More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4424 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4424  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 292 aa  574  1.0000000000000001e-163  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0540  transcriptional regulator, LysR family  42.12 
 
 		 291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15621  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1422  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 308 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00195938  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1423  LysR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 339 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.174338  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5552  putative transcriptional regulator protein, LysR family  38.38 
 
 		 303 aa  156  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 305 aa  156  4e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2545  transcriptional regulator, LysR family  36.68 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.794961 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4824  transcriptional regulator, LysR family  38.57 
 
 		 308 aa  152  7e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00015803  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3497  transcriptional regulator, LysR family  39.39 
 
 		 307 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137062 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6763  transcriptional regulator, LysR family  36.93 
 
 		 303 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4076  transcriptional regulator, LysR family  39.8 
 
 		 331 aa  150  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  39.76 
 
 		 327 aa  149  5e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  35.93 
 
 		 312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  37.15 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19590  transcriptional regulator  38.55 
 
 		 311 aa  142  7e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.221792  normal  0.0758544 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3401  LysR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 309 aa  142  8e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185395  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4100  transcriptional regulator, LysR family  37.46 
 
 		 319 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  0.0246683 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2544  transcriptional regulator, LysR family  38.72 
 
 		 300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0984343  normal  0.803064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5125  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 296 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932924  normal  0.723753 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2134  transcriptional regulator, LysR family  38.89 
 
 		 287 aa  139  7e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  35.33 
 
 		 315 aa  138  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6247  transcriptional regulator, LysR family  39.09 
 
 		 328 aa  136  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2648  transcriptional regulator, LysR family  39.46 
 
 		 306 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4270  transcriptional regulator, LysR family  36.6 
 
 		 321 aa  135  8e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0190021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6024  transcriptional regulator, LysR family  35.12 
 
 		 298 aa  135  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0569  transcriptional regulator, LysR family  37.7 
 
 		 324 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2508  LysR substrate-binding protein  38.55 
 
 		 316 aa  134  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1104  transcriptional regulator, LysR family  37.16 
 
 		 298 aa  134  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2567  LysR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259086  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  37.64 
 
 		 316 aa  132  6e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 301 aa  130  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0914  transcriptional regulator, LysR family  40.6 
 
 		 301 aa  129  8.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7065  transcriptional regulator, LysR family  39.46 
 
 		 294 aa  129  8.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2031  transcriptional regulator, LysR family  34.63 
 
 		 333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205829  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2097  LysR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.732708  normal  0.0491263 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2386  transcriptional regulator, LysR family  40.71 
 
 		 309 aa  126  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00159604  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1625  transcriptional regulator, LysR family  34.82 
 
 		 298 aa  125  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22480  transcriptional regulator  37.12 
 
 		 308 aa  125  7e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.542371 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1321  transcriptional regulator, LysR family  34.88 
 
 		 308 aa  125  9e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  0.107974 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4400  transcriptional regulator, LysR family  38.1 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103907  hitchhiker  0.00279425 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6522  transcriptional regulator, LysR family  37.25 
 
 		 300 aa  123  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 288 aa  123  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4546  LysR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 300 aa  123  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2098  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 312 aa  122  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0305237  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34330  transcriptional regulator  37.74 
 
 		 308 aa  122  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5881  transcriptional regulator, LysR family  36.95 
 
 		 304 aa  122  8e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0267  LysR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 300 aa  122  9e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.334674  normal  0.614052 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0716  transcriptional regulator, LysR family  38.71 
 
 		 308 aa  122  9e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.711839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3489  LysR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 323 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3552  LysR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 323 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3502  LysR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 323 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2225  transcriptional regulator, LysR family  37.07 
 
 		 302 aa  119  6e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00118451  normal  0.339624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2582  LysR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 313 aa  119  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2340  transcriptional regulator, LysR family  30.61 
 
 		 302 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  0.887111 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2292  transcriptional regulator, LysR family  36.1 
 
 		 315 aa  116  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.863525  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2254  LysR family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 314 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3999  transcriptional regulator, LysR family  37.19 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2446  transcriptional regulator, LysR family  36.64 
 
 		 308 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2872  transcriptional regulator, LysR family  33.69 
 
 		 302 aa  113  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02220  transcriptional regulator  35.08 
 
 		 304 aa  112  7.000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0582  transcriptional regulator, LysR family  33.56 
 
 		 312 aa  112  9e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9290  LysR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 311 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  33.88 
 
 		 327 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2782  transcriptional regulator, LysR family  36.69 
 
 		 294 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2018  LysR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 304 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3118  transcriptional regulator, LysR family  34 
 
 		 309 aa  109  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181053  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6287  transcriptional regulator, LysR family  33.73 
 
 		 304 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3940  transcriptional regulator, LysR family  36.19 
 
 		 310 aa  109  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4368  LysR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 300 aa  109  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000508648  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0303  LysR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 307 aa  108  9.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36460  transcriptional regulator  36.4 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.776376  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5689  transcriptional regulator, LysR family  33.58 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3713  LysR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 334 aa  106  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3338  transcriptional regulator, LysR family  32.48 
 
 		 312 aa  106  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0208  transcriptional regulator, LysR family  33.78 
 
 		 301 aa  105  7e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1507  transcriptional regulator, LysR family  34.27 
 
 		 288 aa  105  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.74974  normal  0.352143 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2897  transcriptional regulator, LysR family  34.47 
 
 		 298 aa  104  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00606116  hitchhiker  0.00007682 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  30.24 
 
 		 302 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3675  transcriptional regulator, LysR family  33.47 
 
 		 303 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2616  transcriptional regulator, LysR family  33.1 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000734486  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3886  LysR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7868  transcriptional regulator, LysR family  36.48 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.365024 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4632  transcriptional regulator, LysR family  35.48 
 
 		 295 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1853  transcriptional regulator, LysR family  34.58 
 
 		 350 aa  103  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54026 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6150  LysR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 295 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0301422 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0807  transcriptional regulator, LysR family  31.77 
 
 		 304 aa  103  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0838  LysR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 304 aa  102  8e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00258172  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44500  Transcriptinal regulator, LysR family  33.2 
 
 		 301 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.581761  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3856  transcriptional regulator, LysR family  34.7 
 
 		 313 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00162069  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  29.03 
 
 		 300 aa  99.4  7e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3441  transcriptional regulator, LysR family  30.86 
 
 		 297 aa  99  9e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2363  LysR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 304 aa  99  9e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0704968  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2123  transcriptional regulator, LysR family  30.9 
 
 		 305 aa  98.6  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000012035 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1193  transcriptional regulator, LysR family  33.21 
 
 		 347 aa  98.6  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073439 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3806  LysR family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 307 aa  97.4  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4552  LysR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 307 aa  97.1  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0655  transcriptional regulator, LysR family  30.15 
 
 		 311 aa  96.7  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3380  transcriptional regulator, LysR family  32.28 
 
 		 299 aa  96.3  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213081  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4073  transcriptional regulator, LysR family  36.09 
 
 		 313 aa  96.7  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.127902  normal  0.817309 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0553  transcriptional regulator, LysR family  29.35 
 
 		 293 aa  95.9  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>