More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0655 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0655  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 311 aa  618  1e-176  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  49.67 
 
 		 312 aa  261  2e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  37.97 
 
 		 315 aa  157  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  37.83 
 
 		 301 aa  156  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  34.65 
 
 		 327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2098  LysR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 312 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0305237  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3338  transcriptional regulator, LysR family  30.36 
 
 		 312 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2292  transcriptional regulator, LysR family  36.24 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.863525  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5125  LysR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 296 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932924  normal  0.723753 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3489  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3552  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3502  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2031  transcriptional regulator, LysR family  33.78 
 
 		 333 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205829  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2018  LysR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 304 aa  136  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1104  transcriptional regulator, LysR family  34.11 
 
 		 298 aa  135  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 288 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  36 
 
 		 316 aa  135  9e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19590  transcriptional regulator  32.06 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.221792  normal  0.0758544 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2386  transcriptional regulator, LysR family  37.25 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00159604  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  35.08 
 
 		 327 aa  134  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0540  transcriptional regulator, LysR family  32.54 
 
 		 291 aa  133  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15621  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2648  transcriptional regulator, LysR family  36.4 
 
 		 306 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3940  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2097  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.732708  normal  0.0491263 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5689  transcriptional regulator, LysR family  31.67 
 
 		 314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4546  LysR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 300 aa  125  7e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6522  transcriptional regulator, LysR family  35.55 
 
 		 300 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7065  transcriptional regulator, LysR family  36.79 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0569  transcriptional regulator, LysR family  33.78 
 
 		 324 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6150  LysR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 295 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0301422 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1507  transcriptional regulator, LysR family  34.35 
 
 		 288 aa  122  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.74974  normal  0.352143 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4632  transcriptional regulator, LysR family  37.2 
 
 		 295 aa  122  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1796  transcriptional regulator, LysR family  34.87 
 
 		 308 aa  122  9e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2340  transcriptional regulator, LysR family  30.3 
 
 		 302 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  0.887111 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3118  transcriptional regulator, LysR family  35.57 
 
 		 309 aa  121  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181053  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 301 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02220  transcriptional regulator  35.48 
 
 		 304 aa  120  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4368  LysR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000508648  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1625  transcriptional regulator, LysR family  29.73 
 
 		 298 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1422  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 308 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00195938  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2187  LysR substrate-binding protein  33.89 
 
 		 309 aa  118  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2872  transcriptional regulator, LysR family  31.56 
 
 		 302 aa  117  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6871  LysR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 283 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2782  transcriptional regulator, LysR family  33.6 
 
 		 294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6287  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2545  transcriptional regulator, LysR family  30.2 
 
 		 309 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.794961 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2225  transcriptional regulator, LysR family  34.5 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00118451  normal  0.339624 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1897  transcriptional regulator, LysR family  34.32 
 
 		 299 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0474391 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0267  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.334674  normal  0.614052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6247  transcriptional regulator, LysR family  31.6 
 
 		 328 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5452  transcriptional regulator, LysR family  33.94 
 
 		 297 aa  109  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6024  transcriptional regulator, LysR family  31.91 
 
 		 298 aa  108  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0043  transcriptional regulator, LysR family  33.11 
 
 		 302 aa  108  9.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1602  fhu operon transcriptional regulator  29 
 
 		 310 aa  108  9.000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1853  transcriptional regulator, LysR family  36.91 
 
 		 350 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54026 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  28.42 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1720  LysR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178865  normal  0.0235109 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0303  LysR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 307 aa  108  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1423  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 339 aa  107  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.174338  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6763  transcriptional regulator, LysR family  29.59 
 
 		 303 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  28.4 
 
 		 302 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2271  LysR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7868  transcriptional regulator, LysR family  31 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.365024 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2439  LysR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4100  transcriptional regulator, LysR family  31.31 
 
 		 319 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  0.0246683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5552  putative transcriptional regulator protein, LysR family  30.21 
 
 		 303 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5881  transcriptional regulator, LysR family  30.07 
 
 		 304 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4073  transcriptional regulator, LysR family  34.32 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.127902  normal  0.817309 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 300 aa  103  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4824  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00015803  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3675  transcriptional regulator, LysR family  30.77 
 
 		 303 aa  103  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2446  transcriptional regulator, LysR family  32.04 
 
 		 308 aa  103  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2455  transcriptional regulator, LysR family  25.9 
 
 		 300 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3856  transcriptional regulator, LysR family  32.76 
 
 		 313 aa  103  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00162069  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 300 aa  102  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2848  LysR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 310 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.93078  normal  0.0328698 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0352  transcriptional regulator, LysR family  32.45 
 
 		 296 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256379  normal  0.0881916 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3497  transcriptional regulator, LysR family  32.1 
 
 		 307 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137062 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2833  LysR family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 293 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2958  LysR family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 293 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0543101 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0445  LysR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 295 aa  101  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.294779  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1621  LysR family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 293 aa  101  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.358841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1691  LysR family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 293 aa  101  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34330  transcriptional regulator  30.67 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2815  LysR family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 293 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3484  DNA-binding transcriptional regulator CynR  31.25 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.875325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  25.79 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1696  LysR family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4411  LysR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 291 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0509478  normal  0.98744 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1543  transcriptional regulator, LysR family  27.3 
 
 		 293 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3948  LysR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 291 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3886  LysR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 311 aa  100  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4076  transcriptional regulator, LysR family  30.23 
 
 		 331 aa  100  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0914  transcriptional regulator, LysR family  29.83 
 
 		 301 aa  99.8  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2533  transcriptional regulator, LysR family  25.1 
 
 		 300 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00448001  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0066  transcriptional regulator, LysR family  31.44 
 
 		 303 aa  99.4  7e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3056  LysR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 293 aa  99.4  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.20426 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2188  LysR family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 300 aa  99  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.540994  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2914  LysR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 295 aa  99.4  8e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.298049  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>