More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_02220 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_02220  transcriptional regulator  100 
 
 		 304 aa  598  1e-170  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2648  transcriptional regulator, LysR family  50.35 
 
 		 306 aa  245  6.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 305 aa  209  3e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  39.73 
 
 		 301 aa  203  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  37.41 
 
 		 327 aa  191  9e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  44.4 
 
 		 288 aa  191  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2386  transcriptional regulator, LysR family  41.89 
 
 		 309 aa  181  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00159604  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3118  transcriptional regulator, LysR family  38.87 
 
 		 309 aa  174  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181053  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1796  transcriptional regulator, LysR family  36.73 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2134  transcriptional regulator, LysR family  39.29 
 
 		 287 aa  160  4e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4632  transcriptional regulator, LysR family  37.2 
 
 		 295 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  40.38 
 
 		 315 aa  157  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1507  transcriptional regulator, LysR family  37.2 
 
 		 288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.74974  normal  0.352143 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2292  transcriptional regulator, LysR family  37.84 
 
 		 315 aa  149  7e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.863525  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6287  transcriptional regulator, LysR family  37.63 
 
 		 304 aa  146  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1602  fhu operon transcriptional regulator  33.89 
 
 		 310 aa  146  5e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 301 aa  145  6e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1104  transcriptional regulator, LysR family  36 
 
 		 298 aa  143  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  34.69 
 
 		 312 aa  144  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4073  transcriptional regulator, LysR family  37.79 
 
 		 313 aa  142  8e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.127902  normal  0.817309 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5125  LysR family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 296 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932924  normal  0.723753 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  36.7 
 
 		 327 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2782  transcriptional regulator, LysR family  38.37 
 
 		 294 aa  139  8.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0540  transcriptional regulator, LysR family  34.81 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15621  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3489  LysR family transcriptional regulator  36.74 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3552  LysR family transcriptional regulator  36.74 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3502  LysR family transcriptional regulator  36.74 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3338  transcriptional regulator, LysR family  32.67 
 
 		 312 aa  136  5e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2018  LysR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 304 aa  136  5e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0569  transcriptional regulator, LysR family  38.29 
 
 		 324 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3940  transcriptional regulator, LysR family  34.41 
 
 		 310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2545  transcriptional regulator, LysR family  32.54 
 
 		 309 aa  130  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.794961 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0655  transcriptional regulator, LysR family  35.43 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1422  LysR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 308 aa  127  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00195938  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2225  transcriptional regulator, LysR family  36.76 
 
 		 302 aa  127  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00118451  normal  0.339624 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5881  transcriptional regulator, LysR family  34.69 
 
 		 304 aa  125  8.000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2031  transcriptional regulator, LysR family  36.39 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205829  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2097  LysR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 306 aa  123  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.732708  normal  0.0491263 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1625  transcriptional regulator, LysR family  29.79 
 
 		 298 aa  122  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1321  transcriptional regulator, LysR family  33.56 
 
 		 308 aa  122  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  0.107974 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4403  LysR substrate-binding protein  33.45 
 
 		 303 aa  121  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.900242  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2582  LysR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 313 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2822  transcriptional regulator, LysR family  33.96 
 
 		 310 aa  120  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.438739  normal  0.714096 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  31.33 
 
 		 301 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6871  LysR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 283 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6024  transcriptional regulator, LysR family  32.11 
 
 		 298 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73094  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2098  LysR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 312 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0305237  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4424  LysR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4368  LysR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 300 aa  117  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000508648  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4076  transcriptional regulator, LysR family  34.77 
 
 		 331 aa  117  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3856  transcriptional regulator, LysR family  36.87 
 
 		 313 aa  117  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00162069  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5452  transcriptional regulator, LysR family  31.71 
 
 		 297 aa  116  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6522  transcriptional regulator, LysR family  32.45 
 
 		 300 aa  116  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4546  LysR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 300 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6247  transcriptional regulator, LysR family  32.79 
 
 		 328 aa  115  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0091  transcriptional regulator, LysR family  35.2 
 
 		 311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1790  LysR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 289 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000399419  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2928  LysR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0084  LysR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446413  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6763  transcriptional regulator, LysR family  30.22 
 
 		 303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3036  transcriptional regulator, LysR family  25.68 
 
 		 288 aa  113  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000194633  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2508  LysR substrate-binding protein  33.44 
 
 		 316 aa  114  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1684  LysR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 299 aa  112  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00688867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3423  transcriptional regulator, LysR family  28.85 
 
 		 289 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000235779 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2173  transcriptional regulator, LysR family  28.52 
 
 		 308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2000  LysR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 289 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.504431  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1757  LysR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 289 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  32.99 
 
 		 316 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1735  LysR family transcriptional regulator  27.99 
 
 		 289 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.173814  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2340  transcriptional regulator, LysR family  29.59 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  0.887111 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19590  transcriptional regulator  32.53 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.221792  normal  0.0758544 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0129  transcriptional regulator, LysR family  35.09 
 
 		 315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00685914  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3211  transcriptional regulator, LysR family  26.6 
 
 		 290 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1778  LysR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 289 aa  109  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000761412  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1916  LysR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 289 aa  109  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0657607  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1355  LysR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 296 aa  109  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0101  transcriptional regulator, LysR family  34 
 
 		 311 aa  109  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  28.8 
 
 		 302 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1853  transcriptional regulator, LysR family  36.73 
 
 		 350 aa  108  8.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54026 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00330  transcriptional regulator  33 
 
 		 304 aa  108  8.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.531846 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5552  putative transcriptional regulator protein, LysR family  31.54 
 
 		 303 aa  108  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1883  transcriptional regulator, LysR family  27 
 
 		 309 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0687382  normal  0.7379 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0767  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.54 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2254  LysR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 314 aa  108  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3424  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7868  transcriptional regulator, LysR family  34.02 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.365024 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4167  LysR substrate-binding protein  31.5 
 
 		 295 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.767565  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6150  LysR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 295 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0301422 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2521  putative transcriptional regulator  28.03 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0048  transcriptional regulator, LysR family  31.71 
 
 		 298 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.968768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2509  putative transcriptional regulator  28.03 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2625  putative transcriptional regulator  28.03 
 
 		 292 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.351429 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2466  putative transcriptional regulator  28.03 
 
 		 292 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.11864 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2417  putative transcriptional regulator  28.03 
 
 		 292 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1554  transcriptional regulator, LysR family  26.67 
 
 		 309 aa  106  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.15921 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3140  LysR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 295 aa  106  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  27.2 
 
 		 300 aa  105  7e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1156  LysR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 306 aa  105  8e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0266  LysR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5689  transcriptional regulator, LysR family  31.67 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>