More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1864 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1864  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 294 aa  582  1.0000000000000001e-165  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0673  LysR family transcriptional regulator  48.79 
 
 		 289 aa  259  3e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.102205  normal  0.750884 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2919  LysR family transcriptional regulator  46.83 
 
 		 290 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.226862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3185  LysR family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 295 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.377934  normal  0.982451 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1790  LysR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 289 aa  154  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000399419  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1757  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 289 aa  152  5e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3423  transcriptional regulator, LysR family  32.62 
 
 		 289 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000235779 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2000  LysR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 289 aa  151  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.504431  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1778  LysR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 289 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000761412  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1735  LysR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 289 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.173814  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1916  LysR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 289 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0657607  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2928  LysR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 290 aa  137  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3211  transcriptional regulator, LysR family  28.72 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2021  transcriptional regulator, LysR family  32.81 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000475915  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1920  transcriptional regulator, LysR family  32.81 
 
 		 263 aa  133  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.304852  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1952  transcriptional regulator, LysR family  32.03 
 
 		 263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000018508 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2418  transcriptional regulator  34.02 
 
 		 294 aa  125  1e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0285418 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1120  LysR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 298 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.359729  normal  0.248441 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0586  LysR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.364179  decreased coverage  0.000128837 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3939  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1512  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1067  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1910  OsmT protein  32.65 
 
 		 300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.580889  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0986  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1757  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.233098  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0180  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0000907778  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1735  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0864805  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4132  LysR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 303 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.977393  normal  0.0579117 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3140  LysR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 295 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2569  LysR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 300 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0243965  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1001  LysR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 303 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2416  LysR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 301 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2417  putative transcriptional regulator  29.22 
 
 		 292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2466  putative transcriptional regulator  29.22 
 
 		 292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.11864 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2625  putative transcriptional regulator  29.22 
 
 		 292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.351429 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5263  transcriptional regulator, LysR family  28 
 
 		 297 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2521  putative transcriptional regulator  29.22 
 
 		 292 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5664  transcriptional regulator, LysR family  28.33 
 
 		 297 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5025  LysR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 297 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0269  hypothetical protein  30.03 
 
 		 294 aa  110  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5406  LysR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 297 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5293  transcriptional regulator, LysR family  28.24 
 
 		 297 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2509  putative transcriptional regulator  28.81 
 
 		 292 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3373  hypothetical protein  29.32 
 
 		 292 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2935  transcriptional regulator, LysR family  32.75 
 
 		 304 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5280  LysR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 297 aa  109  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2390  LysR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 299 aa  109  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4749  LysR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 303 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0228204 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5338  transcriptional regulator, LysR family  28.67 
 
 		 297 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3618  LysR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 303 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3441  LysR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.985803  hitchhiker  0.000545962 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4855  LysR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4870  LysR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1416  LysR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.691659 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1376  LysR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.809674  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1735  LysR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4596  LysR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00651674 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2178  transcriptional regulator, LysR family  30.13 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2826  LysR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1626  transcriptional regulator, LysR family  30.27 
 
 		 300 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0614386 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0831  LysR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1733  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 321 aa  107  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0192173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1761  LysR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 300 aa  107  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.982692  normal  0.0243449 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1148  transcriptional regulator, LysR family  28.52 
 
 		 303 aa  106  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000219344  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0274  hypothetical protein  29.69 
 
 		 294 aa  106  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3716  LysR family transcriptional regulator  27.02 
 
 		 297 aa  106  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2848  LysR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 310 aa  106  5e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.93078  normal  0.0328698 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0509  transcriptional regulator, LysR family  31.33 
 
 		 293 aa  106  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.187244  hitchhiker  0.00160332 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2038  transcriptional regulator, LysR family  29.8 
 
 		 305 aa  106  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4969  LysR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 297 aa  105  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1470  LysR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 300 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19930  transcriptional regulator  27.21 
 
 		 294 aa  105  7e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1494  LysR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 300 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1013  LysR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 300 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3060  transcriptional regulator, LysR family  29.15 
 
 		 293 aa  105  9e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000262954  decreased coverage  0.0000000999677 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5534  LysR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 306 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.162022  normal  0.470463 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08550  Transcriptional regulator, LysR family  32.67 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.763554  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4367  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.764337  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4335  LysR family transcriptional regulator  31 
 
 		 297 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.385889  normal  0.337801 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3273  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 293 aa  103  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.215219 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3927  LysR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 303 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4722  transcriptional regulator, LysR family  31.23 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2640  RuBisCO operon transcriptional regulator  34.6 
 
 		 305 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1370  transcriptional regulator, LysR family  31.9 
 
 		 313 aa  102  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173382  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4486  LysR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 298 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3883  LysR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 298 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5504  LysR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 300 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4635  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 300 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.646338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03270  transcriptional regulator  25.77 
 
 		 305 aa  102  1e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3552  LysR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 297 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.964874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4655  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 310 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0129573  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6024  transcriptional regulator, LysR family  32.36 
 
 		 298 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1183  LysR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 297 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3322  transcriptional regulator, LysR family  29.86 
 
 		 296 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151906  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2244  LysR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3056  LysR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.20426 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 300 aa  100  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0909  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  29.45 
 
 		 298 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4627  LysR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 293 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1368  LysR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 304 aa  99.4  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.114163 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>