More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0569 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0569  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 324 aa  634    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0267  LysR family transcriptional regulator  69.62 
 
 		 300 aa  383  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.334674  normal  0.614052 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  61.13 
 
 		 316 aa  347  2e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5881  transcriptional regulator, LysR family  59.27 
 
 		 304 aa  328  8e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4400  transcriptional regulator, LysR family  60.75 
 
 		 301 aa  322  6e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103907  hitchhiker  0.00279425 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0914  transcriptional regulator, LysR family  53.58 
 
 		 301 aa  288  1e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2446  transcriptional regulator, LysR family  50.34 
 
 		 308 aa  256  5e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0807  transcriptional regulator, LysR family  40 
 
 		 304 aa  192  4e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  38.51 
 
 		 312 aa  188  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5125  LysR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 296 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932924  normal  0.723753 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1104  transcriptional regulator, LysR family  39.87 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2134  transcriptional regulator, LysR family  41.44 
 
 		 287 aa  177  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  39.32 
 
 		 315 aa  168  9e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2545  transcriptional regulator, LysR family  38.26 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.794961 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 305 aa  167  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4368  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 300 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000508648  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1625  transcriptional regulator, LysR family  34.25 
 
 		 298 aa  165  9e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1422  LysR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 308 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00195938  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  41.7 
 
 		 301 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19590  transcriptional regulator  36.01 
 
 		 311 aa  164  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.221792  normal  0.0758544 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6522  transcriptional regulator, LysR family  40.74 
 
 		 300 aa  163  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2097  LysR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 306 aa  163  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.732708  normal  0.0491263 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  37.37 
 
 		 327 aa  163  4.0000000000000004e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2567  LysR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 338 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259086  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2031  transcriptional regulator, LysR family  36.96 
 
 		 333 aa  159  5e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205829  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2254  LysR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 314 aa  159  6e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5552  putative transcriptional regulator protein, LysR family  37.01 
 
 		 303 aa  158  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 288 aa  158  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6247  transcriptional regulator, LysR family  37.08 
 
 		 328 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1321  transcriptional regulator, LysR family  38.38 
 
 		 308 aa  157  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  0.107974 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0540  transcriptional regulator, LysR family  35.93 
 
 		 291 aa  157  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15621  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4546  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 300 aa  155  9e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6763  transcriptional regulator, LysR family  37.73 
 
 		 303 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6024  transcriptional regulator, LysR family  36.74 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3856  transcriptional regulator, LysR family  40.91 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00162069  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  39.84 
 
 		 327 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2822  transcriptional regulator, LysR family  36.49 
 
 		 310 aa  151  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.438739  normal  0.714096 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2872  transcriptional regulator, LysR family  34.45 
 
 		 302 aa  150  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4100  transcriptional regulator, LysR family  36.25 
 
 		 319 aa  149  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  0.0246683 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34330  transcriptional regulator  35.76 
 
 		 308 aa  147  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1853  transcriptional regulator, LysR family  40.33 
 
 		 350 aa  146  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54026 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0303  LysR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 307 aa  146  6e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9290  LysR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 311 aa  145  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5689  transcriptional regulator, LysR family  35.41 
 
 		 314 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0582  transcriptional regulator, LysR family  39.26 
 
 		 312 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3940  transcriptional regulator, LysR family  35.07 
 
 		 310 aa  143  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4076  transcriptional regulator, LysR family  36.15 
 
 		 331 aa  142  7e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3338  transcriptional regulator, LysR family  32.52 
 
 		 312 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0208  transcriptional regulator, LysR family  35.86 
 
 		 301 aa  142  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22480  transcriptional regulator  36.64 
 
 		 308 aa  140  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.542371 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3675  transcriptional regulator, LysR family  33.92 
 
 		 303 aa  140  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7065  transcriptional regulator, LysR family  36.62 
 
 		 294 aa  140  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2340  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 302 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  0.887111 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2018  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 304 aa  139  7e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3489  LysR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 323 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3552  LysR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 323 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3502  LysR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 323 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6287  transcriptional regulator, LysR family  36.56 
 
 		 304 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3886  LysR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 311 aa  138  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6871  LysR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 283 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3118  transcriptional regulator, LysR family  36.15 
 
 		 309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181053  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4632  transcriptional regulator, LysR family  38.96 
 
 		 295 aa  136  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4424  LysR family transcriptional regulator  36.58 
 
 		 292 aa  135  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4824  transcriptional regulator, LysR family  35.37 
 
 		 308 aa  135  9e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00015803  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2782  transcriptional regulator, LysR family  38.43 
 
 		 294 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36460  transcriptional regulator  37.46 
 
 		 304 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.776376  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4403  LysR substrate-binding protein  34.2 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.900242  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1507  transcriptional regulator, LysR family  37.41 
 
 		 288 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.74974  normal  0.352143 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  34.94 
 
 		 301 aa  133  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0655  transcriptional regulator, LysR family  33.78 
 
 		 311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  34.59 
 
 		 301 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17190  transcriptional regulator  34.59 
 
 		 308 aa  130  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00132066  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2225  transcriptional regulator, LysR family  35.69 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00118451  normal  0.339624 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2508  LysR substrate-binding protein  36.14 
 
 		 316 aa  130  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0129  transcriptional regulator, LysR family  34.69 
 
 		 315 aa  130  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00685914  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2292  transcriptional regulator, LysR family  35.36 
 
 		 315 aa  129  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.863525  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2386  transcriptional regulator, LysR family  38.13 
 
 		 309 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00159604  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2648  transcriptional regulator, LysR family  36.49 
 
 		 306 aa  129  6e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2582  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 313 aa  129  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00330  transcriptional regulator  35.15 
 
 		 304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.531846 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5567  tartrate utilization transcriptional regulator  35.96 
 
 		 305 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.879392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0043  transcriptional regulator, LysR family  37.37 
 
 		 302 aa  126  6e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3713  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 334 aa  124  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0716  transcriptional regulator, LysR family  36.99 
 
 		 308 aa  124  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.711839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6150  LysR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 295 aa  122  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0301422 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4632  LysR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 301 aa  122  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  36.14 
 
 		 298 aa  121  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1796  transcriptional regulator, LysR family  36.51 
 
 		 308 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2616  transcriptional regulator, LysR family  38.57 
 
 		 306 aa  120  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000734486  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  32.79 
 
 		 302 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3497  transcriptional regulator, LysR family  33.92 
 
 		 307 aa  119  7.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137062 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02220  transcriptional regulator  38.05 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5656  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 305 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601684 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4246  transcriptional regulator, LysR family  33.88 
 
 		 295 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20222  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3720  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 305 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.101076  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4648  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 305 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3999  transcriptional regulator, LysR family  34.92 
 
 		 311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2098  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0305237  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  30.29 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2187  LysR substrate-binding protein  31.56 
 
 		 309 aa  114  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>