR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 289 aa  95.1  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0657607  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3423  transcriptional regulator, LysR family  26.6 
 
 		 289 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000235779 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2521  putative transcriptional regulator  27.51 
 
 		 292 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1757  LysR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 289 aa  94.7  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2390  LysR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 299 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2625  putative transcriptional regulator  27.51 
 
 		 292 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.351429 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2000  LysR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 289 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.504431  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2466  putative transcriptional regulator  27.51 
 
 		 292 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.11864 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2417  putative transcriptional regulator  27.51 
 
 		 292 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2509  putative transcriptional regulator  27.94 
 
 		 292 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1680  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 293 aa  93.6  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.21592  normal  0.237518 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2501  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 308 aa  93.6  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3373  hypothetical protein  27.14 
 
 		 292 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 300 aa  93.2  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5818  LysR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 298 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0673  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 289 aa  93.6  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.102205  normal  0.750884 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0362  LysR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 301 aa  93.2  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3036  transcriptional regulator, LysR family  28 
 
 		 288 aa  93.2  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000194633  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1735  LysR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 289 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.173814  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26180  transcriptional regulator  32.2 
 
 		 302 aa  93.2  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1368  LysR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 304 aa  92.8  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.114163 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2244  LysR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 305 aa  92.8  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2271  LysR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 300 aa  92.4  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2455  transcriptional regulator, LysR family  28.4 
 
 		 300 aa  92.4  9e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2439  LysR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 300 aa  92.4  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2041  LysR family transcriptional regulator  32.25 
 
 		 314 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.881958  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2919  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 305 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2806  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 296 aa  91.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.521552  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2590  nitrogen assimilation transcriptional regulator  29.1 
 
 		 307 aa  92.4  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3701  LysR family transcriptional regulator  32.25 
 
 		 327 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.037732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4118  LysR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 324 aa  91.7  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00686854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3816  LysR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 310 aa  91.3  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.898253 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2773  LysR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 305 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4125  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 298 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0971923 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4576  LysR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 306 aa  91.3  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00764055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4776  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 298 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3391  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 298 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.279491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2533  transcriptional regulator, LysR family  27.98 
 
 		 300 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00448001  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5544  LysR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 301 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.899335 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3178  LysR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 305 aa  90.5  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125712  normal  0.0310919 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  27.57 
 
 		 300 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2148  LysR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 329 aa  89.7  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2188  LysR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 300 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.540994  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  27.57 
 
 		 300 aa  89.4  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  0.00000808392 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19930  transcriptional regulator  25.58 
 
 		 294 aa  88.6  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0799  LysR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 308 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00821953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0412  transcriptional regulator  28.47 
 
 		 297 aa  89  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0159161  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2054  LysR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 297 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1268  putative HTH-type transcriptional regulator YbhD  28.08 
 
 		 297 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0739  LysR-family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 308 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000050568  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0812  LysR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 308 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0254349  normal  0.598657 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2863  LysR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 305 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.97885  normal  0.374459 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3330  LysR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 298 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.718277 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3686  LysR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 297 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2569  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 300 aa  87.8  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0243965  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3155  LysR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 320 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0970  LysR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 303 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0751  LysR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 308 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000639538  normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5168  LysR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 298 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6272  LysR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 316 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3164  LysR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 297 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29990  transcriptional regulator  32.45 
 
 		 309 aa  87.4  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.443484  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2156  LysR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 300 aa  87.4  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1528  LysR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 307 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.442273  normal  0.763545 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4822  putative transcriptional regulatory protein (nitrogen assimilation control protein)  30.51 
 
 		 331 aa  87.4  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.672498  normal  0.337818 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1573  LysR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 297 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117572  normal  0.71184 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2130  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  28.86 
 
 		 296 aa  87  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.809904  hitchhiker  0.00950877 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1271  LysR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 305 aa  87  4e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0459918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5976  LysR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 316 aa  86.7  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1001  LysR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 303 aa  86.3  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 300 aa  86.3  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0004  LysR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 309 aa  86.3  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.357807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0848  LysR-family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 308 aa  86.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00362304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3955  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.62 
 
 		 313 aa  85.9  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2683  OsmT protein  29 
 
 		 308 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.567691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0795  LysR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 320 aa  85.1  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2789  OsmT protein  29 
 
 		 308 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2568  OsmT protein  29 
 
 		 308 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0008695  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0712  LysR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 299 aa  85.5  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3415  LysR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 386 aa  85.5  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2617  OsmT protein  29 
 
 		 308 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>