More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3713 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3713  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 334 aa  668    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19590  transcriptional regulator  48.64 
 
 		 311 aa  249  7e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.221792  normal  0.0758544 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2872  transcriptional regulator, LysR family  38.72 
 
 		 302 aa  183  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5689  transcriptional regulator, LysR family  38.41 
 
 		 314 aa  173  5e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2031  transcriptional regulator, LysR family  37.75 
 
 		 333 aa  160  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205829  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0716  transcriptional regulator, LysR family  36.4 
 
 		 308 aa  144  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.711839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1422  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 308 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00195938  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  34.54 
 
 		 316 aa  137  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2545  transcriptional regulator, LysR family  33.1 
 
 		 309 aa  136  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.794961 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7065  transcriptional regulator, LysR family  35.03 
 
 		 294 aa  132  7.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5125  LysR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 296 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932924  normal  0.723753 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2097  LysR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 306 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.732708  normal  0.0491263 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5881  transcriptional regulator, LysR family  36.01 
 
 		 304 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0569  transcriptional regulator, LysR family  34.67 
 
 		 324 aa  129  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2134  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 287 aa  129  8.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36460  transcriptional regulator  35.62 
 
 		 304 aa  127  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.776376  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3856  transcriptional regulator, LysR family  37.09 
 
 		 313 aa  126  7e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00162069  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0267  LysR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 300 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.334674  normal  0.614052 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  30.74 
 
 		 327 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1104  transcriptional regulator, LysR family  34 
 
 		 298 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1625  transcriptional regulator, LysR family  30.31 
 
 		 298 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4546  LysR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 300 aa  119  9e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4400  transcriptional regulator, LysR family  34.69 
 
 		 301 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103907  hitchhiker  0.00279425 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4424  LysR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 292 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  28.04 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4403  LysR substrate-binding protein  31.68 
 
 		 303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.900242  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 301 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6522  transcriptional regulator, LysR family  32.65 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3999  transcriptional regulator, LysR family  35.86 
 
 		 311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6024  transcriptional regulator, LysR family  32.8 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34330  transcriptional regulator  31.02 
 
 		 308 aa  108  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0540  transcriptional regulator, LysR family  31.83 
 
 		 291 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15621  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0208  transcriptional regulator, LysR family  30.55 
 
 		 301 aa  108  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3502  LysR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 323 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3489  LysR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 323 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3552  LysR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 323 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0303  LysR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 307 aa  107  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2225  transcriptional regulator, LysR family  32.43 
 
 		 302 aa  106  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00118451  normal  0.339624 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3940  transcriptional regulator, LysR family  30.56 
 
 		 310 aa  105  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  33.83 
 
 		 301 aa  105  9e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2822  transcriptional regulator, LysR family  32.53 
 
 		 310 aa  105  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.438739  normal  0.714096 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  30.55 
 
 		 305 aa  103  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0914  transcriptional regulator, LysR family  32.66 
 
 		 301 aa  103  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4076  transcriptional regulator, LysR family  31.73 
 
 		 331 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4368  LysR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 300 aa  101  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000508648  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0129  transcriptional regulator, LysR family  31.32 
 
 		 315 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00685914  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5552  putative transcriptional regulator protein, LysR family  31.18 
 
 		 303 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0450  LysR substrate-binding protein  31.97 
 
 		 310 aa  100  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  29.64 
 
 		 327 aa  99.4  9e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2254  LysR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 314 aa  99  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6763  transcriptional regulator, LysR family  29.77 
 
 		 303 aa  98.6  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03179  transcription regulator protein  30.8 
 
 		 310 aa  97.8  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.379949  normal  0.13271 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2292  transcriptional regulator, LysR family  29.57 
 
 		 315 aa  97.8  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.863525  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1352  transcriptional regulator, LysR family  29.97 
 
 		 303 aa  97.8  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000043904 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0807  transcriptional regulator, LysR family  29.53 
 
 		 304 aa  97.4  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1897  transcriptional regulator, LysR family  30.57 
 
 		 299 aa  97.1  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0474391 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2639  transcriptional regulator  31.56 
 
 		 302 aa  96.3  7e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0043  transcriptional regulator, LysR family  31.67 
 
 		 302 aa  96.3  7e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2446  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 		 308 aa  96.3  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6552  LysR family transcriptional regulator  28 
 
 		 303 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.392727 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3424  LysR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 296 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5704  LysR family transcriptional regulator  28 
 
 		 303 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  29.97 
 
 		 315 aa  95.1  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2018  LysR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 304 aa  95.5  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6068  LysR family transcriptional regulator  28 
 
 		 303 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2386  transcriptional regulator, LysR family  32.82 
 
 		 309 aa  94.7  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00159604  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02220  transcriptional regulator  33.2 
 
 		 304 aa  94.7  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3886  LysR family transcriptional regulator  29.04 
 
 		 311 aa  94.4  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2573  LysR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 320 aa  94.7  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7208  LysR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 293 aa  94  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1309  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 302 aa  93.2  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120853  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6871  LysR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 283 aa  92.8  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2782  transcriptional regulator, LysR family  29.51 
 
 		 294 aa  92  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0767  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.27 
 
 		 306 aa  92  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4632  LysR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 301 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0909  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  26.8 
 
 		 298 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1423  LysR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 339 aa  91.3  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.174338  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1688  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.69 
 
 		 293 aa  91.3  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2728  transcriptional regulator CatR  30.64 
 
 		 290 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  24.79 
 
 		 302 aa  91.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1666  transcriptional regulator, LysR family  29.79 
 
 		 302 aa  91.3  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.883412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4359  LysR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 303 aa  90.9  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  30.42 
 
 		 301 aa  90.9  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 288 aa  90.9  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2442  LysR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 299 aa  90.5  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3294  LysR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 294 aa  90.5  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.438685 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6287  transcriptional regulator, LysR family  28.53 
 
 		 304 aa  90.1  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32200  transcriptional regulator CatR  30.3 
 
 		 290 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.156456  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0582  transcriptional regulator, LysR family  30.16 
 
 		 312 aa  89.7  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3675  transcriptional regulator, LysR family  29.58 
 
 		 303 aa  89.4  8e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3497  transcriptional regulator, LysR family  31.18 
 
 		 307 aa  89  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137062 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8854  LysR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 375 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3036  transcriptional regulator, LysR family  25.21 
 
 		 288 aa  87.8  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000194633  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3565  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 303 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116622  normal  0.0782096 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1796  transcriptional regulator, LysR family  29.9 
 
 		 308 aa  88.2  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2312  LysR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 302 aa  87.8  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.015479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0970  LysR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 303 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3338  transcriptional regulator, LysR family  26.64 
 
 		 312 aa  87.4  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1650  LysR family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 301 aa  87.4  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2030  LysR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 303 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>