More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2567 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2567  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 338 aa  641    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259086  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9290  LysR family transcriptional regulator  70.89 
 
 		 311 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2254  LysR family transcriptional regulator  55.85 
 
 		 314 aa  311  1e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2616  transcriptional regulator, LysR family  64.71 
 
 		 306 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000734486  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0582  transcriptional regulator, LysR family  54.49 
 
 		 312 aa  294  1e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  40.2 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0540  transcriptional regulator, LysR family  36.73 
 
 		 291 aa  152  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15621  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0569  transcriptional regulator, LysR family  41.58 
 
 		 324 aa  152  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5881  transcriptional regulator, LysR family  40.34 
 
 		 304 aa  144  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2018  LysR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 304 aa  142  8e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5552  putative transcriptional regulator protein, LysR family  41.2 
 
 		 303 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0267  LysR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 300 aa  140  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.334674  normal  0.614052 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1104  transcriptional regulator, LysR family  37.37 
 
 		 298 aa  140  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1507  transcriptional regulator, LysR family  37.33 
 
 		 288 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.74974  normal  0.352143 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6763  transcriptional regulator, LysR family  35.95 
 
 		 303 aa  139  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4400  transcriptional regulator, LysR family  39.87 
 
 		 301 aa  139  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103907  hitchhiker  0.00279425 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  36.33 
 
 		 315 aa  139  8.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3338  transcriptional regulator, LysR family  33.66 
 
 		 312 aa  138  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3999  transcriptional regulator, LysR family  36.74 
 
 		 311 aa  136  4e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2097  LysR family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 306 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.732708  normal  0.0491263 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4424  LysR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2340  transcriptional regulator, LysR family  35.22 
 
 		 302 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  0.887111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5125  LysR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 296 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932924  normal  0.723753 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  34.54 
 
 		 312 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4076  transcriptional regulator, LysR family  34.95 
 
 		 331 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6522  transcriptional regulator, LysR family  37.16 
 
 		 300 aa  130  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2134  transcriptional regulator, LysR family  37.84 
 
 		 287 aa  129  5.0000000000000004e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0914  transcriptional regulator, LysR family  37.63 
 
 		 301 aa  129  6e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4824  transcriptional regulator, LysR family  36.49 
 
 		 308 aa  129  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00015803  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6247  transcriptional regulator, LysR family  38.2 
 
 		 328 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 301 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2508  LysR substrate-binding protein  37.09 
 
 		 316 aa  125  7e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36460  transcriptional regulator  37.54 
 
 		 304 aa  125  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.776376  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2446  transcriptional regulator, LysR family  37.01 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3675  transcriptional regulator, LysR family  34.83 
 
 		 303 aa  124  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  34.03 
 
 		 301 aa  123  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1422  LysR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 308 aa  122  7e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00195938  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  33.55 
 
 		 327 aa  122  7e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3502  LysR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 323 aa  122  8e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3489  LysR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 323 aa  122  8e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3552  LysR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 323 aa  122  8e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2582  LysR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 313 aa  122  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4632  transcriptional regulator, LysR family  37.64 
 
 		 295 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1625  transcriptional regulator, LysR family  32.3 
 
 		 298 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3886  LysR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 311 aa  120  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4546  LysR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 305 aa  117  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4100  transcriptional regulator, LysR family  34.08 
 
 		 319 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  0.0246683 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2292  transcriptional regulator, LysR family  34.15 
 
 		 315 aa  115  8.999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.863525  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6150  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0301422 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  37.54 
 
 		 327 aa  114  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2545  transcriptional regulator, LysR family  33.9 
 
 		 309 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.794961 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2386  transcriptional regulator, LysR family  38.14 
 
 		 309 aa  114  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00159604  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  33.77 
 
 		 301 aa  113  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22480  transcriptional regulator  35.14 
 
 		 308 aa  112  7.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.542371 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3118  transcriptional regulator, LysR family  33.73 
 
 		 309 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181053  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0807  transcriptional regulator, LysR family  33.88 
 
 		 304 aa  110  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2031  transcriptional regulator, LysR family  33 
 
 		 333 aa  109  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205829  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2098  LysR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 312 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0305237  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1355  LysR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 296 aa  108  9.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7065  transcriptional regulator, LysR family  35.49 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2225  transcriptional regulator, LysR family  36.63 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00118451  normal  0.339624 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17190  transcriptional regulator  34.87 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00132066  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2544  transcriptional regulator, LysR family  35.39 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0984343  normal  0.803064 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3720  LysR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.101076  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4648  LysR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5689  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 314 aa  106  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0716  transcriptional regulator, LysR family  35 
 
 		 308 aa  107  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.711839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5656  LysR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 305 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601684 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3806  LysR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 307 aa  106  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1321  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  0.107974 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6024  transcriptional regulator, LysR family  33.6 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4552  LysR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 307 aa  105  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19590  transcriptional regulator  34.35 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.221792  normal  0.0758544 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2872  transcriptional regulator, LysR family  34.01 
 
 		 302 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2648  transcriptional regulator, LysR family  34.81 
 
 		 306 aa  103  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4246  transcriptional regulator, LysR family  35.55 
 
 		 295 aa  102  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20222  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1423  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 339 aa  101  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.174338  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2148  LysR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 329 aa  101  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3968  LysR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 322 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.456128  normal  0.373765 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5879  LysR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 299 aa  99.8  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.927972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2541  ArsR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 307 aa  99.8  6e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204275  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1743  transcriptional regulator, LysR family  28.93 
 
 		 322 aa  99.8  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2782  transcriptional regulator, LysR family  35.89 
 
 		 294 aa  99.4  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0129  transcriptional regulator, LysR family  36.95 
 
 		 315 aa  98.6  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00685914  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3638  LysR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 316 aa  98.2  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000174199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5397  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.2 
 
 		 297 aa  97.8  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3181  LysR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 299 aa  98.2  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4368  LysR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 300 aa  98.2  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000508648  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1853  transcriptional regulator, LysR family  37.14 
 
 		 350 aa  98.2  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54026 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3940  transcriptional regulator, LysR family  32.46 
 
 		 310 aa  97.4  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  28.34 
 
 		 300 aa  97.4  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  29.92 
 
 		 302 aa  96.7  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1575  transcriptional regulator, LysR family  25.41 
 
 		 295 aa  95.5  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000381269  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1478  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 309 aa  95.5  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0854082  hitchhiker  0.000187974 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1352  transcriptional regulator, LysR family  30.87 
 
 		 303 aa  95.9  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000043904 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3033  transcriptional regulator, LysR family  30.07 
 
 		 325 aa  94.4  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0089298  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0043  transcriptional regulator, LysR family  37.8 
 
 		 302 aa  94.7  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3165  transcriptional regulator, LysR family  26.04 
 
 		 299 aa  94.7  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000392866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>