More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1897 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1897  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 299 aa  583  1.0000000000000001e-165  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0474391 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4403  LysR substrate-binding protein  39.64 
 
 		 303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.900242  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0208  transcriptional regulator, LysR family  40 
 
 		 301 aa  194  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2822  transcriptional regulator, LysR family  39.35 
 
 		 310 aa  182  5.0000000000000004e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.438739  normal  0.714096 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1104  transcriptional regulator, LysR family  35.9 
 
 		 298 aa  147  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5125  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 296 aa  143  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932924  normal  0.723753 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6522  transcriptional regulator, LysR family  37.46 
 
 		 300 aa  133  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3502  LysR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3489  LysR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3552  LysR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  33.78 
 
 		 315 aa  122  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  35.43 
 
 		 312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5881  transcriptional regulator, LysR family  34.04 
 
 		 304 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0655  transcriptional regulator, LysR family  34.65 
 
 		 311 aa  115  7.999999999999999e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0716  transcriptional regulator, LysR family  34.88 
 
 		 308 aa  112  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.711839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6763  transcriptional regulator, LysR family  29.12 
 
 		 303 aa  112  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0569  transcriptional regulator, LysR family  33.8 
 
 		 324 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2098  LysR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 312 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0305237  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2018  LysR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 301 aa  110  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6024  transcriptional regulator, LysR family  34.32 
 
 		 298 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 305 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  29.59 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  31.21 
 
 		 316 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0540  transcriptional regulator, LysR family  31.91 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15621  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4368  LysR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000508648  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0267  LysR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 300 aa  104  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.334674  normal  0.614052 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2225  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 302 aa  103  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00118451  normal  0.339624 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 327 aa  103  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4546  LysR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 300 aa  102  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5552  putative transcriptional regulator protein, LysR family  32.39 
 
 		 303 aa  102  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0303  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 307 aa  102  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 296 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6150  LysR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 295 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0301422 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1625  transcriptional regulator, LysR family  28.87 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3338  transcriptional regulator, LysR family  28.62 
 
 		 312 aa  101  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2648  transcriptional regulator, LysR family  33.8 
 
 		 306 aa  100  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19590  transcriptional regulator  30.16 
 
 		 311 aa  101  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.221792  normal  0.0758544 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36460  transcriptional regulator  34.65 
 
 		 304 aa  99.4  7e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.776376  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2340  transcriptional regulator, LysR family  30.64 
 
 		 302 aa  99.4  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  0.887111 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2031  transcriptional regulator, LysR family  31.79 
 
 		 333 aa  99.4  7e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205829  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2097  LysR family transcriptional regulator  27.99 
 
 		 306 aa  99  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.732708  normal  0.0491263 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2872  transcriptional regulator, LysR family  30.92 
 
 		 302 aa  98.6  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2541  ArsR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 307 aa  98.2  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204275  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2386  transcriptional regulator, LysR family  33.2 
 
 		 309 aa  97.1  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00159604  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  27.94 
 
 		 327 aa  96.7  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0914  transcriptional regulator, LysR family  33.1 
 
 		 301 aa  97.1  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6552  LysR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 303 aa  95.9  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.392727 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5704  LysR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 303 aa  95.9  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6068  LysR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 303 aa  95.9  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1321  transcriptional regulator, LysR family  32.76 
 
 		 308 aa  95.5  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  0.107974 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1422  LysR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 308 aa  95.5  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00195938  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3713  LysR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 334 aa  95.5  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1853  transcriptional regulator, LysR family  36.62 
 
 		 350 aa  94.7  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54026 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4424  LysR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 292 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4824  transcriptional regulator, LysR family  33.57 
 
 		 308 aa  94.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00015803  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3036  transcriptional regulator, LysR family  23.79 
 
 		 288 aa  94  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000194633  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 288 aa  94  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3860  LysR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 306 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.722283  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2545  transcriptional regulator, LysR family  30 
 
 		 309 aa  92.4  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.794961 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2292  transcriptional regulator, LysR family  28.77 
 
 		 315 aa  91.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.863525  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34330  transcriptional regulator  29.55 
 
 		 308 aa  91.7  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02220  transcriptional regulator  31.62 
 
 		 304 aa  92  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2244  LysR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 305 aa  91.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 300 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0582  transcriptional regulator, LysR family  30.23 
 
 		 312 aa  91.3  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3940  transcriptional regulator, LysR family  30.65 
 
 		 310 aa  91.3  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2157  LysR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 293 aa  90.5  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2254  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 314 aa  90.5  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6871  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 283 aa  90.5  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 305 aa  90.5  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 300 aa  90.1  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3856  transcriptional regulator, LysR family  35.56 
 
 		 313 aa  89.7  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00162069  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2271  LysR family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 300 aa  89.4  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2455  transcriptional regulator, LysR family  24.65 
 
 		 300 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2439  LysR family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 300 aa  89.4  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  28 
 
 		 299 aa  89  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  28 
 
 		 299 aa  89  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2533  transcriptional regulator, LysR family  24.3 
 
 		 300 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00448001  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2188  LysR family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 300 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.540994  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1366  LysR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 303 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4167  LysR substrate-binding protein  29.43 
 
 		 295 aa  89  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.767565  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1796  transcriptional regulator, LysR family  31.76 
 
 		 308 aa  88.6  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1384  LysR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 303 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.510026  normal  0.961764 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  27.2 
 
 		 301 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 301 aa  88.2  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 301 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  27.2 
 
 		 301 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  27.2 
 
 		 301 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  27.2 
 
 		 301 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2178  transcriptional regulator, LysR family  28.72 
 
 		 305 aa  87.8  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2123  transcriptional regulator, LysR family  26.3 
 
 		 305 aa  87.8  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000012035 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1012  LysR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 305 aa  88.2  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0144903  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2782  transcriptional regulator, LysR family  31.76 
 
 		 294 aa  87.4  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4421  LysR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 304 aa  87.4  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.655491  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  27.2 
 
 		 301 aa  87  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  26.04 
 
 		 300 aa  87  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2363  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 304 aa  87  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0704968  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 302 aa  86.3  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2038  transcriptional regulator, LysR family  28.37 
 
 		 305 aa  86.3  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>