More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6763 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6763  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 303 aa  604  9.999999999999999e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5552  putative transcriptional regulator protein, LysR family  68.67 
 
 		 303 aa  419  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2292  transcriptional regulator, LysR family  35.53 
 
 		 315 aa  175  8e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.863525  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 301 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  39.04 
 
 		 312 aa  159  6e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  36.3 
 
 		 315 aa  158  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1104  transcriptional regulator, LysR family  37.75 
 
 		 298 aa  158  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5125  LysR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 296 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932924  normal  0.723753 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0569  transcriptional regulator, LysR family  37.73 
 
 		 324 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 288 aa  154  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3118  transcriptional regulator, LysR family  34.78 
 
 		 309 aa  152  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181053  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4424  LysR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 292 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2225  transcriptional regulator, LysR family  35.39 
 
 		 302 aa  150  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00118451  normal  0.339624 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3489  LysR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 323 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3552  LysR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 323 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3502  LysR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 323 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4400  transcriptional regulator, LysR family  37.82 
 
 		 301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103907  hitchhiker  0.00279425 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2567  LysR family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 338 aa  140  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259086  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  34.77 
 
 		 316 aa  139  7e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2134  transcriptional regulator, LysR family  36.11 
 
 		 287 aa  138  8.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1507  transcriptional regulator, LysR family  34.51 
 
 		 288 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.74974  normal  0.352143 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 305 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2098  LysR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 312 aa  136  4e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0305237  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3940  transcriptional regulator, LysR family  33.44 
 
 		 310 aa  136  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3338  transcriptional regulator, LysR family  30.98 
 
 		 312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  33.86 
 
 		 327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  37.45 
 
 		 301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2018  LysR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1796  transcriptional regulator, LysR family  32.57 
 
 		 308 aa  133  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2031  transcriptional regulator, LysR family  32.35 
 
 		 333 aa  133  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205829  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0540  transcriptional regulator, LysR family  33.69 
 
 		 291 aa  133  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15621  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6522  transcriptional regulator, LysR family  34.11 
 
 		 300 aa  133  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4632  transcriptional regulator, LysR family  32.55 
 
 		 295 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6287  transcriptional regulator, LysR family  34.03 
 
 		 304 aa  132  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  33.77 
 
 		 327 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1625  transcriptional regulator, LysR family  32.67 
 
 		 298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7124  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 288 aa  129  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.281926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2340  transcriptional regulator, LysR family  29.73 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  0.887111 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4076  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 331 aa  127  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5881  transcriptional regulator, LysR family  34.12 
 
 		 304 aa  126  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4824  transcriptional regulator, LysR family  34.12 
 
 		 308 aa  126  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00015803  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0267  LysR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 300 aa  125  7e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.334674  normal  0.614052 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  32.84 
 
 		 301 aa  125  7e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1853  transcriptional regulator, LysR family  37.87 
 
 		 350 aa  125  8.000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54026 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  28.99 
 
 		 302 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2097  LysR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.732708  normal  0.0491263 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2187  LysR substrate-binding protein  34.19 
 
 		 309 aa  123  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36460  transcriptional regulator  35.25 
 
 		 304 aa  123  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.776376  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0242  LysR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 312 aa  123  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6247  transcriptional regulator, LysR family  31.6 
 
 		 328 aa  122  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3999  transcriptional regulator, LysR family  33.55 
 
 		 311 aa  122  6e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2822  transcriptional regulator, LysR family  31.45 
 
 		 310 aa  122  9e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.438739  normal  0.714096 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44500  Transcriptinal regulator, LysR family  32.08 
 
 		 301 aa  122  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.581761  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1422  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 308 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00195938  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1321  transcriptional regulator, LysR family  35.5 
 
 		 308 aa  121  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  0.107974 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2545  transcriptional regulator, LysR family  32.58 
 
 		 309 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.794961 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2508  LysR substrate-binding protein  35.43 
 
 		 316 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6150  LysR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 295 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0301422 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19590  transcriptional regulator  32.45 
 
 		 311 aa  119  7.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.221792  normal  0.0758544 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2254  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0914  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 301 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2386  transcriptional regulator, LysR family  33.66 
 
 		 309 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00159604  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4546  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 300 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2888  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 299 aa  116  6e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  28.31 
 
 		 300 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0716  transcriptional regulator, LysR family  33.11 
 
 		 308 aa  115  7.999999999999999e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.711839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3454  LysR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 298 aa  115  8.999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0043  transcriptional regulator, LysR family  31.02 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4368  LysR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000508648  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3497  transcriptional regulator, LysR family  35.11 
 
 		 307 aa  113  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137062 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2554  transcriptional regulator, LysR family  33.12 
 
 		 309 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0664958  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9290  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 311 aa  112  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5656  LysR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 305 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601684 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2782  transcriptional regulator, LysR family  32.65 
 
 		 294 aa  112  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4403  LysR substrate-binding protein  32.68 
 
 		 303 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.900242  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3720  LysR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.101076  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4648  LysR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1666  transcriptional regulator, LysR family  32.53 
 
 		 302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.883412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2648  transcriptional regulator, LysR family  32.42 
 
 		 306 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 296 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0807  transcriptional regulator, LysR family  31.07 
 
 		 304 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1423  LysR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 339 aa  109  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.174338  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3856  transcriptional regulator, LysR family  33.71 
 
 		 313 aa  109  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00162069  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2446  transcriptional regulator, LysR family  34.49 
 
 		 308 aa  108  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5452  transcriptional regulator, LysR family  31.23 
 
 		 297 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 323 aa  108  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0655  transcriptional regulator, LysR family  29.59 
 
 		 311 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0383  transcriptional regulator, LysR family  29.5 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715241  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7868  transcriptional regulator, LysR family  33.06 
 
 		 296 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.365024 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2442  LysR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 299 aa  107  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02220  transcriptional regulator  31.45 
 
 		 304 aa  107  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00330  transcriptional regulator  29.64 
 
 		 304 aa  107  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.531846 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3723  LysR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 322 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  hitchhiker  0.00150053 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7143  transcriptional regulator, LysR family  30.1 
 
 		 295 aa  106  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.297032  normal  0.653171 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1120  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 298 aa  106  5e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.359729  normal  0.248441 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0450  LysR substrate-binding protein  34.12 
 
 		 310 aa  105  6e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6871  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 283 aa  105  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3007  LysR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 308 aa  105  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5689  transcriptional regulator, LysR family  33.07 
 
 		 314 aa  105  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1897  transcriptional regulator, LysR family  29.12 
 
 		 299 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0474391 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>