More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH820_1952 on replicon NC_011773
Organism: Bacillus cereus AH820



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_005945  BAS1778  LysR family transcriptional regulator  98.86 
 
 		 289 aa  528  1e-149  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000761412  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1757  LysR family transcriptional regulator  99.24 
 
 		 289 aa  530  1e-149  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1916  LysR family transcriptional regulator  98.86 
 
 		 289 aa  528  1e-149  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0657607  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1952  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 263 aa  530  1e-149  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000018508 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1735  LysR family transcriptional regulator  98.1 
 
 		 289 aa  524  1e-148  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.173814  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2021  transcriptional regulator, LysR family  96.58 
 
 		 263 aa  518  1e-146  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000475915  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2000  LysR family transcriptional regulator  96.96 
 
 		 289 aa  519  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.504431  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1920  transcriptional regulator, LysR family  96.2 
 
 		 263 aa  517  1e-146  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.304852  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3423  transcriptional regulator, LysR family  96.2 
 
 		 289 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000235779 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1790  LysR family transcriptional regulator  95.44 
 
 		 289 aa  511  1e-144  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000399419  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2625  putative transcriptional regulator  39.92 
 
 		 292 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.351429 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2521  putative transcriptional regulator  39.92 
 
 		 292 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2509  putative transcriptional regulator  39.92 
 
 		 292 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2417  putative transcriptional regulator  39.92 
 
 		 292 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2466  putative transcriptional regulator  39.92 
 
 		 292 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.11864 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2390  LysR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 299 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3373  hypothetical protein  38.24 
 
 		 292 aa  171  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3211  transcriptional regulator, LysR family  35.52 
 
 		 290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2928  LysR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2919  LysR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 290 aa  158  7e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.226862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3036  transcriptional regulator, LysR family  32.55 
 
 		 288 aa  154  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000194633  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0673  LysR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 289 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.102205  normal  0.750884 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3185  LysR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.377934  normal  0.982451 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3140  LysR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 295 aa  135  8e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19930  transcriptional regulator  29.55 
 
 		 294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1680  LysR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 293 aa  129  5.0000000000000004e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.21592  normal  0.237518 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1864  LysR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3883  LysR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4486  LysR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5818  LysR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4995  LysR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 302 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.631415  normal  0.721068 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1368  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 304 aa  123  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.114163 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1592  LysR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 292 aa  122  7e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.030577  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0412  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0159161  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2462  transcriptional regulator, LysR family  27.65 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.341726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3922  LysR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 298 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4386  LysR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.343439  normal  0.243257 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  29.69 
 
 		 301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03270  transcriptional regulator  26.97 
 
 		 305 aa  109  6e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3090  transcriptional regulator, LysR family  26.15 
 
 		 283 aa  106  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0807  LysR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 297 aa  106  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1224  LysR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 289 aa  104  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2787  LysR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 305 aa  103  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2935  transcriptional regulator, LysR family  29.43 
 
 		 304 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  28.03 
 
 		 300 aa  103  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  0.00000808392 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2418  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 294 aa  102  4e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0285418 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0101  transcriptional regulator, LysR family  31.21 
 
 		 311 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2416  LysR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 301 aa  102  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3761  redox-sensitive transcriptional activator OxyR  29.03 
 
 		 314 aa  102  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0091  transcriptional regulator, LysR family  30.64 
 
 		 311 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2848  LysR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 310 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.93078  normal  0.0328698 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0055  LysR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 309 aa  101  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3576  LysR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 305 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.300569  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2271  LysR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2439  LysR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 300 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0084  LysR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 311 aa  99.8  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446413  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2055  LysR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 302 aa  99.8  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.505103  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1120  LysR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 298 aa  99.4  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.359729  normal  0.248441 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  27.27 
 
 		 300 aa  99.4  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2455  transcriptional regulator, LysR family  26.52 
 
 		 300 aa  98.6  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2617  OsmT protein  27.52 
 
 		 308 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 300 aa  97.4  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2789  OsmT protein  27.52 
 
 		 308 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2533  transcriptional regulator, LysR family  26.52 
 
 		 300 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00448001  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2568  OsmT protein  27.52 
 
 		 308 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0008695  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2683  OsmT protein  27.52 
 
 		 308 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.567691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1883  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 		 309 aa  96.7  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0687382  normal  0.7379 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003682  transcriptional regulator LysR family  25.1 
 
 		 289 aa  97.1  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  27.27 
 
 		 300 aa  97.1  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3178  LysR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 305 aa  97.1  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125712  normal  0.0310919 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1913  LysR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 298 aa  96.7  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0283777  normal  0.375382 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2157  LysR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 293 aa  96.3  4e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2648  transcriptional regulator, LysR family  27.75 
 
 		 306 aa  96.3  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2188  LysR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 300 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.540994  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2659  OsmT protein  26.46 
 
 		 308 aa  96.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1389  LysR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 295 aa  96.3  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2244  LysR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 305 aa  96.3  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1779  hydrogen peroxide-inducible genes activator  28.44 
 
 		 296 aa  95.9  6e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2994  LysR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 295 aa  95.9  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0317639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4132  LysR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 303 aa  95.9  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.977393  normal  0.0579117 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2850  LysR family substrate binding transcriptional regulator  27.03 
 
 		 290 aa  95.5  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.46504  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1684  LysR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 299 aa  95.9  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00688867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  25.93 
 
 		 302 aa  95.5  8e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2054  LysR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 297 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142115  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1778  hydrogen peroxide-inducible genes activator  28.44 
 
 		 296 aa  95.1  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3686  LysR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 297 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0858  transcriptional regulator  29.43 
 
 		 296 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.311751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0799  transcriptional regulator  29.43 
 
 		 296 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.603179  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3181  LysR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 299 aa  94  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0827  transcriptional regulator  29.06 
 
 		 296 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.237922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  27.98 
 
 		 299 aa  94  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1554  transcriptional regulator, LysR family  28.2 
 
 		 309 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.15921 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4596  LysR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 303 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00651674 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2454  lysR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 317 aa  94.4  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02220  transcriptional regulator  28.77 
 
 		 304 aa  94  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3724  LysR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 300 aa  94.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.282606 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2001  transcriptional regulator, LysR family  25.91 
 
 		 298 aa  94  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.536649 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  27.98 
 
 		 299 aa  94  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4546  LysR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 300 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>