More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1853 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1853  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 350 aa  666    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54026 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  68.44 
 
 		 301 aa  395  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  60 
 
 		 327 aa  332  7.000000000000001e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2782  transcriptional regulator, LysR family  51.81 
 
 		 294 aa  230  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  40.46 
 
 		 312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5881  transcriptional regulator, LysR family  43.32 
 
 		 304 aa  163  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0569  transcriptional regulator, LysR family  41.3 
 
 		 324 aa  162  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0540  transcriptional regulator, LysR family  40.08 
 
 		 291 aa  159  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15621  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6763  transcriptional regulator, LysR family  37.95 
 
 		 303 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  36.77 
 
 		 315 aa  151  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 327 aa  146  5e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 288 aa  144  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  37.34 
 
 		 316 aa  143  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6287  transcriptional regulator, LysR family  38.41 
 
 		 304 aa  142  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5552  putative transcriptional regulator protein, LysR family  39.74 
 
 		 303 aa  142  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5125  LysR family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 296 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932924  normal  0.723753 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2134  transcriptional regulator, LysR family  39.02 
 
 		 287 aa  141  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0267  LysR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 300 aa  139  6e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.334674  normal  0.614052 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1422  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 308 aa  135  8e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00195938  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 305 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2292  transcriptional regulator, LysR family  37.74 
 
 		 315 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.863525  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2648  transcriptional regulator, LysR family  40.15 
 
 		 306 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2018  LysR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 304 aa  134  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  36.43 
 
 		 301 aa  134  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1104  transcriptional regulator, LysR family  38.13 
 
 		 298 aa  133  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0655  transcriptional regulator, LysR family  36.91 
 
 		 311 aa  133  6e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3118  transcriptional regulator, LysR family  34.65 
 
 		 309 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181053  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1796  transcriptional regulator, LysR family  34.58 
 
 		 308 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2567  LysR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 338 aa  130  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259086  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19590  transcriptional regulator  39.41 
 
 		 311 aa  130  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.221792  normal  0.0758544 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6522  transcriptional regulator, LysR family  39.22 
 
 		 300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4632  transcriptional regulator, LysR family  36.58 
 
 		 295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1321  transcriptional regulator, LysR family  38.63 
 
 		 308 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  0.107974 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1507  transcriptional regulator, LysR family  33.56 
 
 		 288 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.74974  normal  0.352143 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3489  LysR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 323 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3502  LysR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 323 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3552  LysR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 323 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2254  LysR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 314 aa  126  5e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4424  LysR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 292 aa  126  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02220  transcriptional regulator  36.18 
 
 		 304 aa  125  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2225  transcriptional regulator, LysR family  36.54 
 
 		 302 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00118451  normal  0.339624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9290  LysR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 311 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2386  transcriptional regulator, LysR family  39.84 
 
 		 309 aa  122  7e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00159604  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3338  transcriptional regulator, LysR family  33.2 
 
 		 312 aa  122  8e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 296 aa  122  9e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4400  transcriptional regulator, LysR family  37.04 
 
 		 301 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103907  hitchhiker  0.00279425 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2508  LysR substrate-binding protein  34.8 
 
 		 316 aa  122  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4076  transcriptional regulator, LysR family  32.73 
 
 		 331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2545  transcriptional regulator, LysR family  32.9 
 
 		 309 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.794961 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0043  transcriptional regulator, LysR family  33.11 
 
 		 302 aa  119  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7868  transcriptional regulator, LysR family  37.4 
 
 		 296 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.365024 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0914  transcriptional regulator, LysR family  37.45 
 
 		 301 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6247  transcriptional regulator, LysR family  34.3 
 
 		 328 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0129  transcriptional regulator, LysR family  36.36 
 
 		 315 aa  117  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00685914  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5689  transcriptional regulator, LysR family  35.22 
 
 		 314 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4368  LysR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 300 aa  116  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000508648  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36460  transcriptional regulator  36.07 
 
 		 304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.776376  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2187  LysR substrate-binding protein  35 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5025  transcriptional regulator, LysR family  33.96 
 
 		 295 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.860643  normal  0.224116 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2822  transcriptional regulator, LysR family  33.1 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.438739  normal  0.714096 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6024  transcriptional regulator, LysR family  32.54 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1897  transcriptional regulator, LysR family  36.62 
 
 		 299 aa  113  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0474391 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0582  transcriptional regulator, LysR family  33.68 
 
 		 312 aa  113  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3940  transcriptional regulator, LysR family  34.84 
 
 		 310 aa  112  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4595  LysR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 297 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 323 aa  112  9e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0807  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0716  transcriptional regulator, LysR family  36.23 
 
 		 308 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.711839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3675  transcriptional regulator, LysR family  32.93 
 
 		 303 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2097  LysR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 306 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.732708  normal  0.0491263 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00330  transcriptional regulator  29.87 
 
 		 304 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.531846 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2582  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 313 aa  109  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3720  LysR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 305 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.101076  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4648  LysR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 305 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22480  transcriptional regulator  35.25 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.542371 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2442  LysR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3806  LysR family transcriptional regulator  30.55 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4596  LysR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 303 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00651674 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  34.87 
 
 		 298 aa  108  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5656  LysR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 305 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601684 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1516  transcriptional regulator, LysR family  33.77 
 
 		 300 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1842  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 307 aa  108  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4132  LysR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 303 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.977393  normal  0.0579117 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0380  transcriptional regulator LysR family  35.62 
 
 		 309 aa  107  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1602  fhu operon transcriptional regulator  30.99 
 
 		 310 aa  107  4e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1352  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 303 aa  106  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000043904 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2466  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 304 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.708031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3497  transcriptional regulator, LysR family  36.75 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137062 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6402  LysR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 306 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1850  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2461  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2031  transcriptional regulator, LysR family  31.75 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205829  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4100  transcriptional regulator, LysR family  33.11 
 
 		 319 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  0.0246683 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3886  LysR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0586  LysR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.364179  decreased coverage  0.000128837 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4080  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 327 aa  104  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5792  LysR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 304 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.316053 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3856  transcriptional regulator, LysR family  37.02 
 
 		 313 aa  103  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00162069  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 296 aa  103  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6150  LysR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 295 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0301422 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>