More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5818 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5818  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 298 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3883  LysR family transcriptional regulator  98.31 
 
 		 298 aa  584  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4486  LysR family transcriptional regulator  98.31 
 
 		 298 aa  584  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1368  LysR family transcriptional regulator  93.24 
 
 		 304 aa  558  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.114163 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3922  LysR family transcriptional regulator  86.2 
 
 		 298 aa  512  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4386  LysR family transcriptional regulator  84.85 
 
 		 303 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.343439  normal  0.243257 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4995  LysR family transcriptional regulator  84.8 
 
 		 302 aa  499  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.631415  normal  0.721068 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1757  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 289 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1778  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 289 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000761412  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1916  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 289 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0657607  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2000  LysR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 289 aa  151  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.504431  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1790  LysR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 289 aa  150  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000399419  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1735  LysR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 289 aa  150  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.173814  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3423  transcriptional regulator, LysR family  32.08 
 
 		 289 aa  149  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000235779 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2021  transcriptional regulator, LysR family  30.67 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000475915  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1920  transcriptional regulator, LysR family  30.67 
 
 		 263 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.304852  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1952  transcriptional regulator, LysR family  29.41 
 
 		 263 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000018508 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3140  LysR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0673  LysR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 289 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.102205  normal  0.750884 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3036  transcriptional regulator, LysR family  27.57 
 
 		 288 aa  109  5e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000194633  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2928  LysR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 290 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3211  transcriptional regulator, LysR family  27.14 
 
 		 290 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3090  transcriptional regulator, LysR family  32.62 
 
 		 283 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2919  LysR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 290 aa  102  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.226862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2935  transcriptional regulator, LysR family  29.96 
 
 		 304 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2625  putative transcriptional regulator  26.14 
 
 		 292 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.351429 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2417  putative transcriptional regulator  26.14 
 
 		 292 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2466  putative transcriptional regulator  26.14 
 
 		 292 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.11864 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1864  LysR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 294 aa  97.1  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2509  putative transcriptional regulator  26.14 
 
 		 292 aa  97.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2521  putative transcriptional regulator  25.76 
 
 		 292 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3185  LysR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 295 aa  94.4  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.377934  normal  0.982451 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2390  LysR family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 299 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1680  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 293 aa  92.8  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.21592  normal  0.237518 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2418  transcriptional regulator  28.86 
 
 		 294 aa  91.7  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0285418 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3373  hypothetical protein  23.48 
 
 		 292 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0284  LysR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 294 aa  90.5  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1592  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 292 aa  90.5  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.030577  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1614  LysR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 311 aa  90.5  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.625262  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02400  transcriptional regulator  29.53 
 
 		 300 aa  90.1  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3296  putative transcriptional regulator  29.9 
 
 		 306 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5976  LysR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 316 aa  89.7  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0953  transcriptional regulator, LysR family  28.74 
 
 		 294 aa  89.7  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1141  LysR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 297 aa  89  8e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.387698 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0266  LysR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 307 aa  89  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1370  transcriptional regulator, LysR family  25.41 
 
 		 313 aa  88.2  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173382  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4400  transcriptional regulator, LysR family  30.32 
 
 		 301 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103907  hitchhiker  0.00279425 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2101  transcriptional regulator, LysR family  31.28 
 
 		 304 aa  87.8  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.515959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3454  LysR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 298 aa  88.2  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4070  LysR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 297 aa  87.4  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.409277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6272  LysR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 316 aa  86.7  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  30.07 
 
 		 327 aa  86.7  5e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3415  LysR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 386 aa  86.3  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8674  transcriptional regulator, LysR family  30.17 
 
 		 306 aa  85.9  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.441291  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3334  transcriptional regulator, LysR family  28.68 
 
 		 302 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2584  LysR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 293 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156706  normal  0.234942 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0640  LysR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404969  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3512  LysR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.069263  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  29.24 
 
 		 316 aa  85.5  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6151  transcriptional regulator, LysR family  30 
 
 		 323 aa  85.5  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3205  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 314 aa  85.1  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1684  LysR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00688867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17090  Transcriptional regulator, LysR family  24.12 
 
 		 299 aa  84.7  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5656  LysR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601684 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2659  OsmT protein  27.57 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3720  LysR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.101076  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4648  LysR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2392  LysR family transcriptional regulator  26.3 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.888596  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3366  LysR family transcriptional regulator  26.3 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.326699 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4912  transcriptional regulator, LysR family  25.43 
 
 		 295 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000162486  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2803  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.765199 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2568  OsmT protein  27.57 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0008695  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2683  OsmT protein  27.57 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.567691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2789  OsmT protein  27.57 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1671  LysR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 296 aa  83.2  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3561  LysR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 297 aa  82.8  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6323  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 294 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.482978  normal  0.771209 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0412  transcriptional regulator  22.43 
 
 		 297 aa  82.4  0.000000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0159161  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0589  LysR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1120  LysR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 298 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.359729  normal  0.248441 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5881  transcriptional regulator, LysR family  30.74 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2617  OsmT protein  27.24 
 
 		 308 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4846  LysR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1036  transcriptional regulator, LysR family  25.87 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0970  LysR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 303 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0354  LysR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5439  LysR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5423  LysR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0829573  normal  0.0352079 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2787  LysR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0914  transcriptional regulator, LysR family  29.29 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0276  transcriptional regulator, LysR family  30.41 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.265614 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4982  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 307 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.960154 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19930  transcriptional regulator  26.29 
 
 		 294 aa  79.3  0.00000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2079  LysR family transcriptional regulator  26.1 
 
 		 302 aa  79.3  0.00000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.399656  normal  0.607866 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0044  LysR family transcriptional regulator  23.69 
 
 		 297 aa  79.3  0.00000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0820  transcriptional regulator, LysR family  27.76 
 
 		 307 aa  79  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5307  LysR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0037216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1459  LysR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 311 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.828972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0229  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.983112 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1761  LysR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00834119  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>